رکوردهای مرتبط با این شخص

ارتباط چند شکلی تک نوکلئوتیدی (AKT1 (rs2494732- rs1130214- rs1130233 با خطر ابتلا به سرطان پستان (1403) / ترکی ، بتول، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه ترکی ، بتول، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭70 1403 عنوان : ارتباط چند شکلی تک نوکلئوتیدی (AKT1 (rs2494732- rs1130214- rs1130233 با خطر ابتلا به سرطان پستان عنوان موازی : Association between genetic polymorphisms of rs2494732, rs1130233 and rs1130214 in AKT1 with The Risk of ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 96ص شابک/شاپا 25809 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی – مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها - SNP سرطان پستانrs1130233- rs1130214 – rs2494732 – AKT-  Breast cancer, AKT1, SNP, rs1130233, rs2494732,rs1130214 چکیده : سرطان سینه به عامل اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در زنان سراسر جهان تبدیل شده است. زنان شانسی معادل 1در 8 مورد ابتلا به سرطان سینه در طول زندگی خود دارند. فاکتور های پیش آگهی دهنده سنتی مانند اندازه تومور، درجه و متاستاز آن به غدد لنفاوی همچنان مهم ترین عوامل پیش آگهی سرطان سینه هستند. درمان های مرسوم شامل جراحی، شیمی درمانی، پرتو درمانی، ایمونوتراپی و پزشکی شخصی میزان بقا و سلامت بیماران را تا حدی بهبود بخشیده است. اما این رویکردها نمی تواند از تشدید و متاستاز زیر گروه های مختلف این بیماری جلوگیری کند. ژن AKT1 یکی از سه عضو خانواده پروتئین کیناز سرین – ترئونین انسانی را کد می کند و در 14q32 قرار دارد. مسیر سیگنال دهی AKT/PI3K به عنوان یک آبشار سیگنالینگ حفظ شده از نظر تکاملی، مجموعه وسیعی از فرایند های فیزیولوژیکی سلول مانند رشد سلولی، تکثیر، تمایز، حرکت، متابولیسم و مهاجرت را تنظیم می کند. بنابراین تعجب آور نیست که مسیر AKT/PI3K تقریبا در همه سرطان های انسانی بی نظم است و به عنوان یک هدف درمانی بلقوه به شدت دنبال می شود. با توجه به اهمیت SNPs در توسعه سرطان، درک پلی مورفیسم های موجود در ژنهای مسیر های سیگنالینگ از جمله پلی مورفیسم های ژن AKT1 می تواند در تشخیص زود هنگام سرطان سینه کمک کرده و اثر بخشی درمان را افزایش دهد. هدف از این تحقیق بررسی اثر پلی مورفیسم های rs1130233; rs1130214; rs2494732 ژن AKT1 در بروز سرطان سینه است، که می تواند به عنوان بیومارکر پیش آگهی استفاده شود و با غربالگری افراد جامعه با کمک این بیومارکر یا تحت نظر قرار دادن افراد در معرض خطر میزان شیوع و مرگ و میر ناشی از این بیماری را کاهش دهد. در مطالعه حاضر 100 نمونه از خون افراد مبتلا به سرطان سینه و 100 نمونه از خون افراد سالم تهیه گردید، سپس تخلیص DNA از خون افراد صورت گرفت و شرایط PCR برای تکثیر ژن AKT1 این افراد با طراحی و تهیه پرایمر های اختصاصی انجام شد. سپس با استفاده از روش های RFLP PCR-و ARMS- PCR و ران کردن محصولات آن ها بر روی ژل آگارز این rs ها ژنوتیپ شدند و با استفاده از تجزیه و تحلیل رگرسیون لجستیک، ارتباط ژنوتیپی و آللی بین AKT1 SNPs و توسعه سرطان سینه تحت مدل های توارث مشترک، غالب و مغلوب تعیین شد، ترکیب ژنوتیپ و تجزیه و تحلیل هاپلوتیپ نیز برای ارزیابی اثر ترکیبی SNP های AKT1 بر خطر سرطان سینه انجام شد، ما از سرور آنلاین RNAsnp برای پیش بینی تاثیر SNP rs1130233 بر ساختار ثانویهRNA استفاده کردیم، تجزیه و تحلیل آماری نشان داد SNP rs1130233 به طور قابل توجهی با استعداد ابتلا به سرطان پستان تحت مدل وراثت مغلوب مرتبط است (P<0.05) . آلل T rs1130233 خطر توسعه سرطان سینه را به همراه دارد. OR: 1.877; 95%CI : 1.242-2.837;P=0.003. برای rs1130214/rs2494732 و rs1130233/rs2494732 ، ژنوتیپ های ترکیبی AA/TC و CC/TC در معرض افزایش خطر سرطان سینه هستند. (p<0.05). نتایج ما نشان می دهد که AKT1 rs1130233 به طور قابل توجهی با خطر بالاتر سرطان سینه مرتبط است. علاوه بر این هاپلوتیپ CTC را می توان برای شناسایی افراد با استعداد ژنتیکی ابتلا به سرطان سینه استفاده کرد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14645 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25809	‭BIO gen ‭70 1403	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

ارتباط چند شکلی های ژنتیکی RS964372 و RS8052334 در ژن متالوتیونین 1 ب (MT1B) با خطر ابتلا به سرطان سینه (1402) / عسکری ، محمد جواد، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه عسکری ، محمد جواد، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭62 1402 عنوان : ارتباط چند شکلی های ژنتیکی RS964372 و RS8052334 در ژن متالوتیونین 1 ب (MT1B) با خطر ابتلا به سرطان سینه عنوان موازی : Study of single nucleotide polymorphisms RS964372 and RS8052334 , MT1B gene associated with breast cancer patients among Iranian ancestries ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 114ص شابک/شاپا 25660 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی سلولی-مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : یوسف نیا ، ساغر، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها سرطان سینه،ژن MT1B،RS8052334، RS964372، T-ARMS-PCR assayy  breast cancer, MT1B gene, RS8052334, RS964372, T-ARMS-PCR assay چکیده : سرطان سینه پنجمین علت مرگ و میر ناشی از سرطان در بین زنان در سراسر جهان است.متالوتیونین ها (MTs) خانواده ای از پروتئین های اتصال فلز هستند که نقش مهمی در حفظ هموستاز یون های فلزی واسطه، تعادل ردوکس در سلول و فرآیندهای سلولی اساسی مانند تکثیر و آپوپتوز دارند.مطالعات ایمونوهیستوشیمی نشان داده است که 26 تا 100 درصد کارسینوم مجرای مهاجم (IDC) پروتئین MT را بیان می‌کنند. علاوه بر این، بیان متالوتیونئین ممکن است نقش بالقوه ای در محافظت از سلول سرطان پستان در برابر شیمی درمانی برای بقا داشته باشد. در بافت‌های پستان، MT عمدتاً در سلول‌های اپیتلیال ، میواپیتلیال و بدخیم بیان می‌شود. شواهد نشان می دهد که تغییرات ژنتیکی در MT-1 ممکن است به افزایش خطر ابتلا به سرطان کمک کند. پلی مورفیسم های ژنتیکی یکی از مواردی هستند که می توانند خطر ابتلا به سرطان سینه را به دلیل تغییر در سطح بیان ژن یا تغییر در ساختار پروتئین تغییر دهند.تاکنون چندین پلی مورفیسم در ژن کد کننده MT1B تعریف شده است. که با انواع سرطان ها ارتباط داشته اند.هدف از مطالعه حاضر بررسی ارتباط بین پلی مورفیسم های (3:c.28+137C>G)RS964372و RS8052334(3:c.95-68T>C) و خطر ابتلا به سرطان سینه در زنان ایرانی است. این مطالعه شامل 100 بیمار مبتلا به سرطان سینه و 100 فرد سالم به عنوان گروه شاهد بود.DNA ژنومی از نمونه های خون استخراج و تعیین ژنوتیپ با استفاده از روش T-ARMS-PCR assay انجام شد و در پایان آنالیز آماری توسط نرم افزار SPSS (آزمون کای اسکوئر) مورد ارزیابی قرار گرفت. مشاهده شد الل CC در rs964372 و الل TC در rs 8052334 با (p value:.085) دارای بیشترین فراوانی و اللAA در rs964372 و الل CC در rs 8052334 با (p value:.068) کم ترین فراوانی را دارا می باشد. