مرتب سازی پالایش جستجو![]()
بررسی تاثیر حضور هلیکوباکترپیلوری بر میزان بیان RNA های طویل غیر کد کننده،HOXc_AS2 و DNAJC9_AS1 در سرطان معده (1402) / حیدریان فر ، پرند، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه حیدریان فر ، پرند، نویسنده شماره بازیابی : BIO microb 44 1402 عنوان : بررسی تاثیر حضور هلیکوباکترپیلوری بر میزان بیان RNA های طویل غیر کد کننده،HOXc_AS2 و DNAJC9_AS1 در سرطان معده عنوان موازی : Investigating the effect of the presence of Helicobacterpylori on the expression of HOXC-AS2 and DNAJC9-AS1 lncRNAs in the gastric cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 120ص شابک/شاپا 25062 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولو¬ژی¬گرایش¬میکروب¬های¬ بیماری زا شناسه افزوده : آزاده ، منصوره، استاد راهنما توصیفگرها هلیکوباکترپیلوری ،سرطان معده،lncRNA، ¬HOXc-AS2 وDNAjc9-AS1. Helicobacter pylori, gastric cancer, lncRNA,HOXc-AS2 and DNAjc9-AS1. چکیده : هلیکوباکترپیلوری ، یک باکتری گرم منفی و میکروآئروفیل است که در مخاط معده ساکن است و توسط وارن و مارشال در سال 1983 کشف شد. یک بررسی اپیدمیولوژیک نشان می دهد که میزان عفونت هلیکوباکترپیلوری در سراسر جهان از 50٪ فراتر رفته است. کلونیزاسیون با این پاتوژن موجب اختلالات متعدد دستگاه گوارش، مانند گاستریت، بیماری زخم معده، سرطان معده و لنفوم بافت لنفاوی مرتبط با مخاط (MALT) می¬شود. این باکتری به عنوان یک انکوژن (سرطان زا) کلاس یک طبقه بندی می¬شود؛ زیرا که قوی ترین عامل شناخته شده برای سرطان معده می¬باشد. آدنوکارسینوم معده (GC) مهمترین سرطان مرتبط با عفونت می¬باشد. سرطان معده پنجمین سرطان شایع و سومین علت شایع مرگ و میر ناشی از سرطان در جهان است. با توجه به فقدان روش های غربالگری و تشخیصی مناسب در هنگام مراجعه، سرطان اغلب به مرحله پیشرفته رسیده است. تشخیص زودهنگام سرطان می تواند مرگ و میر ناشی از سرطان را به میزان قابل توجهی کاهش دهد. بنابراین، تلاش زیادی برای کشف نشانگرهای زیستی جهت تشخیص زودهنگام سرطان معده می¬شود.lncRNA ها میتوانند به نشانگرهای زیستی مؤثری برای پیشآگهی و درمان سرطان تبدیل شوند چرا که،lncRNA بر تکثیر سلولی، آپوپتوز، تمایز و متابولیسم، تومورزایی نقش دارد. در این پژوهش 20 نمونه بافت توموری و 20 نمونه از بافت جوار تومور به عنوان کنترل از مبتلایان به GC مورد بررسی قرار گرفت. در اولین مرحله جهت جداسازی افراد آلوده به پس از استخراج DNA باکتری، تشخیص نهایی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن 16srRNA مربوط به و با تکنیک Real Time PCR انجام شد، و سپس تست سریع اوره¬آز نیز انجام گرفت. در ادامه جهت ارزیابی بیان HOXc-AS2 وDNAjc9-AS1،ابتدا با استفاده از ترایزول، Total RNA نمونه¬های بافت استخراج گردید و سپس از RNA استخراج شده سنتز cDNA صورت گرفت، در نهایت تغییرات بیان ژن های،HOXc-AS2 وDNAjc9-AS1 در نمونه¬های بافت با استفاده از پرایمرهای طراحی شده به صورت اختصاصی و تکنیک Real-Time PCR سنجیده شد.
