ارتباط چندشکلی های ژنتیکی rs2758339، rs2842980 وrs5746136 ژن سوپر اکسید دیسموتاز 2 با خطر ابتلا به سرطان سینه (1401) / اسدی ، سارا، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه اسدی ، سارا، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 34 عنوان : ارتباط چندشکلی های ژنتیکی rs2758339، rs2842980 وrs5746136 ژن سوپر اکسید دیسموتاز 2 با خطر ابتلا به سرطان سینه عنوان موازی : Association between genetic polymorphisms of rs2758339, rs2842980 and rs5746136 with The Risk of Breast Cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 99ص شابک/شاپا 24580 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی -مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : یوسف نیا ، ساغر، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمانزاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها سرطان سینه، SOD2، rs2758339، rs2842980، rs5746136، PCR-RFLP breast cancer, SOD2, rs2758339, rs2842980, rs5746136 چکیده : سرطان سینه شایع ترین سرطان در بین زنان است که تا یک سوم جمعیت آنها را در طول عمرشان مبتلا می کند. پلی مورفیسم های ژنتیکی می توانند خطر ابتلا به سرطان سینه را به دلیل تغییر در بیان ژن یا ساختار پروتئین تغییر دهند. یکی از عوامل سرطانزا استرس اکسیداتیو است که نقش مهمی در ایجاد سرطان سینه دارد. سوپراکسید دیسموتاز 2 (SOD2) یکی از آنزیم های آنتی اکسیدانی کلیدی است که مسئول سم زدایی گونه های فعال اکسیژن در میتوکندری است و نقش مهمی در حفظ تعادل رادیکال های آزاد در بدن انسان دارد. تاکنون چندین پلی مورفیسم در ژن کد کننده SOD2 تعریف شده است که با انواع سرطان ها ارتباط داشته اند. هدف از مطالعه حاضر بررسی ارتباط بین پلی مورفیسم های rs2758339، rs2842980 وrs5746136 و خطر ابتلا به سرطان سینه در زنان ایرانی است. این مطالعه شامل 100 بیمار مبتلا به سرطان سینه و 100 فرد سالم به عنوان گروه شاهد بود. DNA ژنومی از نمونه های خون استخراج و تعیین ژنوتیپ با استفاده از روشهای PCR و RFLP انجام شد و در پایان آنالیز آماری توسط نرم افزار SSPS صورت گرفت. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که پلی¬مورفیسم rs5746136 واقع در ناحیه ترجمه نشده (3'UTR) ژن SOD2 با افزایش خطر ابتلا به سرطان سینه ارتباط معنادار دارد، اما پلی¬مورفیسم¬های rs2758339 و rs2842980 ارتباط معناداری با ابتلا به سرطان سینه نشان ندادند. در مجموع نتایج این مطالعه نشان می دهد که پلی¬مورفیسم rs5746136 می تواند به عنوان یک مارکر ژنتیکی در تشخیص سرطان سینه مورد استفاده قرار گیرد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13655 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24580 BIO gen 34 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت ارتباط چندشکلی ژنتیکی miR-32 C>A (rs7041716) با خطر ابتلا به سرطان سینه (1401) / امیرآبادی ، سیده زهرا، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه امیرآبادی ، سیده زهرا، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 29 عنوان : ارتباط چندشکلی ژنتیکی miR-32 C>A (rs7041716) با خطر ابتلا به سرطان سینه ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 58ص شابک/شاپا 24575 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی -مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : یوسف نیا ، ساغر، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد راهنما آهنگرزاده ، شهرزاد، استاد مشاور توصیفگرها سرطان پستان،miR32 ،arms PCR ، rs7041716 Breast cancer, MIR32, arms PCR, rs7041716 چکیده : مقدمه: سرطان پستان شایع ترین سرطان تشخیص داده شده در زنان است و رتبه دوم را در بین علل مرگ ناشی از سرطان در زنان دارد. شواهد موجود در پژوهش های مختلف نشان داده است که تحقیقات گذشته و در حال انجام، نتایج زیادی را درمورد مکانیسم های تشخیصی و درمانی در مورد سرطان پستان دارند. این امر به پیشرفت های صورت گرفته در حوزه غربالگری، تشخیص و استراتژی های درمانی درگیر در مدیریت سرطان پستان نسبت داده کمک کرده است. در این مطالعه، به بررسی پیرامون یکی از پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNP) بالقوه (rs7041716) در ژن غیر کد کننده ی پروتئین miR32 در بیماران سرطان پستان پرداخته شد. درک مکانیسم عملکردی SNP ها در ژن های مختلف کد کننده و غیر کد کننده به یافتن نشانگر های زیستی پیش آگهی دهنده و تشخیصی جدید در بیماران سرطانی کمک می کند.