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که پلی مورفیسم های , RS964372 (C>G) واقع در اینترون1 این SNP و RS8052334 (T>C) واقع در اینترون 2 ارتباط معنا داری با ابتلا به سرطان سینه نشان ندادند.با این وجود پلی مورفیسم های RS8052334 (T>C) و RS964372 (C>G)در ژن MT1B ویژگی های پاتوبیولوژیکی مهمی دارند که می توانند در بروز و پیشرفت بیماری های مختلف نقش آفرین باشند.شواهد نشان می دهد که این تغییرات ژنتیکی بر تنظیم بیان ژن MT1B تاثیر گذاشته و در فرآیند های حیاتی از جمله رشد و تمایز سلولی ،پاسخ های التهابی و مقابله با استرس اکسیداتیودخالت دارند.ارتباط این پلی مورفیسم ها با برخی بیماری ها ،از جمله اختلالات التهابی ،سرطانی و متابولیکی ،نشانگر اهمیت آن ها در مسیر های پاتوفیزیولوژیکی مختلف است.لذا تحقیقات آینده بر روی این تغییرات ژنتیکی می تواند درک عمیق تری از نقش ژن MT1B در فرآیند های بیماری زا ارائه داده و مسیر های نوین برای تشخیص،پیشگیری و درمان بیماری های مرتبط فراهم کند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14497 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25659	‭BIO gen ‭62 1402	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

ارتباط چندشکلی های ژنتیکی rs2758339، rs2842980 وrs5746136 ژن سوپر اکسید دیسموتاز 2 با خطر ابتلا به سرطان سینه (1401) / اسدی ، سارا، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه اسدی ، سارا، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭34 عنوان : ارتباط چندشکلی های ژنتیکی rs2758339، rs2842980 وrs5746136 ژن سوپر اکسید دیسموتاز 2 با خطر ابتلا به سرطان سینه عنوان موازی : Association between genetic polymorphisms of rs2758339, rs2842980 and rs5746136 with The Risk of Breast Cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 99ص شابک/شاپا 24580 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی -مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : یوسف نیا ، ساغر، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمانزاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها سرطان سینه، SOD2، rs2758339، rs2842980، rs5746136، PCR-RFLP  breast cancer, SOD2, rs2758339, rs2842980, rs5746136 چکیده : سرطان سینه شایع ترین سرطان در بین زنان است که تا یک سوم جمعیت آنها را در طول عمرشان مبتلا می کند. پلی مورفیسم های ژنتیکی می توانند خطر ابتلا به سرطان سینه را به دلیل تغییر در بیان ژن یا ساختار پروتئین تغییر دهند. یکی از عوامل سرطانزا استرس اکسیداتیو است که نقش مهمی در ایجاد سرطان سینه دارد. سوپراکسید دیسموتاز 2 (SOD2) یکی از آنزیم های آنتی اکسیدانی کلیدی است که مسئول سم زدایی گونه های فعال اکسیژن در میتوکندری است و نقش مهمی در حفظ تعادل رادیکال های آزاد در بدن انسان دارد. تاکنون چندین پلی مورفیسم در ژن کد کننده SOD2 تعریف شده است که با انواع سرطان ها ارتباط داشته اند. هدف از مطالعه حاضر بررسی ارتباط بین پلی مورفیسم های rs2758339، rs2842980 وrs5746136 و خطر ابتلا به سرطان سینه در زنان ایرانی است. این مطالعه شامل 100 بیمار مبتلا به سرطان سینه و 100 فرد سالم به عنوان گروه شاهد بود. DNA ژنومی از نمونه های خون استخراج و تعیین ژنوتیپ با استفاده از روشهای PCR و RFLP انجام شد و در پایان آنالیز آماری توسط نرم افزار SSPS صورت گرفت. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که پلی¬مورفیسم rs5746136 واقع در ناحیه ترجمه نشده (3'UTR) ژن SOD2 با افزایش خطر ابتلا به سرطان سینه ارتباط معنادار دارد، اما پلی¬مورفیسم¬های rs2758339 و rs2842980 ارتباط معناداری با ابتلا به سرطان سینه نشان ندادند. در مجموع نتایج این مطالعه نشان می دهد که پلی¬مورفیسم rs5746136 می تواند به عنوان یک مارکر ژنتیکی در تشخیص سرطان سینه مورد استفاده قرار گیرد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13655 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24580	‭BIO gen ‭34	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

ارتباط چندشکلی ژنتیکی miR-32 C>A (rs7041716) با خطر ابتلا به سرطان سینه (1401) / امیرآبادی ، سیده زهرا، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه امیرآبادی ، سیده زهرا، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭29 عنوان : ارتباط چندشکلی ژنتیکی miR-32 C>A (rs7041716) با خطر ابتلا به سرطان سینه ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 58ص شابک/شاپا 24575 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی -مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : یوسف نیا ، ساغر، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد راهنما آهنگرزاده ، شهرزاد، استاد مشاور توصیفگرها سرطان پستان،miR32 ،arms PCR ، rs7041716  Breast cancer, MIR32, arms PCR, rs7041716 چکیده : مقدمه: سرطان پستان شایع ترین سرطان تشخیص داده شده در زنان است و رتبه دوم را در بین علل مرگ ناشی از سرطان در زنان دارد. شواهد موجود در پژوهش های مختلف نشان داده است که تحقیقات گذشته و در حال انجام، نتایج زیادی را درمورد مکانیسم های تشخیصی و درمانی در مورد سرطان پستان دارند. این امر به پیشرفت های صورت گرفته در حوزه غربالگری، تشخیص و استراتژی های درمانی درگیر در مدیریت سرطان پستان نسبت داده کمک کرده است. در این مطالعه، به بررسی پیرامون یکی از پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNP) بالقوه (rs7041716) در ژن غیر کد کننده ی پروتئین miR32 در بیماران سرطان پستان پرداخته شد. درک مکانیسم عملکردی SNP ها در ژن های مختلف کد کننده و غیر کد کننده به یافتن نشانگر های زیستی پیش آگهی دهنده و تشخیصی جدید در بیماران سرطانی کمک می کند. روش: یافتن فراوانی ژنوتیپی و اللی rs7041716 (C > A) در ژن miR32 توسط متد PCR ARMS صورت گرفت. آنالیز آماری داده های ژنوتیپ و الل و مقایسه ی فراوانی ها در نمونه های سرطان پستان و کنترل توسط نرم افزار SPSS صورت گرفت. محاسبه ی نسبت شانس برای یافتن ارتباط افزایشی یا کاهشی ریسک ابتلا یا پیشرفت سرطان پستان در نمونه های بیماران با الل جهش (C) توسط SPSS صورت گرفت. محاسبه ی مدل های ژنوتیپی غالب، مغلوب و هم بارز نیز برای یافتن بهترین مدل ژنوتیپی بالقوه در rs7041716 و بررسی تاثیر افزایشی یا کاهشی مدل ژنوتیپی مذکور در ریسک ابتلا به بیماری سرطان پستان صورت گرفت. نتایج: آنالیز آماری داده های ژنوتیپی و اللی نشان دهنده ی افزایش فراوانی الل A