نوع مدرک: | متون چاپی |
سرشناسه | تجویدی ، فاطمه، نویسنده |
شماره بازیابی : | BIO gen 56 1402 |
عنوان : | بررسی بیان متفاوت RNAهای طویل غیرکد کننده linc02288 و linc01285 در نمونههای سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR |
عنوان موازی : | Different Expression Evaluation of Long Non-Coding RNAs linc02288 and linc01285 in Gastric Cancer Samples Using Bioinformatics Analysis and qRT-PCR Test |
ناشر: | دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان |
سال نشر : | 1402 |
صفحه شمار: | 56ص |
شابک/شاپا | 25577 |
یادداشت | پایان نامه کارشناسی ارشد: گرایش ژنتیک |
شناسه افزوده : | آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور |
توصیفگرها | سرطان معده، lncRNA،LINC02288 ،LINC01285، qRT-PCR، بیوانفورماتیک Gastric cancer, LncRNA, LINC02288, LINC01285, qRT-PCR, Bioinformatics |
چکیده : | سرطان معده چهارمین رتبه را در مرگ و میر ناشی از سرطان دارد. یکی از روشهای عملی برای پیشگیری، مدیریت و کنترل بدخیمیهایی مانند سرطان، بررسی وضعیت پروفایل بیان ژن است. lncRNAها تنظیم کننده های مهمی در فرآیندهای سلولی هستند که این فرایندها معمولاً در سرطان معده به درستی تنظیم نمی شوند. همچنین، بیان نابجای lncRNA ها با سرطان معده در ارتباط است و بعضی ازlncRNA ها می توانند در تشخیص و پیش آگهی نقش داشته باشند. در این مطالعه، سطوح بیان RNA طولانی غیر کدکننده (lncRNA) LINC02288 و LINC01285 در بیماران سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی و آزمایش qPCR ارزیابی شدند. سنجش کمی RNA با استخراج آنها از نمونههای بافتی انجام شد. در فاز بعد، سنتز cDNA و طراحی پرایمر برای هریک از lncRNAها صورت گرفت. سپس، سطح بیان نسبی هر lncRNA بین بافت توموری و سالم با استفاده از سیستم Real-Time PCR تعیین شد. در نهایت، با بهرهگیری از نرمافزار GraphPad Prism تجزیه و تحلیلهای آماری دادهها انجام شد. نتایج حاصل از آنالیز microarray نشان داد که نمونههای مورد بررسی، کیفیت مناسبی داشته و این دو lncRNA دارای افزایش بیان معناداری در نمونههای بیمار نسبت به نمونههای سالم میباشند. برای تایید نتایج حاصل از آنالیز دادههای microarray، از پایگاه دادهی ENCORI استفاده شد. نتایج نشان داد که بیان هر دو lncRNA در نمونههای سرطان معده نسبت به نمونههای سالم دارای افزایش بیان معنادار هستند. پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، جهت ارزیابی تغییرات در سطح بیان lncRNAهای منتخب از ازمایشReal-time PCR استفاده شد. ارزیابی نشان داد که بیان معنادار lncRNAهای LINC02288 و LINC01285 در بیماران سرطان معده نسبت به نمونههای سالم افزایش یافته است. از طرفی، ارتباطی میان بیان lncRNAهای اشاره شده با موقعیتهای کلینیکوپاتولوژیک در نمونههای سرطان معده مشاهده نشد. آنالیز Pearson نیز نشان داد که میان سطح بیان LINC02288 و LINC01285 در نمونههای سرطان معده همبستگی مثبت معناداری وجود ندارد. در مجموع نتایج نشان داد که هر دو lncRNA میتوانند به عنوان نشانگر زیستی قابل قبول برای نمونههای سرطان معده معرفی شوند |
لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14414 |
زبان مدرک : | فارسی |