| نوع مدرک: | متون چاپی |
| سرشناسه | اکبری ، فائزه، نویسنده |
| شماره بازیابی : | BIO gen 71 1403 |
| عنوان : | طراحی و ارزیابی ایمونوانفورماتیکی یک mRNA واکسن چند اپیتوپی علیه سویههای باکتریایی مولد مسمومیت غذایی شامل سالمونلا انتریکا، لیستریا مونوسیتوژنز و کمپیلوباکتر ژژونی |
| عنوان موازی : | Immunoinformatic design and evaluation of a multi-epitope vaccine mRNA against food poisoning bacterial strains including Salmonella enterica, Listeria monocytogenes, Campylobacter jejuni |
| ناشر: | دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان |
| سال نشر : | 1403 |
| صفحه شمار: | 250ص |
| شابک/شاپا | 25810 |
| یادداشت | پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته ژنتیک |
| شناسه افزوده : | نصرتی ، مختار، استاد راهنما صادقیان ، طاهره، استاد راهنما |
| توصیفگرها | مسمومیت غذایی، بیوانفورماتیک، mRNA واکسن چند اپیتوپی food poisoning, bioinformatics, multi-epitope vaccine mRNA |
| چکیده : | هدف تحقیق: مسمومیت غذایی، به طیف وسیعی از بیماریها اشاره دارد که ناشی از مصرف غذاهای آلوده است. عوامل بیماریزا شامل باکتریها، ویروسها، انگلها و تکیاختهها هستند. هدف پژوهش حاضر، طراحی بیوانفورماتیکی یک واکسن چند اپی توپی علیه سویههای باکتریایی مولد مسمومیت غذایی با کارایی بالاتر نسبت به واکسن های موجود، هزینه کمتر و تولید آسانتر است.
روش تحقیق: در این مطالعه، ابتدا آنتیژنهای هدف با استفاده از سرور VFDB شناسایی و سپس توالی پروتئین آنها برای نقشهبرداری اپیتوپهای خطی B و T با سرورهای IEDB و TepiTool استفاده شد. پس از غربالگری، بهترین اپیتوپها برای طراحی ساختار مرکزی واکسن انتخاب شدند. ساختار سهبعدی واکسن با سرور Swiss Model تولید و با The ReFOLD بهبود یافت. همچنین، ساختار سهبعدی اپیتوپهای فضایی B با Ellipro به دست آمد و خصوصیات فیزیکوشیمیایی با ProtParam و PepCalc بررسی شد. در ادامه، کارایی واکسن با سرور HDock ارزیابی و فعالیت آن در سیستم ایمنی با C-IMMSIM پیشبینی شد. در نهایت، توالی واکسن به DNA و سپس به mRNA تبدیل و ساختار دوبعدی mRNA با UTRdb ایجاد گردید.
یافتهها: نتایج مطالعه نشان داد که در مرحله اول، اپیتوپهای B و T با استفاده از آنتیژنهای خاص باکتریایی (phoQ، actA و cadF) شناسایی شدند. سپس با بهرهگیری از بهترین اپیتوپها و ادجوانت RS09، به همراه لینکرهای KK،GPGPG،EAAAKوAAY، ساختار نهایی واکسن طراحی گردید. این واکسن از نظر خصوصیات فیزیکوشیمیایی و خواص ایمونولوژیکی قابل قبول است و به دلیل غیرآلرژیزا بودن و عدم سمیت، عوارض جانبی برای میزبان ایجاد نمیکند. همچنین، واکسن پایدار و محلول بوده و دارای میل اتصال و پایداری خوبی با رسپتورهای MHC-I، MHC-II، TLR2 و TLR4-human است. تحلیلهای انجام شده نشان میدهد که واکسن میتواند پاسخ ایمنی هومورال و سلولی را ایجاد کند. بهویژه، جمعیت لنفوسیتهای B و تعداد لنفوسیتهای T-helper CD4 و T سیتوتوکسیک CD8 به خوبی تحت تأثیر واکسن قرار میگیرند. این ویژگیها نشان میدهد که این واکسن میتواند بهعنوان جایگزینی برای واکسنهای موجود مورد استفاده قرار گیرد بدون اینکه عوارض جانبی داشته باشد. در نهایت، با تبدیل توالی واکسن به توالی mRNA، ساختار دوبعدی mRNA با ΔG منفی به دست آمد که نشاندهنده پایداری و خودبهخود بودن واکنش است. با این حال، تأیید نهایی این نتایج نیازمند آزمایشات عملی و ایمونولوژیکی بیشتر است.
نتایج: بنابراین به نظر میرسد که ساختار تولید شده در این تحقیق میتواند به عنوان واکسن چند اپیتوپی علیه سویههای باکتریایی مولد مسمومیت غذایی در تحقیقات آینده مورد استفاده قرار گیرد |
| لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14646 |
| زبان مدرک : | فارسی |
طراحی و ارزیابی ایمونوانفورماتیکی یک mRNA واکسن چند اپیتوپی علیه سویههای باکتریایی مولد مسمومیت غذایی شامل سالمونلا انتریکا، لیستریا مونوسیتوژنز و کمپیلوباکتر ژژونی (1403) / اکبری ، فائزه، نویسنده