و ژنوتیپ AA در نمونه های سرطان پستان نسبت به نمونه های سالم بود. آنالیز نسبت شانس نشان دهنده ی ارتباط مستقیم فراوانی الل A با افزایش ریسک ابتلا به سرطان پستان بود. آنالیز مدل های ژنوتیپی نشان داد که اللA در ژنوتیپ هتروزیگوت (AC) به بیشترین شکل ممکن ریسک ابتلا به بیماری سرطان پستان را افزایش می دهد. این الل در ژنوتیپ AC ریسک ابتلا به بیماری را حدود 2.9 برابر افزایش می دهد. نتیجه گیری: miR32 به عنوان یکی از ژن های غیر کد کننده ی پروتئین می تواند یکی از ژن های مهم دخیل در افزایش ریسک ابتلا به سرطان پستان محسوب شود. پلی مورفیسم rs7041716 به عنوان یکی از مهم ترین تغییرات نوکلئوتیدی در این ژن است که می تواند ریسک ابتلا به بیماری سرطان پستان را افزایش دهد. درک بیشتر این ناحیه از miR32 می تواند منجر به یافتن یکی از اهداف تشخیصی و درمانی سرطان پستان محسوب شود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13650 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24575	‭BIO gen ‭29	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

آنالیز بررسی تغییرات بیان RNAهای طویل غیرکدکننده‌ی LINC01605 و PLCE1-AS2 در نمونه‌های سرطان معده با استفاده از آنالیز‌های بیوانفورماتیک و آزمایش q-RTPCR (1402) / علیمردانی ، زینب، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه علیمردانی ، زینب، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭ عنوان : آنالیز بررسی تغییرات بیان RNAهای طویل غیرکدکننده‌ی LINC01605 و PLCE1-AS2 در نمونه‌های سرطان معده با استفاده از آنالیز‌های بیوانفورماتیک و آزمایش q-RTPCR عنوان موازی : Differential expression and correlation analysis of PLCE1-AS2 and LINC01605 long non-coding RNAs in gastric cancer sample ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 63ص شابک/شاپا 25316 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد در رشته ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، نویسنده توصیفگرها بیوانفورماتیک، آنالیز بیومارکر، برهم کنش RNA، سرطان معده، LINC01605 PLCE1-AS.  Bioinformatics, Biomarker analysis, RNA interaction, Gastric cancer, LINC01605, PLCE1-AS چکیده : سرطان معده یک بدخیمی بسیار تهاجمی و کشنده است. این سرطان پنجمین تومور شایع و سومین سرطان کشنده در سراسر جهان است. هر سال نزدیک به 1 میلیون مورد جدید سرطان معده (GC) گزارش می‌شود و حدود نیمی از آنها در چین رخ می‌دهد. مطالعات در دهه گذشته نشان داده که RNA طولانی غیر کدکننده (lncRNA) ها نقش مهمی در انواع بیماری‌ها از جمله سرطان ایفا می‌کنند. به عنوان مثال، lncRNA ها می‌توانند بر تکثیر سلولی، آپوپتوز، مهاجرت، تهاجم، چسبندگی و غیره در ایجاد بدخیمی تأثیر بگذارند. بیان نابجای lncRNA ها با سرطان معده مرتبط است. در این مطالعه، سطوح بیان LINC01605 های LncRNA و PLCE1-AS2 در بیماران GC با استفاده از آزمایش qPCR و ابزارهای بیوانفورماتیک ارزیابی شد. برای یافتن ژن‌های جدید دارای تغییرات بیان در بیماران GC، مجموعه داده ریزآرایه GSE95667 توسط نرم افزار R Studio آنالیز شد. برای تأیید نتایج حاصل از آنالیز ریزآرایه از پایگاه‌های داده آنلاین GEPIA2 و ENCORI استفاده شد. از ازمایش Real-time PCR برای ارزیابی تغییرات در سطح بیان RNA های انتخابی استفاده شد. در نهایت تجزیه و تحلیل‌های آماری داده‌ها توسط GraphPad Prism انجام شد. بر اساس تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه، مشخص شد که LINC01605 و PLCE1-AS2 در بیماران GC نسبت به نمونه‌های کنترل دارای بیان بیشتر است است. تجزیه و تحلیل داده‌های PCR qRT- نیز نشان داد که lncRNA PLCE1-AS2 و هم lncRNA LINC01605 در بیماران GC دارای افزایش بیان هستند. ارتباطی بین بیان ژن‌های ذکر شده با موقعیت‌های کلینیکوپاتولوژیک در نمونه‌های سرطان معده مشاهده نشد. بر اساس آنالیز Pearson میان سطح بیان LINC01605 و PLCE1-AS2 در نمونه‌های سرطان معده همبستگی مثبت معنادار قابل توجهی مشاهده می‌شود. این همبستگی بیانگر اثر احتمالی افزاینده بیان lncRNA های ذکر شده بر بیان یکدیگر است. این دو lncRNA می‌توانند بر سطح بیان یکدیگر تأثیر داشته باشند و در کل در تغییر خطر ابتلا به بیماری سرطان معده مؤثر باشند. در مجموع آنالیز ROC به ما نشان داد این دو lncRNA PLCE1-AS2 و LINC01605 به عنوان بیومارکر تشخیصی قابل قبول در تشخیص GC هستند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14260 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25316	‭BIO gen ‭	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

آنالیز بیان نسبی RNA های طویل غیر کد کننده SPATA3-AS1 و PTGES2-AS1در نمونه های سرطان روده بزرگ در مقایسه با نمونه های بافت همجوار کنترل (1402) / حیدری ، ثمر، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه حیدری ، ثمر، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭60 1402 عنوان : آنالیز بیان نسبی RNA های طویل غیر کد کننده SPATA3-AS1 و PTGES2-AS1در نمونه های سرطان روده بزرگ در مقایسه با نمونه های بافت همجوار کنترل عنوان موازی : Ralative expression analysis of long non-coding RNAs SPATA3-AS1 and PTGES2-AS1 in the colorectal cancer samples compared to adjacent control samples ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 93ص شابک/شاپا 25630 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: ژنتیک شناسه افزوده : زمان زاده ، زهرا، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها سرطان روده بزرگ، بیوانفورماتیک، LncRNA  Colorectal cancer, SPATA3-AS1, LncRNA PTGES2-AS1, in silico analysis چکیده : سرطان روده بزرگ (CRC) چهارمین عامل مرگ و میر در جهان است. این بیماری در مراحل اولیه علایم خاصی ندارد اما پس از رشد تومور علایم آن بروز خواهند کرد. خوشبختانه این سرطان از معدود سرطان هایی است که با تشخیص زودهنگام می توان از نوع بیماری متاستاسیک آن جلوگیری کرد. بیومارکر ها و یا نشانگرهای زیستی می توانند، ابزاری کلیدی برای تشخیص زودهنگام این بیماری در دوره طلایی قبل از شروع علایم باشند. RNA های طولانی غیر کد کننده(LncRNA) میتوانند نقش بیومارکر را ایفا کنند، بنابراین بررسی اینRNA های طولانی میتواند کمک شایانی به درمان و تشخیص زودهنگام این بیماری کند. در این مطالعه، سطوح بیان RNA طولانی غیر کد کننده SPATA3-AS1 و RNA طولانی غیر کدکننده PTGES2-AS1 در بیماران CRC با استفاده از qPCR و بررسی و تجزیه و تحلیل ابزارهای بیوانفورماتیک ارزیابی شد. آنالیز microarray با استفاده از بررسی و آنالیز داده های ریز آرایه پایگاه داده ENCORI انجام شد و مشخص شد، LncRNAهای SPATA3-AS1وPTGES2-AS1 داری تغییرات قابل توجه در سطح بیان هستند. آزمایشReal-time PCR برای ارزیابی تغییرات در سطح