روش: یافتن فراوانی ژنوتیپی و اللی rs7041716 (C > A) در ژن miR32 توسط متد PCR ARMS صورت گرفت. آنالیز آماری داده های ژنوتیپ و الل و مقایسه ی فراوانی ها در نمونه های سرطان پستان و کنترل توسط نرم افزار SPSS صورت گرفت. محاسبه ی نسبت شانس برای یافتن ارتباط افزایشی یا کاهشی ریسک ابتلا یا پیشرفت سرطان پستان در نمونه های بیماران با الل جهش (C) توسط SPSS صورت گرفت. محاسبه ی مدل های ژنوتیپی غالب، مغلوب و هم بارز نیز برای یافتن بهترین مدل ژنوتیپی بالقوه در rs7041716 و بررسی تاثیر افزایشی یا کاهشی مدل ژنوتیپی مذکور در ریسک ابتلا به بیماری سرطان پستان صورت گرفت.
نتایج: آنالیز آماری داده های ژنوتیپی و اللی نشان دهنده ی افزایش فراوانی الل A و ژنوتیپ AA در نمونه های سرطان پستان نسبت به نمونه های سالم بود. آنالیز نسبت شانس نشان دهنده ی ارتباط مستقیم فراوانی الل A با افزایش ریسک ابتلا به سرطان پستان بود. آنالیز مدل های ژنوتیپی نشان داد که اللA در ژنوتیپ هتروزیگوت (AC) به بیشترین شکل ممکن ریسک ابتلا به بیماری سرطان پستان را افزایش می دهد. این الل در ژنوتیپ AC ریسک ابتلا به بیماری را حدود 2.9 برابر افزایش می دهد.
نتیجه گیری: miR32 به عنوان یکی از ژن های غیر کد کننده ی پروتئین می تواند یکی از ژن های مهم دخیل در افزایش ریسک ابتلا به سرطان پستان محسوب شود. پلی مورفیسم rs7041716 به عنوان یکی از مهم ترین تغییرات نوکلئوتیدی در این ژن است که می تواند ریسک ابتلا به بیماری سرطان پستان را افزایش دهد. درک بیشتر این ناحیه از miR32 می تواند منجر به یافتن یکی از اهداف تشخیصی و درمانی سرطان پستان محسوب شودلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13650 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24575 BIO gen 29 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی ارتباط پلی¬مورفیسم های rs6877842، rs10719 و rs642321 در آنزیم Drosha با سرطان پستان (1400) / تقی پور کمال آباد ، ستاره، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه تقی پور کمال آباد ، ستاره، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 24 عنوان : بررسی ارتباط پلی¬مورفیسم های rs6877842، rs10719 و rs642321 در آنزیم Drosha با سرطان پستان عنوان موازی : Relationship Study of rs6877842, rs10719 and rs642321 Polymorphisms in Drosha with Breast Cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: 78ص شابک/شاپا 24570 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی سلولی-مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما رضائی ، حلیمه، استاد مشاور طباطبائیان ، مریم، استاد مشاور توصیفگرها سرطان پستان، DROSHA، rs642321، rs10719، rs6877842 Breast cancer, DROSHA, rs642321, rs10719, rs6877842 چکیده : سرطان پستان شایع¬ترین سرطان در میان زنان سراسر جهان و عامل اصلی مرگ ناشی از سرطان می¬باشد. میزان بروز سرطان پستان در کشورهای در حال توسعه رو به افزایش است. پلیمورفیسمهای تک نوکلئوتیدی (SNPs) در مسیرهای بیوسنتز microRNA ممکن است منجر به کاهش یا افزایش عملکرد microRNA شده که به نوبه خود میتواند به عنوان یک عامل سرطانزا یا سرکوبکننده تومور عمل نماید. اختلال در ژن¬های مسیر بیوژنز microRNA در شروع