نتایج فرآیند نشان می¬دهد بیان lncRNA هایHOXc-AS2 وDNAjc9-AS1 در نمونه های سرطانی به نسبت نمونه های سالم، در جامعه مورد مطالعه دارای افزایش معنادار بوده¬ اما در بررسی نمونه های سرطانی آلوده به هلیکوباکترپیلوری به نسبت نمونه های سرطانی فاقد آلودگی تغییر بیان محسوسی مشاهده نشده است. در نهایت نتیجه گرفتیم که lncRNA هایHOXc-AS2 وDNAjc9-AS1 را می¬توان به عنوان یک بیومارکر سودمند به جهت تشخیص بیماری سرطان معده بوده اما برای تشخیص عفونت هلیکوباکترپیلوری بیومارکر مناسبی نمی¬باشد و نیاز به بررسی های بیشتردر این زمینه می¬باشدلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14071 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 25062 BIO microb 44 1402 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت ![]()
بررسی تغییرات بیان ژن کد کننده ی پروتئین BIRC5 و RNA طویل غیر کد کننده ی LINC01012 در نمونه های سرطان روده ی بزرگ (1403) / افضلی ، مریم، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه افضلی ، مریم، نویسنده شماره بازیابی : BIO gen 69 1403 عنوان : بررسی تغییرات بیان ژن کد کننده ی پروتئین BIRC5 و RNA طویل غیر کد کننده ی LINC01012 در نمونه های سرطان روده ی بزرگ عنوان موازی : Evaluation of the expression level of BIRC5 and long non-coding RNA LINC01012 in the colorectal cancer samples ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 72ص شابک/شاپا 25808 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته ژنتیک شناسه افزوده : صادقیان ، طاهره، استاد راهنما آزاده ، منصوره، استاد راهنما توصیفگرها BIRC5، LINC01012، سرطان روده ی بزرگ، long non-coding RNA، بیومارکر : BIRC5, LINC01012, colorectal cancer, long non-coding RNA, biomarker چکیده : سرطان روده بزرگ دومین سرطان شایع در زنان و سومین سرطان شایع در مردان است و به عنوان چهارمین علت مرگ ناشی از سرطان در سراسر جهان شناخته میشود. شناسایی بیومارکر های تشخیصی این بیماری، یکی از مهم ترین استراتژی ها در تشخیص زودهنگام و کمک به شناخت مکانیسم های توسعه ی سرطان روده ی بزرگ می باشد. در این مطالعه، تغییرات بیان ژن کد کننده ی پروتئین BIRC5 و RNA طویل غیر کد کننده ی LINC01012 در نمونه های سرطان روده ی بزرگ مورد بررسی قرار میگیرد. این دو RNA به عنوان دو بیومارکر تشخیصی بالقوه در نمونه های سرطان روده ی بزرگ شناسایی شده اند. در ابتدا تغییرات بیان ژن BIRC5 و LINC01012 توسط آنالیز داده های microarray با استفاده از زبان برنامه نویسی R و آنالیز داده های RNAseq توسط پایگاه داده ی ENCORI انجام شد. بررسی برهم کنش mRNA BIRC5 و RNA طویل غیر کد کننده ی LINC01012 توسط پایگاه داده ی lncRRIsearch صورت گرفت. پس از جمع آوری 20 نمونه ی سرطان روده ی بزرگ و 20 نمونه ی بافت جوار به عنوان نمونه ی کنترل، استخراج RNA و سنتز cDNA انجام شد و پس از طراحی پرایمر های اختصاصی برای هر دو ژن، آزمایش qRT-PCR به منظور بررسی تغییرات بیان این دو ژن در نمونه های بافت سرطان روده ی بزرگ صورت گرفت. آنالیز های بیوانفورماتیک انجام شده نشان دهنده ی برهم کنش فیزیکی BIRC5 و LINC01012 با یکدیگر بود. از طرفی، بر اساس آنالیز های بیوانفورماتیک، بیان این دو ژن در نمونه های سرطان روده ی بزرگ دارای افزایش معنادار می باشد. آزمایش qRT-PCR