بیان lncRNA های انتخابی استفاده شد و نشان داد LncRNAهای SPATA3-AS1وPTGES2-AS1 دارای افزایش بیان معنادار در بیماران سرطان روده بزرگ نسبت به نمونه های سالم بود سپس با استفاده از نرم افزار Prism و بررسی مقدار P.valueوlogFC مشخص شد هر دو lncRNA داری افزایش بیان در نمونه های تومور نسبت به نمونه های سالم است، آنالیز ROC به منظور بررسی پتاسیل بیومارکری انجام شد و نشان داد SPATA3-AS1 به عنوان یک نشانگر ضعیف و PTGES2-AS1 به عنوان یک نشانگر زیستی خوب معرفی گردد. بر اساس آنالیز Pearson میان سطح بیان SPATA3-AS1 و PTGES2-AS1 در نمونه های سرطان روده بزرگ همبستگی مثبت معنادار قابل توجهی مشاهده می شود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14466 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25629	‭BIO gen ‭60 1402	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی اثر برخی از محرک های نانو فلزی بر رشد سلولی در کشت سوسپانسیونی گیاه تاج خروس (1403) / نوشیروانی ، سینا، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه نوشیروانی ، سینا، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭75 1403 عنوان : بررسی اثر برخی از محرک های نانو فلزی بر رشد سلولی در کشت سوسپانسیونی گیاه تاج خروس عنوان موازی : Cellular and molecular biology, field of Genetic Investigating the effect of some nanometal stimulants on cell growth in the suspension culture of Amaranthus ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 67ص شابک/شاپا 25814 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی سلولی-مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها اسکوالین، روغن، کالوس زایی، تاج خروس، اکسید روی  Squalene, Oil, Callus formation, Amaranth, Zinc oxide چکیده : امروزه به رغم فراوانی داروهای شیمیائی، استفاده از گیاهان دارویی در حال افزایش است و تولید و تجارت این گیاهان رقم قابل ملاحظه ای را به خود اختصاص داده است. اسکوالین یک هیدروکربن غیراشباع از نوع تری‌ترپن ها است که دارای شش پیوند دوگانه می‌باشد که پیش ماده اصلی کلسترول و استروییدها در گیاهان و جانوران است. اسکوالین به عنوان یک ماده شیمیایی ویژه در صنایع غذایی، دارویی، واکسن و آرایشی می باشد که فعالیت های ضد سرطانی، آنتی اکسیدانی، آبرسانی پوست دارد و همچنین محرک سیستم ایمنی بدن و نرم کننده است. این ترکیب امید زیادی را در پیشگیری از بیماری های مزمن انسان مانند سرطان ارائه می دهد. این ماده با وجود روغن بودن، بسیار سبک وزن است و ظرفیت نفوذ بالای آن در پوست منحصر به فرد است. منبع اصلی اسکوالین روغن کبد کوسه ماهیان است اما به دلیل خطر کاهش تنوع زیستی به دلیل شکار بی رویه کوسه و خطرات زیست محیطی و به خاطر سمیت فلزات سنگین و بوی نامطبوع ماهی سعی بر آن شده است تا در این مطالعه از منابع گیاهی آن را استخراج کرد. این ماده در بذر تاج خروس هم وجود دارد. در این تحقیق کالوس زایی به طور موفق از بذر تاج خروس انجام گرفت. نتایج نشان داد که غلظت 3/1 میلی گرم در لیتر هورمون 2,4-D باعث القا کالوس می شود. اما با توجه به متوقف شدن رشد کالوس در محیط کشت جامد تیمارهای مختلفی از جمله افزودن نیترات نقره، اکسید روی و افزایش و کاهش میزان غلظت برخی از عناصر آزمون شد. در نهایت در برخی از تیمار ها افزایش چند برابری رشد کالوس ها مشاهده شد. پس از بهینه سازی کالوس زایی بر روی محیط کشت جامد، کشت مایع انجام شد. در کشت مایع طی دو ماه از دویست میلی گرم کالوس مقادیر مختلفی از ماده تر بدست آمد. میزان اسکوالین در سلول های حاصل از کشت مایع اندازه گیری شد و نتایج آنالیز کروماتوگرافی گازی نشان داد که مقدار 5 میلی گرم در لیتر اکسید روی منجر به افزایش بیان ژن اسکوالین سنتتاز و در نتیجه افزایش مقادیر روغن اسکوالین می‌شود. با توجه به نتایج امیدوار کننده در این طرح، انتظار می رود استفاده از بیوراکتور روشی مناسب برای تولید اسکوالین در مقادیر بالاتر باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14650 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25814	‭BIO gen ‭75 1403	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی ارتباط پلی مورفیسمهای rs1726866 در ژن TAS2R و rs1799883 در ژن FABP2 باخطر ابتلا به سرطان پستان (1403) / حسن زاده ، زهرا، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه حسن زاده ، زهرا، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭80 1403 عنوان : بررسی ارتباط پلی مورفیسمهای rs1726866 در ژن TAS2R و rs1799883 در ژن FABP2 باخطر ابتلا به سرطان پستان عنوان موازی : Investigating the relationship between polymorphisms rs1726866 in TAS2R gene and rs1799883 in FABP2 gene with breast cancer risk ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 75ص شابک/شاپا 25940 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی سلولی-مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : زمان زاده ، زهرا، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها سرطان سینه، rs1726866 ،TAS2R ،rs1799883، FABP2  breast cancer,rs1796866,Tas2r, rs1729883, FABP2 چکیده : سرطان پستان شایع ترین سرطان و علت عمده مرگ و میر در زنان می باشد. چاقی به عنوان یک عامل خطر عمده برای ابتلا به سرطان پستان نرخ و شدت ابتلا به این بیماری را افزایش میدهد. پلی مورفیسم rs1799883 در ژن FABP2، و پلی مورفیسم rs1726866 در ژن TAS2R ژن هایی که ارتباط آنها با چاقی و دیابت شناخته شده است، هدف از مطالعه حاضر بررسی ارتباط پلی مورفیسم های rs1726866 در ژن TAS2R و rs1799883 در ژن FABP2 با خطر ابتلا به سرطان پستان است. این مطالعه برروی 100 فرد مبتلا به سرطان پستان به عنوان گروه بیمار و 100 فرد سالم به عنوان گروه کنترل انجام شد. DNA از نمونه های خون استخراج شده است و تعیین ژنوتیپ با استفاده از روش tetra-ARMS PCR انجام شد. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که نتیجه حاصل از این، پلی مورفیسم rs 1799883 در ژن FABP2 ارتباطی با سرطان سینه در جمعیت مورد مطالعه ندارند. همچنین نتایج نشان داد که rs1726866 در ژن TAS2R باالگو وراثتی Recessive ارتباط معناداری بین این پلی مورفیسم وسن وجود دارد P value:0/020 وهمچنین فراوانی آلل A در افرادی که بالای 40 سال بوده اند بیشتر از‌افرادی بوده است که کمتر از 40 سال داشته اند که این نشان دهنده ارتباط معنادار آللA در پلی مو فیسم rs1726866 با سن و متاستاز به سایر ارگان ها دارد P value:0/011 با این وجود لازم است تایید و تاکید کنیم که پلی مورفیسم های rs1799883 و rs1726866 ، نقش های بالقوه ای در بروز و پیشرفت بسیاری از بیماریها و شرایط ژنتیکی ایفا میکنند. نتایج اولیه این تحقیق نشان می دهد که ارتباطات و تاثیرات مهمی میان این پلی مورفیسم ها و روندهای فیزیولوژیکی بدن وجود دارد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14776 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25940	‭BIO gen ‭80 1403	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی ارتباط پلی¬مورفیسم های rs6877842، rs10719 و rs642321 در آنزیم Drosha با سرطان پستان (1400) / تقی پور کمال آباد ، ستاره، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه تقی پور کمال آباد ، ستاره، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭24 عنوان : بررسی ارتباط پلی¬مورفیسم های rs6877842، rs10719 و rs642321 در آنزیم Drosha با سرطان پستان عنوان موازی : Relationship Study of rs6877842, rs10719 and rs642321 Polymorphisms in Drosha with Breast Cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: 78ص شابک/شاپا 24570 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی سلولی-مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما رضائی ، حلیمه، استاد مشاور طباطبائیان ، مریم، استاد مشاور توصیفگرها سرطان پستان، DROSHA، rs642321، rs10719، rs6877842  Breast cancer, DROSHA, rs642321, rs10719, rs6877842 چکیده : سرطان پستان شایع¬ترین سرطان در میان زنان سراسر جهان و عامل اصلی مرگ ناشی از سرطان می¬باشد. میزان بروز سرطان پستان در کشورهای در حال توسعه رو به افزایش است. پلی‌مورفیسم‌های تک نوکلئوتیدی (SNPs) در مسیرهای بیوسنتز microRNA ممکن است منجر به کاهش یا افزایش عملکرد microRNA شده که به نوبه خود می‌تواند به عنوان یک عامل سرطان‌زا یا سرکوب‌کننده تومور عمل نماید. اختلال در ژن¬های مسیر بیوژنز microRNA در شروع و پیشرفت چندین سرطان انسانی از جمله سرطان پستان مشاهده شده است. SNP ها در ژن¬های مسیر بیوژنز microRNA با خطر سرطان پستان مرتبط هستند. یکی از مهم¬ترین ژن ها در این زمینه DROSHA می¬باشد. مطالعات قبلی نشان داده است که rs642321، rs10719 و rs6877842به طور قابل توجهی با خطر ابتلا به سرطان¬های مختلف مرتبط است. در این مطالعه مورد-شاهدی از 100 فرد مبتلا به سرطان پستان و 100 فرد سالم برای ارزیابی ارتباط بین این پلی¬مورفیسم¬ها در DROSHA و خطر ابتلا به سرطان پستان استفاده شد. DNA ژنومی از نمونه های خون استخراج شد. از تکنیک ARMS PCR برای ارزیابی rs10719 و rs6877842 و از تکنیک Tetra ARMS PCR برای بررسی rs642321 توسط پرایمرهای طراحی شده، استفاده شد. آنالیز آماری توسط نرم افزار SPSS صورت گرفت. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که پلی¬مورفیسم rs642321 واقع در ناحیه ترجمه نشده (3'UTR) ژن DROSHA با افزایش خطر ابتلا به سرطان پستان مرتبط است. اما پلی¬مورفیسم¬های rs10719 وrs6877842 ارتباطی با ابتلا به سرطان پستان نشان ندادند. در مجموع، نتایج ما نشان داد که وجود پلی‌مورفیسم rs642321در آنزیم DROSHA می‌تواند نشانگر تومور مناسبی در بیماران مبتلا به سرطان پستان باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13645 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24570	‭BIO gen ‭24	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی ارتباط چندشکلی تک نوکلئوتید rad51 (rs2928140 G>C،rs5030789 A>C)با خطر ابتلابه سرطان پستان (1403) / رئیسیان ، مائده، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه رئیسیان ، مائده، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭63 1403 عنوان : بررسی ارتباط چندشکلی تک نوکلئوتید rad51 (rs2928140 G>C،rs5030789 A>C)با خطر ابتلابه سرطان پستان عنوان موازی : Association between genetic polymorphisms ofrs2928140 and rs5030789 in rad51 with The Risk of Breast Cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 77ص شابک/شاپا 25692 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد : رشته ژنتیک مولکولی شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها - SNP سرطان پستان- RAD51-rs2928140 –rs5030789  Breast cancer, RAD51, SNP, rs5030789, rs2928140, چکیده : سرطان سینه شایع ترین علت مرگ و میر ناشی از سرطان در زنان و دومین علت شایع مرگ ناشی از سرطان, در سراسر جهان است. در مناطقی که تا همین اواخر نرخ‌های پایین بیماری داشتند، آمار مبتلایان در حال افزایش است. یکی از عوامل خطر در ارتباط با پلی مورفیسم ژنتیکی است. در این مطالعه، ارتباط پلی‌مورفیسم‌های rs5030789 و rs2928140 در ژن Rad51 با سرطان پستان و برخی عوامل بالینی در 100 نمونه مبتلا به سرطان سینه بررسی شد. ابتدا DNA از نمونه ها استخراج شد و کیفیت استخراج، مورد بررسی و تایید قرار گرفت. پس از طراحی پرایمر، ناحیه حاوی پلی مورفیسم مدنظر با کمک روش ARMS-PCR تکثیر شد و نتایج با استفاده از ژل آگارز مورد بررسی قرار گرفت و در نهایت نتایج مورد آنالیز آماری قرار گرفت. نتایج نشان داد که این دو واریانت با عوامل بالینی از جمله سن، BMI، سابقه خانوادگی، نوع و درجه هیستولوژیک، اندازه تومور و متاستاز ارتباط معناداری نداشتند. همچنین تفاوت معناداری بین ژنوتیپ‌های مختلف و شاخص توده بدنی (BMI) یا سن بیماران مشاهده نشد. این یافته‌ها با برخی از مطالعات قبلی که نشان داده‌اند پلی‌مورفیسم‌های RAD51 نقش مستقیمی در فاکتورهای فردی مانند BMI ندارند، هم‌خوانی دارد. در این مطالعه سابقه خانوادگی سرطان پستان نیز بررسی شد حاملان آلل C در rs5030789 و rs2928140 در بین بیماران با سابقه خانوادگی سرطان پستان بیشتر دیده شدند، اما این اختلاف از نظر آماری معنادار نبود، نتایج این پژوهش نشان می‌دهد که اگرچه پلی‌مورفیسم‌های مورد بررسی تأثیر مستقیمی بر پارامترهای بالینی سرطان پستان نداشتند، اما این به معنای بی‌تأثیر بودن کامل آن‌ها نیست. مطالعات جامع‌تر با درنظر گرفتن عوامل محیطی، ژنتیکی و تعاملات چندگانه و با تعداد نمونه بیشتر می‌توانند درک بهتری از نقش این ژن در سرطان ارائه دهند و به پیشبرد روش‌های تشخیصی و درمانی هدفمند کمک کنند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14528 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25692	‭BIO gen ‭63 1403	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی بیان متفاوت RNAهای طویل غیرکد کننده linc02288 و linc01285 در نمونه‌های سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR (1402) / تجویدی ، فاطمه، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه تجویدی ، فاطمه، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭56 1402 عنوان : بررسی بیان متفاوت RNAهای طویل غیرکد کننده linc02288 و linc01285 در نمونه‌های سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR عنوان موازی : Different Expression Evaluation of Long Non-Coding RNAs linc02288 and linc01285 in Gastric Cancer Samples Using Bioinformatics Analysis and qRT-PCR Test ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 56ص شابک/شاپا 25577 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: گرایش ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها سرطان معده، lncRNA،LINC02288 ،LINC01285، qRT-PCR، بیوانفورماتیک  Gastric cancer, LncRNA, LINC02288, LINC01285, qRT-PCR, Bioinformatics چکیده : سرطان معده چهارمین رتبه را در مرگ و میر ناشی از سرطان دارد. یکی از روش‌های عملی برای پیشگیری، مدیریت و کنترل بدخیمی‌هایی مانند سرطان، بررسی وضعیت پروفایل بیان ژن است. lncRNAها تنظیم کننده های مهمی در فرآیندهای سلولی هستند که این فرایندها معمولاً در سرطان معده به درستی تنظیم نمی شوند. همچنین، بیان نابجای lncRNA ها با سرطان معده در ارتباط است و بعضی ازlncRNA ها می توانند در تشخیص و پیش آگهی نقش داشته باشند. در این مطالعه، سطوح بیان RNA طولانی غیر کدکننده (lncRNA) LINC02288 و LINC01285 در بیماران سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی و آزمایش qPCR ارزیابی شدند. سنجش کمی RNA با استخراج آن‌ها از نمونه‌های بافتی انجام شد. در فاز بعد، سنتز cDNA و طراحی پرایمر برای هریک از lncRNAها صورت گرفت. سپس، سطح بیان نسبی هر lncRNA بین بافت توموری و سالم با استفاده از سیستم Real-Time PCR تعیین شد. در نهایت، با بهره‌گیری از نرم‌افزار GraphPad Prism تجزیه و تحلیل‌های آماری داده‌ها انجام شد. نتایج حاصل از آنالیز microarray نشان داد که نمونه‌های مورد بررسی، کیفیت مناسبی داشته و این دو lncRNA دارای افزایش بیان معناداری در نمونه‌های بیمار نسبت به نمونه‌های سالم می‌باشند. برای تایید نتایج حاصل از آنالیز داده‌های microarray، از پایگاه داده‌ی ENCORI استفاده شد. نتایج نشان داد که بیان هر دو lncRNA در نمونه‌های سرطان معده نسبت به نمونه‌های سالم دارای افزایش بیان معنادار هستند. پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، جهت ارزیابی تغییرات در سطح بیان lncRNAهای منتخب از ازمایشReal-time PCR استفاده شد. ارزیابی نشان داد که بیان معنادار lncRNAهای LINC02288 و LINC01285 در بیماران سرطان معده نسبت به نمونه‌های سالم افزایش یافته است. از طرفی، ارتباطی میان بیان lncRNAهای اشاره شده با موقعیت‌های کلینیکوپاتولوژیک در نمونه‌های سرطان معده مشاهده نشد. آنالیز Pearson نیز نشان داد که میان سطح بیان LINC02288 و LINC01285 در نمونه‌های سرطان معده همبستگی مثبت معناداری وجود ندارد. در مجموع نتایج نشان داد که هر دو lncRNA می‌توانند به عنوان نشانگر زیستی قابل قبول برای نمونه‌های سرطان معده معرفی شوند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14414 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25577	‭BIO gen ‭56 1402	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی تغییرات بیان RNA‌های طویل غیرکد کننده¬ی MIR3142HGوSLC12A5-AS1در نمونه¬های سرطان روده بزرگ درمقایسه با نمونه‌های بافت جوار کنترل با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR (1402) / مختاری ، نسیم، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه مختاری ، نسیم، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭61 1402 عنوان : بررسی تغییرات بیان RNA‌های طویل غیرکد کننده¬ی MIR3142HGوSLC12A5-AS1در نمونه¬های سرطان روده بزرگ درمقایسه با نمونه‌های بافت جوار کنترل با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR عنوان موازی : Expression change analysis of long non-coding RNAs MIR3142HG and SLC12A5-AS1 in the Colorectal cancer samples compared to adjacent control samples ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 68ص شابک/شاپا 25659 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته سلولی و مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها بیوانفورماتیک،SLC12A5-AS1، سرطان کولورکتال،MIR3142HG، .qRT-PCR  Bioinformatics, SLC12A5-AS1, Colorectal Cancer, MIR3142HG, Real time PCR. چکیده : یکی از مهم‌ترین انواع سرطان‌ها بوده که به عنوان سومین بدخیمی شایع تشخیص داده شده و دومین علت شایع مرگ و میر ناشی از سرطان (بعد از سرطان ریه) در سراسر جهان CRC(سرطان روده بزرگ) است. به طوری که باعث ایجاد 9/1 میلیون مورد مرگ در سراسر جهان در سال 2020 شده است. سرطان کلورکتال یک بیماری ژنتیکی چند عاملی است که در اثر انواع فعل و انفعالات بین عوامل ارثی، سبک زندگی، اپی ژنتیکی و محیطی ایجاد می‌شود. یکی از روش‌های عملی برای پیشگیری، مدیریت و کنترل بدخیمی‌هایی مانند سرطان، بررسی وضعیت پروفایل بیان ژن است. در این مطالعه، سطوح بیان RNA‌های طویل غیرکد کننده¬ی MIR3142HGوSLC12A5-AS1در نمونه¬های سرطان روده بزرگ در بیماران CRC با استفاده از آزمایش qPCR و ابزارهای بیوانفورماتیک ارزیابی شد. برای یافتن ژن‌های جدید دارای تغییرات بیان در بیماران CRC، مجموعه داده ریزآرایه GSE110715 توسط نرم افزار R Studio آنالیز شد. آنالیز برهم کنش lncRNA-mRNA با استفاده از پایگاه داده آنلاین ENCORI منجر به شناسایی lncRNA‌های دارای برهم کنش با mRNA شد. برای تایید نتایج حاصل از آنالیز ریزآرایه از پایگاه‌های داده آنلاین GEPIA2 و ENCORI استفاده شد. از ازمایشReal-time PCR برای ارزیابی تغییرات در سطح بیان RNA‌های انتخابی استفاده شد. بر اساس تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه، مشخص شد که MIR3142HGوSLC12A5-AS1در بیماران CRC نسبت به نمونه‌های کنترل دارای بیان بیشتر است. تجزیه و تحلیل برهمکنش LncRNA-mRNA نشان داد که lnc RNA SLC12A5-AS1وMIR3142GH برهمکنش قابل توجهی با یکدیگردارند. تجزیه و تحلیل داده‌های PCR qRT- نیز نشان داد که هر دوی lncRNA MIR3142HG و lncRNA SLC12A5A-S1 در بیماران CRC دارای افزایش بیان هستند. ضمن اینکه آنالیز ROC نشان داد که می‌توان تاحدی از این دو LncRNA جهت تشخیص زودهنگام CRC استفاده کرد. در مجموع نتایج نشان داد که این دو lncRNA می‌توانند بر بیان یکدیگر تاثیر مثبت بگذارند و به افزایش ریسک یا پیشرفت سرطان CRC کمک کنند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14496 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25658	‭BIO gen ‭61 1402	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی تغییرات و همبستگی بیان RNA های طویل غیر کد کننده ی ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 در نمونه های سرطان معده (1401) / محبی ، فاطمه، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه محبی ، فاطمه، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO gen ‭40 عنوان : بررسی تغییرات و همبستگی بیان RNA های طویل غیر کد کننده ی ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 در نمونه های سرطان معده عنوان موازی : Differential expression and correlation analysis of ITFG2-AS1 and MMP25-AS1 long non-coding RNAs in gastric cancer sample ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 63ص شابک/شاپا 24728 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد:رشته ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها سرطان معده، lncRNA، ITFG2-AS1، MMP25-AS1، qRT-PCR، بیوانفورماتیک  Gastric cancer, lncRNA, ITFG2-AS1, MMP25-AS1, qRT-PCR, Bioinformatics چکیده : سرطان معده رتبه دوم را در مرگ و میر ناشی از سرطان دارد. یکی از روش های عملی برای پیشگیری، مدیریت و کنترل بدخیمی هایی مانند سرطان، بررسی وضعیت پروفایل بیان ژن است. lncRNAها تنظیم کننده های مهم فرآیندهای سلولی هستند که این فرایندها معمولاً در سرطان معده به درستی تنظیم نمی شوند. بیان نابجای lncRNA ها با سرطان معده مرتبط است و lncRNA های خاصی در تشخیص و پیش آگهی نقش دارند. در این مطالعه، سطوح بیان RNA طولانی غیر کدکننده (lncRNA) ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 در بیماران سرطان معده ارزیابی شد. در این بررسی، آنالیزهای بیوانفورماتیکی برای بررسی کیفیت نمونه ها و آنالیز تغییر بیان این lncRNA ها انجام شدند. RNA از نمونه های بافتی استخراج شدند و سنجش کمی آنها انجام شد. سپس سنتز cDNA و طراحی پرایمر ویژه برای هریک از lncRNA ها و ژن خانه داری (GAPDH) انجام شد و با استفاده از سیستم Real-Time PCR سطح بیان نسبی هر lncRNA بین بافت توموری و سالم بررسی شد. در نهایت تجزیه و تحلیل های آماری داده ها توسط GraphPad Prism انجام شد. آنالیز میکرواری نشان داد که نمونه های مورد بررسی دارای کیفیت مناسب بودند و این دو lncRNA دارای افزایش بیان معناداری در نمونه های بیمار نسبت به نمونه های سالم می باشند. به منظور تایید نتایج حاصل از آنالیز داده های microarray، از پایگاه داده ی ENCORI برای آنالیز تغییر بیان این lncRNA ها استفاده شد و نشان داد که بیان هر دو lncRNA در نمونه های سرطان معده نسبت به نمونه های سالم دارای افزایش بیان معنادار بودند. از ازمایشReal-time PCR برای ارزیابی تغییرات در سطح بیان lncRNA های انتخابی استفاده شد و نشان دهنده ی افزایش بیان معنادار ژن های ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 در بیماران سرطان معده نسبت به نمونه های سالم بود. ارتباطی بین بیان ژن های ذکر شده با موقعیت های کلینیکوپاتولوژیک در نمونه های سرطان معده مشاهده نشد. به منظور بررسی پتانسیل بیومارکری (تشخیصی) lncRNA ها برای سرطان معده، آنالیز ROC بر داده های بیانی ژن های مطرح شده انجام شد و مشخص شد کهlncRNA ITFG2-AS1 می تواند به عنوان یک نشانگر زیستی قابل قبول برای نمونه های سرطان معده معرفی شود. بر اساس آنالیز Pearson میان سطح بیان MMP25-AS1 و ITFG2-AS1 در نمونه های سرطان معده همبستگی مثبت معنادار قابل توجهی مشاهده می شود. این همبستگی بیانگر اثر احتمالی افزاینده ی بیان lncRNA های ذکر شده بر بیان یکدیگر است. بر اساس این مطالعه ی انجام شده، lncRNA های ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 می توانند دو انکوژن مهم در بیماران سرطان معده محسوب شوند. از طرفی، ITFG2-AS1 می تواند به عنوان یک نشانگر زیستی تشخیصی مهم برای شناسایی زودهنگام افراد دارای ریسک ابتلا به بیماری سرطان معده معرفی شود. این دو lncRNA می توانند بر سطح بیان یکدیگر اثرگذاری داشته باشند و مجموعا در تغییر ریسک ابتلا به بیماری سرطان معده تاثیرگذار باشند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13794 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24728	‭BIO gen ‭40	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی تولید پپتید های ضدباکتری از باسیلوس کوآگولانس (1402) / موسوی ، الهام سادات، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه موسوی ، الهام سادات، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭17 1402 عنوان : بررسی تولید پپتید های ضدباکتری از باسیلوس کوآگولانس عنوان موازی : Study of Antibacterial Peptides Production from Bacillus coagulans ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 97ص شابک/شاپا 25589 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : جلیلی ، مریم السادات، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها باسیلوس کوآگولانس، کوآگولین، سابتیلوزین، پروتئین ضدمیکروبی، آنتی میکروبیال پپتید، مقاومت آنتی¬بیوتیکی، باکتریوسین  Bacillus Coagulans, Antibiotic resistance, Antimicrobial Peptids, Bacteriosin, Coagulin, Subtilosin چکیده : در سال‌های اخیر افزایش روزافزون مقاومت‌های آنتی‌بیوتیکی میکروارگانیسم‌ها و نیز عوارض جانبی ناشی از تجویز و مصرف نابجا و بی‌رویه آنتی‌بیوتیک‌ها، پژوهشگران را به مطالعه و بررسی اثرات ضدمیکروبی پروبیوتیک¬ها راغب ساخته است. بیماری‌های عفونی همراه با مقاومت چند دارویی، مشکل اصلی بهداشت عمومی در کشورهای در حال توسعه با افزایش مرگ و میر و عوارض هستند. جدای از تهدید مقاومت به چند دارو، چندین مطالعه تایید کرده‌اند که استفاده مداوم از آنتی بیوتیک‌ها می تواند به میکروفلور مشترک انسان آسیب برساند. تمرکز تحقیقاتی برای یافتن جایگزین مؤثر برای مبارزه با این پاتوژن¬ها بدون تأثیر بر فلور طبیعی ضروری است. در این راستا استفاده از پروبیوتیک¬ها و ترکیبات متابولیکی طبیعی آن¬ها می‌تواند جایگزینی در صنایع مختلف غذایی و دارویی باشد. درمیان پروبیوتیک¬ها، باکتری باسیلوس کوآگولانس در تولید، ذخیره سازی، حمل و نقل و مدیریت بسیار پایدار است و آن را به کاندیدای مناسب¬تری برای فرمولاسیون های غذایی و دارویی تبدیل می¬کند. باسیلوس کواگولانس یکی از چندین گونه‌ای است که اندوسپور تولید می‌کند که با کمک آن محیط‌های با شرایط سخت را تحمل کند. پروتئین‌های ضد میکروبی کوآگولین و لاکتوسپورین توسط این باکتری تولید می-شود. پپتیدهای ضدمیکروبی به طور سنتی به عنوان نگهدارنده‌های زیستی برای افزایش ماندگاری محصولات غذایی بدون به خطر انداختن خواص تغذیه‌ای و ارگانولپتیک آن‌ها استفاده می‌شوند. در این پژوهش سویه باسیلوس کوآگولانس ATCC 7050 تهیه گردید و بر روی محیط نوترینت آگار کشت داده¬شد. بعد از انجام رنگ¬آمیزی و تست و تایید سویه، سویه از لحاظ فیزیولوژیکی بررسی و منحنی رشد آن رسم شد. همچنین محیط کشت جدیدی طراحی و تولید شد و میزان تولید پپتید در سه محیط¬ (دست ساز، NB، و MRS) با بررسی میزان خاصیت ضد میکروبی سوپرناتانت حاوی ماده ضد میکروبی بر علیه باکتری گرم مثبت استافیلوکوکوس اورئوس با استفاده از روش چاهک آگار مورد ارزیابی قرار گرفت و مقایسه شد. ماده ضد میکروبی تولیدی توسط دستگاه فریزدرایر تغلیظ شده و پایداری نمونه ها در دماهای مختلف و زمان¬های نگهداری مختلف بر اساس میزان خاصیت ضد میکروبی آن‌ها مورد بررسی قرار گرفت. برای تعیین غلظت پروتئین نمونه‌ها تست برادفورد گذاشته شد. علاوه