| نوع مدرک: | متون چاپی |
| سرشناسه | علیمردانی ، زینب، نویسنده |
| رده‌بندی کنگره : | BIO gen |
| عنوان : | آنالیز بررسی تغییرات بیان RNAهای طویل غیرکدکننده‌ی LINC01605 و PLCE1-AS2 در نمونه‌های سرطان معده با استفاده از آنالیز‌های بیوانفورماتیک و آزمایش q-RTPCR |
| عنوان موازی : | Differential expression and correlation analysis of PLCE1-AS2 and LINC01605 long non-coding RNAs in gastric cancer sample |
| ناشر: | دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان |
| سال نشر : | 1402 |
| صفحه شمار: | 63ص |
| شابک/شاپا | 25316 |
| یادداشت | پایان نامه کارشناسی ارشد در رشته ژنتیک |
| شناسه افزوده : | آبکار ، مرتضی، نویسنده |
| توصیفگرها | بیوانفورماتیک، آنالیز بیومارکر، برهم کنش RNA، سرطان معده، LINC01605 PLCE1-AS. Bioinformatics, Biomarker analysis, RNA interaction, Gastric cancer, LINC01605, PLCE1-AS |
| چکیده : | سرطان معده یک بدخیمی بسیار تهاجمی و کشنده است. این سرطان پنجمین تومور شایع و سومین سرطان کشنده در سراسر جهان است. هر سال نزدیک به 1 میلیون مورد جدید سرطان معده (GC) گزارش می‌شود و حدود نیمی از آنها در چین رخ می‌دهد. مطالعات در دهه گذشته نشان داده که RNA طولانی غیر کدکننده (lncRNA) ها نقش مهمی در انواع بیماری‌ها از جمله سرطان ایفا می‌کنند. به عنوان مثال، lncRNA ها می‌توانند بر تکثیر سلولی، آپوپتوز، مهاجرت، تهاجم، چسبندگی و غیره در ایجاد بدخیمی تأثیر بگذارند. بیان نابجای lncRNA ها با سرطان معده مرتبط است. در این مطالعه، سطوح بیان LINC01605 های LncRNA و PLCE1-AS2 در بیماران GC با استفاده از آزمایش qPCR و ابزارهای بیوانفورماتیک ارزیابی شد. برای یافتن ژن‌های جدید دارای تغییرات بیان در بیماران GC، مجموعه داده ریزآرایه GSE95667 توسط نرم افزار R Studio آنالیز شد. برای تأیید نتایج حاصل از آنالیز ریزآرایه از پایگاه‌های داده آنلاین GEPIA2 و ENCORI استفاده شد. از ازمایش Real-time PCR برای ارزیابی تغییرات در سطح بیان RNA های انتخابی استفاده شد. در نهایت تجزیه و تحلیل‌های آماری داده‌ها توسط GraphPad Prism انجام شد. بر اساس تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه، مشخص شد که LINC01605 و PLCE1-AS2 در بیماران GC نسبت به نمونه‌های کنترل دارای بیان بیشتر است است. تجزیه و تحلیل داده‌های PCR qRT- نیز نشان داد که lncRNA PLCE1-AS2 و هم lncRNA LINC01605 در بیماران GC دارای افزایش بیان هستند. ارتباطی بین بیان ژن‌های ذکر شده با موقعیت‌های کلینیکوپاتولوژیک در نمونه‌های سرطان معده مشاهده نشد. بر اساس آنالیز Pearson میان سطح بیان LINC01605 و PLCE1-AS2 در نمونه‌های سرطان معده همبستگی مثبت معنادار قابل توجهی مشاهده می‌شود. این همبستگی بیانگر اثر احتمالی افزاینده بیان lncRNA های ذکر شده بر بیان یکدیگر است. این دو lncRNA می‌توانند بر سطح بیان یکدیگر تأثیر داشته باشند و در کل در تغییر خطر ابتلا به بیماری سرطان معده مؤثر باشند. در مجموع آنالیز ROC به ما نشان داد این دو lncRNA PLCE1-AS2 و LINC01605 به عنوان بیومارکر تشخیصی قابل قبول در تشخیص GC هستند |
| لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14260 |
| زبان مدرک : | فارسی |
آنالیز بررسی تغییرات بیان RNAهای طویل غیرکدکننده‌ی LINC01605 و PLCE1-AS2 در نمونه‌های سرطان معده با استفاده از آنالیز‌های بیوانفورماتیک و آزمایش q-RTPCR (1402) / علیمردانی ، زینب، نویسنده