انجام شده نیز افزایش بیان این دو RNA در نمونه های سرطان روده ی بزرگ را تایید کرد. تست آماری ROC نشان دهنده ی پتانسیل بیومارکری هر دو RNA برای تشخیص نمونه های سالم از بیمار می باشد. از طرفی، بیان این دو RNA دارای همبستگی مثبت و معنادار در نمونه های سرطان روده ی بزرگ می باشد. بدین طریق می توان نتیجه گرفت که LINC01012 می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی قابل قبول برای نمونه های سرطان روده ی بزرگ معرفی شود، و از طریق بر هم کنش فیزیکی با BIRC5 می تواند بیان این ژن را نیز در سطح پس از رونویسی تنظیم کند و منجر به افزایش بیان این ژن شود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14644 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 25808 BIO gen 69 1403 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت ![]()
بررسی همبستگی و تغییرات بیان ژن کد کننده ی پروتئینPRR5L و RNA طویل غیرکد کننده ی A2M-AS1 در بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس (1402) / محمدی ، شقایق، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه محمدی ، شقایق، نویسنده شماره بازیابی : BIO gen 53 1402 عنوان : بررسی همبستگی و تغییرات بیان ژن کد کننده ی پروتئینPRR5L و RNA طویل غیرکد کننده ی A2M-AS1 در بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس عنوان موازی : Investigation of the correlation and expression changes of PRR5L protein coding gene and A2M-AS1 non-coding long RNA in patients with multiple sclerosis ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 105ص شابک/شاپا 25510 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته ژنتیک شناسه افزوده : آزاده ، منصوره، استاد راهنما صادقیان ، طاهره، استاد راهنما توصیفگرها مالتیپل اسکلروزیس، تغییرات بیان ژن، PRR5L ،A2M-AS1، بیومارکر Multiple sclerosis, gene expression changes, PRR5L, A2M-AS1, biomarker چکیده : مقدمه: بیماری مولتیپل اسکلروزیس(MS) یکی از سه بیماری شاخص نورودژنراتیو در سراسر جهان است. بررسی وضعیت پروفایل بیان ژنی در شناخت و پیشگیری این بیماری نقش بسیار مهمی دارد. با نظر به توانایی ذاتی بیومارکرها جهت تشخیص و پیش آگهی در بروز یک بیماری، با هدف ژن درمانی و تغییر بیان ژن میتوان به درمان آن کمک نمود. در این مطالعه با بررسی برهم کنش و بیان ژن های کد کننده و غیر کد کننده ی پروتئین در بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس با بهره گیری از آنالیزهای بیوانفورماتیک و پژوهشات آزمایشگاهی، جهت یافتن الگوی بیان ژن و برهم کنش بیومارکر های بالقوه ی این بیماری برای یافتن اهداف درمانی مناسب، تلاش گردید.
مواد و روشها: ابتدا با استفاده از آنالیز دیتاهای مایکرواری (Microarray) پایگاه داده GEO، وضعیت بیان ژن کدکننده پروتئینPRR5L و RNA طویل غیر کد کننده ی A2M-AS1 در بیماران مبتلا به MS بررسی گردیدپس از جمع آوری نمونه، کل RNA استخراج شده با استفاده از کیت استخراج RNA از 20 نمونه بیمار و 20 نمونه ی سالم، با کیت سنتز، به cDNA سنتز شدند. در ادامه برای هرکدام از ژن های PRR5L و A2M-AS1، دو جفت پرایمر forward و reverse طراحی گردید تا در نهایت با تکنیکReal Time-PCR میزان بیان هردو ژن در نمونه های بیمار و سالم اندازه گیری شده و با یکدیگر مقایسه گردیدند.