بر آن بهترین زمان و دمای انکوباسیون تولید ماده ضد میکروبی و اثر آن روی سایر باکتری¬های بیماری¬زا ازجمله اشرشیاکلی، لیستریا منوسیتوژنز، آسینتوباکتر بومانی و کلبسیلا پنومونیه مورد بررسی قرارگرفت. پروفایل آمینواسیدی آن نیز با HPLC و حضور ژن¬های پروتئین¬های ضد¬میکروبی کواگولین، سوبتیلین و سوبتیلوزین با انجام PCR و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج نشان دادند که پست بیوتیک تولیدی توسط باسیلوس کوآگولانس روی باکتری¬های بیماری¬زای گرم مثبت بیشتر از باکتری‌های گرم منفی اثر ضدمیکروبی نشان داد. محیط دست¬ساز استفاده شده در این پژوهش با استفاده از 5 درصد عصاره استخوان، 1 درصد پودر مخمر و 2 درصد آگار برای کشت باکتری¬های استافیلوکوکوس اورئوس، اشرشیاکلی و باسیلوس کواگولانس طراحی شد. بهترین روش تغلیظ نمونه ها روش فریزدرایر بود و از میان سه محیط کشت مورد بررسی‌، بر اساس نتایج به‌دست آمده قطر هاله عدم رشد برای باکتری استافیلوکوکوس اورئوس در محیط دست¬ساز (14 میلی متر بعد از تغلیظ نمونه) بهترین نتیجه را در مقایسه با قطر هاله عدم رشد پپتید ضدمیکروبی تولیدی در محیط های NB (12 میلی متر) و MRS (11 میلی متر) داشت که با نتایج حاصل از اندازه‌گیری میزان پروتئین همخوانی داشت. این پروتئین با میزان دوبرابر (30 میکرولیتر) روی باکتری¬های بیماری¬زایی مثل اشرشیاکلی(قطر هاله عدم رشد 12 میلی متر)، لیستریامنوسیتوژنز (قطر هاله عدم رشد 15 میلی متر)، آسینتو باکتر (قطر هاله عدم رشد 7 میلی متر) و کلبسیلاپنومونیه (قطر هاله عدم رشد 6.5 میلی متر) اثر ضدمیکروبی نشان داد. نتایج بررسی پایداری نشان داد که بهترین شرایط نگهداری برای سوپرناتانت حاوی پپتید ضدمیکروبی در دمای 20- درجه سانتی‌گراد و به مدت 4 هفته بود و نیز تا دمای 50 درجه سانتیگراد برای مدت 30 دقیقه فعالیت ضد میکروبی را حفظ نموده و مقاومت دمایی دارد. تولید پپتید ضدمیکروبی در فاز سکون باکتری بود و بهترین شرایط برای تولید پپتید ضدمیکروبی و در محیط دست¬ساز در دمای 37 درجه سانتی‌گراد و بعد از 48 ساعت بدست آمد. طیق نتایج HPLC نیز بیشترین میزان آمینواسید نمونه مربوط به آمینواسید لیزین بود و نتایج PCR نیز حضور باند بین 3000 - 3500 جفت بازی که مربوط به کواگولین است و باند 250-300 جفت بازی که مربوط به سابتیلوزین است را در باسیلوس کوآگولانس ATCC7050 ثابت کرد. توالی باند سابتیلوزین به میزان 100 درصد با ژن سابتیلوزین در گونه Bacillus sp.MD-5 و Bacillus sp.JS مشابهت داشت. در مجموع محیط دست ساز در این مطالعه با وجود قیمت پایین‌تر نسبت به دو محیط دیگر، دارای کارایی خوبی در تولید پپتید ضد میکروبی بود. خصوصیات ضد میکروبی با طیف وسیع برعلیه تعداد زیادی از باکتری‌های گرم مثبت و گرم منفی و نیز مقاومت بالای آن در برابر دما و قابلیت نگهداری طولانی پپتید تولید شده در باکتری باسیلوس کواگولانس ATCC 7050 ، آن را کاندید مناسبی برای استفاده در محصولات پروبیوتیک می‌نماید لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14425 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25588	‭BIO microb I ‭17 1402	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی سویه‌های ووهان و انگلیسی سارس-کوو-2 از طریق تعیین توالی ژنی در بیماران مبتلا به کووید-19 با مشکلات گوارشی (1401) / پورجلالی ، حسام، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه پورجلالی ، حسام، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb ‭39 عنوان : بررسی سویه‌های ووهان و انگلیسی سارس-کوو-2 از طریق تعیین توالی ژنی در بیماران مبتلا به کووید-19 با مشکلات گوارشی عنوان موازی : Evaluation of Wuhan and UK strains of SARS-CoV-2 by sequencing in COVID-19 patients with gastrointestinal problems ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 60ص شابک/شاپا 24673 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب بیماری زا شناسه افزوده : محمدی اصل ، جواد، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها COVID-19، توالی اگزوم، بیماری عفونی  COVID-19, exome sequencing, Digestion چکیده : همه‌گیری‌های ویرانگر، مانند بیماری کووید-19، می‌تواند گواهی قوی بر دانش ما درباره عوامل ژنتیکی و تکاملی حساسیت و شدت بیماری‌های عفونی ارائه دهد. یکی از قابل توجه ترین جنبه های چنین شیوعی، تنوع خیره کننده بین فردی است که در دوره عفونت مشاهده می شود. در دهه‌های اخیر، پیشرفت‌های عظیمی در زمینه ژنتیک انسانی بیماری‌های عفونی صورت گرفته است و تعداد فزاینده‌ای از عوامل ژنتیکی انسانی گزارش شده‌اند که تا حد زیادی تنوع مشاهده شده برای تعداد زیادی از عوامل عفونی را توضیح می‌دهند. با این حال، درک ما از مکانیسم‌های سلولی، مولکولی و ایمنی‌شناختی زیربنای چنین تفاوت‌هایی بین افراد و گروه‌های قومی، بسیار محدود است. در این مطالعه جنبه های مختلف ژنتیکی و همچنین پروتوکل های ارائه شده جهت افتراق و تشخیص کووید 19 اجرا گردید. گروه مورد مطالعه شامل 2 فرد مبتلا کووید 19، مجموعه 30 نفر با نسبت خانوادگی و غیرخانوادگی بود. گروه کنترل شامل تعدادی از افراد کاملا سالم خانواده میباشد که تست های ژنتیکی فقدان ناهنجاری های ژنتیکی در آن ها را اثبات کرده است. طیف گسترده ای از ژنوم گروه هدف (661 ژن) جهت ردیابی ناهنجاری های ژنتیکی مرتبط با کرونا بررسی گردید. نتیجه بررسی توالی یابی ژن‌های SARS COV 2 نشان داد که بعد از استخراج از روی محصول cDNA ساخته شد و به منظور انجام تست توالی‌یابی سنگر که با دستگاه HITACHI در آزمایشگاه نورژن انجام شد به بخش سکانس ارجاع داده و با استفاده از برنامه کروماس (Chromas) آنالیز و پس از خوانش توالی سکانس توسط پرایمر (F،R) و بررسی نتایج توالی‌یابی، وجود تغییر جهش c.A1503T:p.N501Y در خانواده تایید گردید و بعد از انجام آنالیزهای primary، secondary و tertiary بر روی داده‌های حاصل از توالی‌یابی کل اگزوم و بر اساس مقایسه واریانت‌های حاصله c.A1503T:p.N501Y در SARS COV2 ژن کاندید برای بیماری کرونا، یک تغییر بدمعنی شناسایی شد. براساس مطالعه ما، بررسی جامع ژنتیکی نظر به ژن با واریانتSARS COV 2 , c.A1503T:p.N501Y دخیل در جهش کرونا UK، و بررسی مشکل گوارشی در ایران انجام نشده نبود و مطالعات تنها درباره بررسی انواع الگوی کرونا صورت گرفته است. لذا در این تحقیق سعی بر آن بوده است، تا با به کارگیری تکنیک‌های جدید و پیشرفته موثر، جهش‌های جدید مسئول در بیماری های ناشناخته و عوارض آن را مشخص گردد. بدیهی است که شناسایی ژن‌ها و به تبع آن جهش‌های عامل بیماری ، به آشکار شدن ساختار ژنتیکی بیماری و متعاقباً ارتقای روش‌های پیشگیری و مشاوره کمک بسزایی خواهد نمود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13748 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24673	‭BIO microb ‭39	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت