![]()
بررسی تاثیر حضور هلیکوباکترپیلوری بر میزان بیان RNA های طویل غیر کد کننده،HOXc_AS2 و DNAJC9_AS1 در سرطان معده (1402) / حیدریان فر ، پرند، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه حیدریان فر ، پرند، نویسنده شماره بازیابی : BIO microb 44 1402 عنوان : بررسی تاثیر حضور هلیکوباکترپیلوری بر میزان بیان RNA های طویل غیر کد کننده،HOXc_AS2 و DNAJC9_AS1 در سرطان معده عنوان موازی : Investigating the effect of the presence of Helicobacterpylori on the expression of HOXC-AS2 and DNAJC9-AS1 lncRNAs in the gastric cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 120ص شابک/شاپا 25062 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولو¬ژی¬گرایش¬میکروب¬های¬ بیماری زا شناسه افزوده : آزاده ، منصوره، استاد راهنما توصیفگرها هلیکوباکترپیلوری ،سرطان معده،lncRNA، ¬HOXc-AS2 وDNAjc9-AS1. Helicobacter pylori, gastric cancer, lncRNA,HOXc-AS2 and DNAjc9-AS1. چکیده : هلیکوباکترپیلوری ، یک باکتری گرم منفی و میکروآئروفیل است که در مخاط معده ساکن است و توسط وارن و مارشال در سال 1983 کشف شد. یک بررسی اپیدمیولوژیک نشان می دهد که میزان عفونت هلیکوباکترپیلوری در سراسر جهان از 50٪ فراتر رفته است. کلونیزاسیون با این پاتوژن موجب اختلالات متعدد دستگاه گوارش، مانند گاستریت، بیماری زخم معده، سرطان معده و لنفوم بافت لنفاوی مرتبط با مخاط (MALT) می¬شود. این باکتری به عنوان یک انکوژن (سرطان زا) کلاس یک طبقه بندی می¬شود؛ زیرا که قوی ترین عامل شناخته شده برای سرطان معده می¬باشد. آدنوکارسینوم معده (GC) مهمترین سرطان مرتبط با عفونت می¬باشد. سرطان معده پنجمین سرطان شایع و سومین علت شایع مرگ و میر ناشی از سرطان در جهان است. با توجه به فقدان روش های غربالگری و تشخیصی مناسب در هنگام مراجعه، سرطان اغلب به مرحله پیشرفته رسیده است. تشخیص زودهنگام سرطان می تواند مرگ و میر ناشی از سرطان را به میزان قابل توجهی کاهش دهد. بنابراین، تلاش زیادی برای کشف نشانگرهای زیستی جهت تشخیص زودهنگام سرطان معده می¬شود.lncRNA ها میتوانند به نشانگرهای زیستی مؤثری برای پیشآگهی و درمان سرطان تبدیل شوند چرا که،lncRNA بر تکثیر سلولی، آپوپتوز، تمایز و متابولیسم، تومورزایی نقش دارد. در این پژوهش 20 نمونه بافت توموری و 20 نمونه از بافت جوار تومور به عنوان کنترل از مبتلایان به GC مورد بررسی قرار گرفت. در اولین مرحله جهت جداسازی افراد آلوده به پس از استخراج DNA باکتری، تشخیص نهایی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن 16srRNA مربوط به و با تکنیک Real Time PCR انجام شد، و سپس تست سریع اوره¬آز نیز انجام گرفت. در ادامه جهت ارزیابی بیان HOXc-AS2 وDNAjc9-AS1،ابتدا با استفاده از ترایزول، Total RNA نمونه¬های بافت استخراج گردید و سپس از RNA استخراج شده سنتز cDNA صورت گرفت، در نهایت تغییرات بیان ژن های،HOXc-AS2 وDNAjc9-AS1 در نمونه¬های بافت با استفاده از پرایمرهای طراحی شده به صورت اختصاصی و تکنیک Real-Time PCR سنجیده شد.
نتایج فرآیند نشان می¬دهد بیان lncRNA هایHOXc-AS2 وDNAjc9-AS1 در نمونه های سرطانی به نسبت نمونه های سالم، در جامعه مورد مطالعه دارای افزایش معنادار بوده¬ اما در بررسی نمونه های سرطانی آلوده به هلیکوباکترپیلوری به نسبت نمونه های سرطانی فاقد آلودگی تغییر بیان محسوسی مشاهده نشده است. در نهایت نتیجه گرفتیم که lncRNA هایHOXc-AS2 وDNAjc9-AS1 را می¬توان به عنوان یک بیومارکر سودمند به جهت تشخیص بیماری سرطان معده بوده اما برای تشخیص عفونت هلیکوباکترپیلوری بیومارکر مناسبی نمی¬باشد و نیاز به بررسی های بیشتردر این زمینه می¬باشدلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14071 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 25062 BIO microb 44 1402 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت ![]()
بررسی همبستگی و تغییرات بیان ژن کد کننده ی پروتئینPRR5L و RNA طویل غیرکد کننده ی A2M-AS1 در بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس (1402) / محمدی ، شقایق، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه محمدی ، شقایق، نویسنده شماره بازیابی : BIO gen 53 1402 عنوان : بررسی همبستگی و تغییرات بیان ژن کد کننده ی پروتئینPRR5L و RNA طویل غیرکد کننده ی A2M-AS1 در بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس عنوان موازی : Investigation of the correlation and expression changes of PRR5L protein coding gene and A2M-AS1 non-coding long RNA in patients with multiple sclerosis ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 105ص شابک/شاپا 25510 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته ژنتیک شناسه افزوده : آزاده ، منصوره، استاد راهنما صادقیان ، طاهره، استاد راهنما توصیفگرها مالتیپل اسکلروزیس، تغییرات بیان ژن، PRR5L ،A2M-AS1، بیومارکر Multiple sclerosis, gene expression changes, PRR5L, A2M-AS1, biomarker چکیده : مقدمه: بیماری مولتیپل اسکلروزیس(MS) یکی از سه بیماری شاخص نورودژنراتیو در سراسر جهان است. بررسی وضعیت پروفایل بیان ژنی در شناخت و پیشگیری این بیماری نقش بسیار مهمی دارد. با نظر به توانایی ذاتی بیومارکرها جهت تشخیص و پیش آگهی در بروز یک بیماری، با هدف ژن درمانی و تغییر بیان ژن میتوان به درمان آن کمک نمود. در این مطالعه با بررسی برهم کنش و بیان ژن های کد کننده و غیر کد کننده ی پروتئین در بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس با بهره گیری از آنالیزهای بیوانفورماتیک و پژوهشات آزمایشگاهی، جهت یافتن الگوی بیان ژن و برهم کنش بیومارکر های بالقوه ی این بیماری برای یافتن اهداف درمانی مناسب، تلاش گردید.
مواد و روشها: ابتدا با استفاده از آنالیز دیتاهای مایکرواری (Microarray) پایگاه داده GEO، وضعیت بیان ژن کدکننده پروتئینPRR5L و RNA طویل غیر کد کننده ی A2M-AS1 در بیماران مبتلا به MS بررسی گردیدپس از جمع آوری نمونه، کل RNA استخراج شده با استفاده از کیت استخراج RNA از 20 نمونه بیمار و 20 نمونه ی سالم، با کیت سنتز، به cDNA سنتز شدند. در ادامه برای هرکدام از ژن های PRR5L و A2M-AS1، دو جفت پرایمر forward و reverse طراحی گردید تا در نهایت با تکنیکReal Time-PCR میزان بیان هردو ژن در نمونه های بیمار و سالم اندازه گیری شده و با یکدیگر مقایسه گردیدند.
یافته ها: بر اساس آنالیز های بیوانفورماتیک و آزمایشگاهی انجام شده، بیان هر دو ژن PRR5L و A2M-AS1 در نمونه های MS دارای کاهش بیان معنادار نسبت به نمونه های سالم می باشد. همچنین، بر اساس آنالیز ROC انجام شده، ژن کد کننده ی پروتئین PRR5L می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی خوب و lncRNA A2M-AS1 می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی قابل قبول برای تشخیص نمونه های MS از نمونه های سالم معرفی شود. همچنین، بر اساس آنالیز همبستگی، سطح بیان ژن کد کننده ی پروتئین PRR5L دارای همبستگی بیانی مثبت با سطح بیان A2M-AS1 در نمونه های MS می باشدلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14347 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 25510 BIO gen 53 1402 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت