| نوع مدرک: | متون چاپی |
| سرشناسه | شفیعی ، زهرا، نویسنده |
| شماره بازیابی : | BIO gen 81 1403 |
| عنوان : | غربالگری وشناسایی ترکیبات گیاهی مهارکننده ی پروتئینهای ERM (erythromycin ribosomal methylase) دخیل در ایجاد مقاومت دارویی باکتریهای موثر در پیشبرد عفونت زخمها |
| عنوان موازی : | Screening and identification of plant compounds that inhibit ERM proteins (erythromycin ribosomal methylase) involved in creating drug resistance of bacteria effective in promoting wound infection Supervisor |
| ناشر: | دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان |
| سال نشر : | 1403 |
| صفحه شمار: | 96ص |
| شابک/شاپا | 25941 |
| یادداشت | پایان نامه برای دریافت درجه کارشناسی ارشد (M.Sc.):
رشته ژنتیک |
| شناسه افزوده : | یاری ، نجف اله، استاد راهنما صادقیان ، طاهره، استاد راهنما |
| توصیفگرها | مقاومت آنتیبیوتیکی، عفونت زخم، گیاهان دارویی، داکینگ مولکولی، بیوانفورماتیک، ERM Antibiotic resistance, wound infection, medicinal plants, molecular docking, bioinformatics, ERM |
| چکیده : | مقدمه: عفونت زخم نیازمند درمان پزشکی است که معمولاً با آنتیبیوتیکها انجام میشود. آنتیبیوتیکهای گروه MLSB شامل ماکرولیدها، لینکوزامیدها و استرپتوگرامین B هستند که با مهار سنتز پروتئین باکتری از طریق اتصال به 23S rRNA عمل میکنند. استفاده مکرر از این آنتیبیوتیکها منجر به افزایش سوشهای مقاوم به آنها شده و درمان عفونتهای زخم را دشوار میکند. مکانیزم اصلی مقاومت تغییر سایت هدف ریبوزومی یا تغییر هدف اتصال دارو توسط آنزیم متیلاز است که توسط ژن ERM کدگذاری میشود. در این پژوهش، هدف مهار پروتئینهای ErmC با استفاده از روشهای بیوانفورماتیک و داکینگ مولکولی در باکتریهای Staphylococcus aureus و Streptococcus pyogenes است تا مقاومت آنتیبیوتیکی کاهش یابد و درمانهای پوستی مؤثرتر شوند.
روش: در این مطالعه 3403 ترکیب گیاهی برای انتخاب بالاترین میل اتصالی به پروتئین ERM مورد بررسی قرار گرفتند. از آنجایی که ساختار سه بعدی پروتئین ErmC موجود میباشد ساختار آن را از مقالات و پایگاه دادهی پروتئین به دست آمد و سپس ساختار آن و ترکیبات گیاهی را جهت مطالعات داکینگ مولکولی توسط نرم افزار Chimera آمادهسازی شدند. پس از تعیین ناحیهی اتصالی لیگاندها بر روی پروتئین، مطالعات داکینگ مولکولی توسط نرم افزار Autodock vina انجام شد. خصوصیات فیزیکی و شیمیایی 10 تا از ترکیبات منتخب مطالعات داکینگ با استفاده از وبسایتهای Way2drug، PASS Online و SwissADME پیشبینی شد و سپس بررسی شدند.
یافتهها و نتیجهگیری: پس از اتمام مطالعات داکینگ مولکولی، ترکیباتی که میل اتصالی بالایی با پروتئین ErmC داشتند وارد مطالعات ADMET شدند و ترکیبات انتخابی نهایی از لحاظ میل اتصالی با مهارکنندههای احتمالی و همچنین لیگاند اصلی پروتئین مورد مقایسه قرار گرفتند. Salvianolic acid C، Salvianolic acid A و BDBM319910 به عنوان بهترین ترکیبها با بالاترین میل اتصالی برای مهار پروتئین ما انتخاب شدند. بررسی ویژگیهای فیزیکی، شیمیایی و فارماکولوژیک از قبیل سمیت، حلالیت، گذرندگی از سد خونی-مغزی و سایر پارامترهای مهم در مطالعات ADMET نیز ارزیابی شدند و مشخص شد که ترکیب N-CAFFEOYLTRYPTOPHAN گزینه مناسبی جهت مهار پروتئین ErmC است |
| لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14777 |
| زبان مدرک : | فارسی |
غربالگری وشناسایی ترکیبات گیاهی مهارکننده ی پروتئینهای ERM (erythromycin ribosomal methylase) دخیل در ایجاد مقاومت دارویی باکتریهای موثر در پیشبرد عفونت زخمها (1403) / شفیعی ، زهرا، نویسنده