نوع مدرک: | متون چاپی |
سرشناسه | مختاری ، نسیم، نویسنده |
شماره بازیابی : | BIO gen 61 1402 |
عنوان : | بررسی تغییرات بیان RNAهای طویل غیرکد کننده¬ی MIR3142HGوSLC12A5-AS1در نمونه¬های سرطان روده بزرگ درمقایسه با نمونههای بافت جوار کنترل با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR |
عنوان موازی : | Expression change analysis of long non-coding RNAs MIR3142HG and SLC12A5-AS1 in the Colorectal cancer samples compared to adjacent control samples |
ناشر: | دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان |
سال نشر : | 1402 |
صفحه شمار: | 68ص |
شابک/شاپا | 25659 |
یادداشت | پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته سلولی و مولکولی گرایش ژنتیک |
شناسه افزوده : | آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور |
توصیفگرها | بیوانفورماتیک،SLC12A5-AS1، سرطان کولورکتال،MIR3142HG، .qRT-PCR Bioinformatics, SLC12A5-AS1, Colorectal Cancer, MIR3142HG,
Real time PCR. |
چکیده : | یکی از مهمترین انواع سرطانها بوده که به عنوان سومین بدخیمی شایع تشخیص داده شده و دومین علت شایع مرگ و میر ناشی از سرطان (بعد از سرطان ریه) در سراسر جهان CRC(سرطان روده بزرگ) است. به طوری که باعث ایجاد 9/1 میلیون مورد مرگ در سراسر جهان در سال 2020 شده است. سرطان کلورکتال یک بیماری ژنتیکی چند عاملی است که در اثر انواع فعل و انفعالات بین عوامل ارثی، سبک زندگی، اپی ژنتیکی و محیطی ایجاد میشود. یکی از روشهای عملی برای پیشگیری، مدیریت و کنترل بدخیمیهایی مانند سرطان، بررسی وضعیت پروفایل بیان ژن است. در این مطالعه، سطوح بیان RNAهای طویل غیرکد کننده¬ی MIR3142HGوSLC12A5-AS1در نمونه¬های سرطان روده بزرگ در بیماران CRC با استفاده از آزمایش qPCR و ابزارهای بیوانفورماتیک ارزیابی شد. برای یافتن ژنهای جدید دارای تغییرات بیان در بیماران CRC، مجموعه داده ریزآرایه GSE110715 توسط نرم افزار R Studio آنالیز شد. آنالیز برهم کنش lncRNA-mRNA با استفاده از پایگاه داده آنلاین ENCORI منجر به شناسایی lncRNAهای دارای برهم کنش با mRNA شد. برای تایید نتایج حاصل از آنالیز ریزآرایه از پایگاههای داده آنلاین GEPIA2 و ENCORI استفاده شد. از ازمایشReal-time PCR برای ارزیابی تغییرات در سطح بیان RNAهای انتخابی استفاده شد. بر اساس تجزیه و تحلیل دادههای ریزآرایه، مشخص شد که MIR3142HGوSLC12A5-AS1در بیماران CRC نسبت به نمونههای کنترل دارای بیان بیشتر است. تجزیه و تحلیل برهمکنش LncRNA-mRNA نشان داد که lnc RNA SLC12A5-AS1وMIR3142GH برهمکنش قابل توجهی با یکدیگردارند. تجزیه و تحلیل دادههای PCR qRT- نیز نشان داد که هر دوی lncRNA MIR3142HG و lncRNA SLC12A5A-S1 در بیماران CRC دارای افزایش بیان هستند. ضمن اینکه آنالیز ROC نشان داد که میتوان تاحدی از این دو LncRNA جهت تشخیص زودهنگام CRC استفاده کرد. در مجموع نتایج نشان داد که این دو lncRNA میتوانند بر بیان یکدیگر تاثیر مثبت بگذارند و به افزایش ریسک یا پیشرفت سرطان CRC کمک کنند |
لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14496 |
زبان مدرک : | فارسی |