| نوع مدرک: | متون چاپی |
| سرشناسه | حبیبی دهقی ، فاطمه، نویسنده |
| رده‌بندی کنگره : | BIO microb I 8 |
| عنوان : | بررسی برهم کنش ژن کد کننده ی پروتئین SFRP2با RNA طویل غیر کدکننده ی CHKB-AS1 و تغییرات بیان این دو ژن در نمونه های سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR |
| عنوان موازی : | Evaluation of the interaction and expression level of SFRP2 mRNA and lncRNA CHKB-AS1 in the gastric cancer samples, based on the integrated bioinformatics and qRT-PCR analysis |
| ناشر: | دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان |
| سال نشر : | 1401 |
| صفحه شمار: | 63ص |
| شابک/شاپا | 24712 |
| یادداشت | پایان نامه کارشناسی ارشد:رشته ژنتیک گرایش میکروبیولوژی صنعتی |
| توصیفگرها | سرطان معده، نشانگر زیستی، SFRP2، lncRNA، real-time PCR Bioinformatics, SFRP2, RNA interaction, gastric cancer, CHKB-AS1. |
| چکیده : | سرطان معده دومین عامل مرگ و میر بر اثر سرطان در دنیاست. این سرطان در کشورهای شمال شرق آسیا بیشترین میزان شیوع را داراست. در ایران نیز این سرطان به عنوان سومین عامل مرگ و میر در جهان معرفی شده و از بین سرطان های مرتبط با دستگاه گوارش، نیمی از بیماری ها را سرطان دستگاه گوارش معرفی کرده اند. این بیماری عوامل متعدد عفونی (مانند باکتری هلیکوباکتر پیلوری) و غیرعفونی (مانند مصرف دخانیات) را داراست که مجموعه ی این عوامل بر سطح بیان ژن های کد کننده و غیر کد کننده ی پروتئین اثر گذاشته و با تغییرات در حالت های عادی بیان ژن ها، می توانند منجر به ایجاد بدخیمی شوند. در این مطالعه، با بررسی وضعیت بیان ژن کد کننده ی پروتئین SFRP2 و RNA طویل غیرکدکننده ی CHKB-AS1، تغییرات بیانی این ژن ها، ارتباط احتمالی آنها در نمونه های سرطان معده و پتانسیل بیومارکری این دو ژن مورد ارزیابی قرار می گیرد. در ابتدا با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک، تغییرات بیان و برهم کنش احتمالی این دو RNA پیش بینی شد. با استفاده از آنالیز داده های microarray، تغییرات بیان ژن SFRP2 مشخص شد. با استفاده از پایگاه داده های مرتبط با برهم کنش lncRNA – mRNA، برهم کنش احتمالی RNA های مورد بررسی نیز بررسی شد. با استفاده از پایگاه داده ی ENCORI، تغییرات بیان SFRP2 و CHKB-AS1 مورد تایید قرار گرفته و در نهایت پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، با استفاده از آزمایش real-time PCR، بیان این دو RNA در 20 نمونه ی بیمار در مقایسه با 20 نمونه ی سالم مورد ارزیابی قرار گرفت. بر اساس آنالیز داده های microarray، پایگاه داده ی ENCORI و آزمایش qRT-PCR، بیان هر دو ژن SFRP2 و CHKB-AS1 در نمونه های سرطان معده افزایش معنادار نشان داد و این دو RNA در نمونه های سرطان معده دارای همبستگی مثبت می باشند.
نتیجه گیری: افزایش بیان SFRP2 که می تواند ناشی از افزایش بیان lncRNA CHKB-AS1 باشد، می تواند یکی از عوامل مهم در افزایش ریسک ابتلا به سرطان معده و پیشرفت این بیماری محسوب شود. بنابراین افزایش بیان CHKB-AS1 می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی قابل قبول برای تشخیص نمونه های سرطان معده مورد استفاده قرار گیرد |
| لینک ثابت رکورد: | ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13778 |
| زبان مدرک : | فارسی |
بررسی برهم کنش ژن کد کننده ی پروتئین SFRP2با RNA طویل غیر کدکننده ی CHKB-AS1 و تغییرات بیان این دو ژن در نمونه های سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR (1401) / حبیبی دهقی ، فاطمه، نویسنده