یافته ها: بر اساس آنالیز های بیوانفورماتیک و آزمایشگاهی انجام شده، بیان هر دو ژن PRR5L و A2M-AS1 در نمونه های MS دارای کاهش بیان معنادار نسبت به نمونه های سالم می باشد. همچنین، بر اساس آنالیز ROC انجام شده، ژن کد کننده ی پروتئین PRR5L می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی خوب و lncRNA A2M-AS1 می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی قابل قبول برای تشخیص نمونه های MS از نمونه های سالم معرفی شود. همچنین، بر اساس آنالیز همبستگی، سطح بیان ژن کد کننده ی پروتئین PRR5L دارای همبستگی بیانی مثبت با سطح بیان A2M-AS1 در نمونه های MS می باشدلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14347 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 25510 BIO gen 53 1402 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت ![]()
سنجش بیان ژن کد کننده پروتئین KIFC1 و LncRNA LINC 01484 در سرطان معده (1403) / عبدالهی ، زهرتالزهرا، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه عبدالهی ، زهرتالزهرا، نویسنده شماره بازیابی : BIO gen 76 1403 عنوان : سنجش بیان ژن کد کننده پروتئین KIFC1 و LncRNA LINC 01484 در سرطان معده عنوان موازی : Evaluation of expression of KIFC1 protein coding gene and LncRNA LINC 01484 in gastric cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 102ص شابک/شاپا 25815 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته ژنتیک شناسه افزوده : صادقیان ، طاهره، استاد راهنما آزاده ، منصوره، استاد راهنما توصیفگرها ژن، RNA غیرکدکننده پروتئین، سرطان معده، ژن KIFCI Gene, non-protein coding RNA, gastric cancer, KIFCI gene چکیده : سرطان این روزها افراد زیادی را درگیر کرده و در صورت عدم تشخیص به موقع و ایجاد رویکرد درمانی صحیح موجب تبعات بسیار ناگواری خواهد شد. سرطان معده نیز از شایع ترین سرطان ها در سراسر جهان بوده و تشخیص به موقع و درمان در این بیماری از اهمیت بسیار زیادی برخوردار است . RNA های غیر کد کننده طویل (LncRNA) امروزه بهعنوان عوامل مهم در خصوص نقش ژنتیکی و اپی ژنتیک شناساییشدهاند که حضورشان در مایعات و بافت های بدن آنها را برای بررسیهای بیشتر در خصوص فعالیتهای احتمالی و نقش در بیماریزایی، یا فاکتورهای تشخیصی مورد توجه قرارداده است. در این پژوهش نقش احتمالی و سنجش بیان ژن کدکننده پروتئین KIFC1 و RNA طولانی غیرکد کننده LINC01484 با توجه به آنالیزهای میکرواری در خصوص بررسی و نقش مؤثر میزان بیان آن در بیماری سرطان معده برای بررسی انتخاب شده و در بیماران و افراد سالم آنالیز گردید. 24 بافت تومور و بافت سالم به عنوان کنترل صورت گرفت. تکنیک qRT PCR برای بررسی و مقایسه میزان بیان ژن های هدف مورد استفاده قرار گرفت. نتایج به دست آمده در آنالیز های میکرواری نشان دهنده افزایش بیان ژن KIFC1 و LINC01484 در بیماران مبتلا به سرطان معده در مقایسه با بافت سالم بود. در بررسیهای آزمایشگاهی پژوهش حاضر نیز همین نتیجه مشاهدهشد (افزایش بیان 519/4 برابری ژن KIFC1 با p-value 0.0001 و افزایش بیان 399/2 برابری LINC01484 با p-value 0.0168) و نقش بالقوه ژن KIFC1 و LINC01484بهعنوان بیومارکر در بیماری سرطان معده تائید گردید (سطح زیر نمودار 90% با p-value 0.0001 برای KIFC1 و سطح زیر نمودار 70% با p-value 0.0161 برای LINC01484). این نتایج می تواند در شناسایی مسیرهای دخیل در پاتولوژی، تشخیص و توسعه ی اهداف درمانی در سرطان سینه موثر واقع شود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14651 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 25815 BIO gen 76 1403 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت
