| نوع مدرک: | متون چاپی |
| سرشناسه | حسینی ، زهرا، نویسنده |
| شماره بازیابی : | BIO gen 73 1403 |
| عنوان : | طراحی و ارزیابی ایمنوانفورماتیکی یک DNA واکسن چند ظرفیتی علیه عفونت APMV1 در طیور |
| عنوان موازی : | Immunoinformatics design and evaluation of a multi-epitope vaccine against APMV1 infection poultry |
| ناشر: | دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان |
| سال نشر : | 1403 |
| صفحه شمار: | 93ص |
| شابک/شاپا | 25812 |
| یادداشت | پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته ژنتیک |
| شناسه افزوده : | صادقیان ، طاهره، استاد راهنما نصرتی ، مختار، استاد راهنما |
| توصیفگرها | ویروس نیوکاسل، واکسن DNA، چند اپی توپی، پروتئین Fusion, پروتئین HN Newcastle disease virus, DNA vaccine, multi-epitope, Fusion protein, HN protein. |
| چکیده : | مقدمه: بیماری نیوکاسل (ND) یکی از تهدیدات جدی برای صنعت پرورش طیور است که خسارات اقتصادی قابلتوجهی به همراه دارد. با توجه به ناکارآمدی برخی واکسنهای سنتی در برابر سویههای جدید، توسعه واکسنهای چنداپیتوپی میتواند رویکرد مؤثری در مقابله با این بیماری باشد. بیوانفورماتیک به عنوان یک ابزار قدرتمند در طراحی واکسنهای نوین، میتواند با استفاده از تحلیل دادههای ژنتیکی و پروتئینی به شناسایی اپیتوپهای مؤثر و طراحی واکسنهای هدفمند کمک کند. این روشها علاوه بر کاهش هزینهها و زمان تولید واکسن، دقت و اثربخشی واکسنها را افزایش میدهند.
روش کار: در این پژوهش، ابتدا اپیتوپهای ایمنیزای B و T پروتئینهای F و HN از طریق پایگاه داده IEDB شناسایی شدند. سپس این اپیتوپها بر اساس ایمنیزایی، آلرژنزایی و پایداری ساختاری با کمک نرمافزارهای VaxiJen، AllerTOP و Pepcalc ارزیابی شدند. قابلیت اتصال اپیتوپهای منتخب به مولکولهای MHC-I و MHC-II از طریق ابزار NetMHC بررسی شد. مدلسازی سهبعدی واکسن پیشنهادی با استفاده از Swiss-Model انجام شد. همچنین، برهمکنش واکسن با گیرندههای ایمنی توسط داکینگ مولکولی با ابزار آنلاین HDock انجام شد و سپس طراحی واکسن با کمک C-IMMSIM بهینهسازی گردید.
نتایج: 227 مورد از اپیتوپهای B و 386 مورد از اپیتوپهای T پروتئین F، 290 مورد از اپیتوپهای B و 381 مورد از اپیتوپهای T پروتئین HN پیشبینی گردید و 5 مورد از اپیتوپهای B و 8 مورد از اپیتوپهای T پروتئین F، 9 مورد از اپیتوپهای B و 5 مورد از اپیتوپهای T پروتئین HN پس از غربالگری انتخاب شدند. پس از شناسایی اپیتوپها، خصوصیت آنها از نظر آلرژنیسیته و آنتیژنیسیته و حلالیت بررسی شد. نتایج حاصل از تجزیهوتحلیل انرژی اتصال نشان داد که اپیتوپهای منتخب از پروتئینهای F و HN دارای تعاملات قوی و پایداری با مولکولهای MHC-I و MHC-II هستند. مقادیر انرژی اتصال در محدودهای قرار داشت که نشاندهنده میل ترکیبی بالای این اپیتوپها به مولکولهای ارائهدهنده آنتیژن است.
نتیجهگیری: بر اساس نتایج این تحقیق، یک واکسن DNA چنداپیتوپی مبتنی بر پروتئینهای F و HN برای مقابله با ویروس نیوکاسل طراحی شد. بررسیهای بیوانفورماتیکی نشان داد که این واکسن میتواند بهطور همزمان سیستم ایمنی هومورال و سلولی را تحریک کند. با توجه به نتایج حاصل، واکسن پیشنهادی پتانسیل بالایی برای پیشگیری از بیماری نیوکاسل در طیور دارد و میتواند در آینده مورد ارزیابیهای آزمایشگاهی و بالینی قرار گیرد |
| لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14648 |
| زبان مدرک : | فارسی |
طراحی و ارزیابی ایمنوانفورماتیکی یک DNA واکسن چند ظرفیتی علیه عفونت APMV1 در طیور (1403) / حسینی ، زهرا، نویسنده