و پیشرفت چندین سرطان انسانی از جمله سرطان پستان مشاهده شده است. SNP ها در ژن¬های مسیر بیوژنز microRNA با خطر سرطان پستان مرتبط هستند. یکی از مهم¬ترین ژن ها در این زمینه DROSHA می¬باشد. مطالعات قبلی نشان داده است که rs642321، rs10719 و rs6877842به طور قابل توجهی با خطر ابتلا به سرطان¬های مختلف مرتبط است. در این مطالعه مورد-شاهدی از 100 فرد مبتلا به سرطان پستان و 100 فرد سالم برای ارزیابی ارتباط بین این پلی¬مورفیسم¬ها در DROSHA و خطر ابتلا به سرطان پستان استفاده شد. DNA ژنومی از نمونه های خون استخراج شد. از تکنیک ARMS PCR برای ارزیابی rs10719 و rs6877842 و از تکنیک Tetra ARMS PCR برای بررسی rs642321 توسط پرایمرهای طراحی شده، استفاده شد. آنالیز آماری توسط نرم افزار SPSS صورت گرفت. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که پلی¬مورفیسم rs642321 واقع در ناحیه ترجمه نشده (3'UTR) ژن DROSHA با افزایش خطر ابتلا به سرطان پستان مرتبط است. اما پلی¬مورفیسم¬های rs10719 وrs6877842 ارتباطی با ابتلا به سرطان پستان نشان ندادند. در مجموع، نتایج ما نشان داد که وجود پلیمورفیسم rs642321در آنزیم DROSHA میتواند نشانگر تومور مناسبی در بیماران مبتلا به سرطان پستان باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13645 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24570 BIO gen 24 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی تغییرات و همبستگی بیان RNA های طویل غیر کد کننده ی ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 در نمونه های سرطان معده (1401) / محبی ، فاطمه، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه محبی ، فاطمه، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 40 عنوان : بررسی تغییرات و همبستگی بیان RNA های طویل غیر کد کننده ی ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 در نمونه های سرطان معده عنوان موازی : Differential expression and correlation analysis of ITFG2-AS1 and MMP25-AS1 long non-coding RNAs in gastric cancer sample ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 63ص شابک/شاپا 24728 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد:رشته ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد مشاور توصیفگرها سرطان معده، lncRNA، ITFG2-AS1، MMP25-AS1، qRT-PCR، بیوانفورماتیک Gastric cancer, lncRNA, ITFG2-AS1, MMP25-AS1, qRT-PCR, Bioinformatics چکیده : سرطان معده رتبه دوم را در مرگ و میر ناشی از سرطان دارد. یکی از روش های عملی برای پیشگیری، مدیریت و کنترل بدخیمی هایی مانند سرطان، بررسی وضعیت پروفایل بیان ژن است. lncRNAها تنظیم کننده های مهم فرآیندهای سلولی هستند که این فرایندها معمولاً در سرطان معده به درستی تنظیم نمی شوند. بیان نابجای lncRNA ها با سرطان معده مرتبط است و lncRNA های خاصی در تشخیص و پیش آگهی نقش دارند. در این مطالعه، سطوح بیان RNA طولانی غیر کدکننده (lncRNA) ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 در بیماران سرطان معده ارزیابی شد. در این بررسی، آنالیزهای بیوانفورماتیکی برای بررسی کیفیت نمونه ها و آنالیز تغییر بیان این lncRNA ها انجام شدند. RNA از نمونه های بافتی استخراج شدند و سنجش کمی آنها انجام شد. سپس سنتز cDNA و طراحی پرایمر ویژه برای هریک از lncRNA ها و ژن خانه داری (GAPDH) انجام شد و با استفاده از سیستم Real-Time PCR سطح بیان نسبی هر lncRNA بین بافت توموری و سالم بررسی شد. در نهایت تجزیه و تحلیل های آماری داده ها توسط GraphPad Prism انجام شد. آنالیز میکرواری نشان داد که نمونه های مورد بررسی دارای کیفیت مناسب بودند و این دو lncRNA دارای افزایش بیان معناداری در نمونه های بیمار نسبت به نمونه های سالم می باشند. به منظور تایید نتایج حاصل از آنالیز داده های microarray، از پایگاه داده ی ENCORI برای آنالیز تغییر بیان این lncRNA ها استفاده شد و نشان داد که بیان هر دو lncRNA در نمونه های سرطان معده نسبت به نمونه های سالم دارای افزایش بیان معنادار بودند. از ازمایشReal-time PCR برای ارزیابی تغییرات در سطح بیان lncRNA های انتخابی استفاده شد و نشان دهنده ی افزایش بیان معنادار ژن های ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 در بیماران سرطان معده نسبت به نمونه های سالم بود. ارتباطی بین بیان ژن های ذکر شده با موقعیت های کلینیکوپاتولوژیک در نمونه های سرطان معده مشاهده نشد. به منظور بررسی پتانسیل بیومارکری (تشخیصی) lncRNA ها برای سرطان معده، آنالیز ROC بر داده های بیانی ژن های مطرح شده انجام شد و مشخص شد کهlncRNA ITFG2-AS1 می تواند به عنوان یک نشانگر زیستی قابل قبول برای نمونه های سرطان معده معرفی شود.
بر اساس آنالیز Pearson میان سطح بیان MMP25-AS1 و ITFG2-AS1 در نمونه های سرطان معده همبستگی مثبت معنادار قابل توجهی مشاهده می شود. این همبستگی بیانگر اثر احتمالی افزاینده ی بیان lncRNA های ذکر شده بر بیان یکدیگر است. بر اساس این مطالعه ی انجام شده، lncRNA های ITFG2-AS1 و MMP25-AS1 می توانند دو انکوژن مهم در بیماران سرطان معده محسوب شوند. از طرفی، ITFG2-AS1 می تواند به عنوان یک نشانگر زیستی تشخیصی مهم برای شناسایی زودهنگام افراد دارای ریسک ابتلا به بیماری سرطان معده معرفی شود. این دو lncRNA می توانند بر سطح بیان یکدیگر اثرگذاری داشته باشند و مجموعا در تغییر ریسک ابتلا به بیماری سرطان معده تاثیرگذار باشندلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13794 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24728 BIO gen 40 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی سویههای ووهان و انگلیسی سارس-کوو-2 از طریق تعیین توالی ژنی در بیماران مبتلا به کووید-19 با مشکلات گوارشی (1401) / پورجلالی ، حسام، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه پورجلالی ، حسام، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 39 عنوان : بررسی سویههای ووهان و انگلیسی سارس-کوو-2 از طریق تعیین توالی ژنی در بیماران مبتلا به کووید-19 با مشکلات گوارشی عنوان موازی : Evaluation of Wuhan and UK strains of SARS-CoV-2 by sequencing in COVID-19 patients with gastrointestinal problems ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 60ص شابک/شاپا 24673 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب بیماری زا شناسه افزوده : محمدی اصل ، جواد، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها COVID-19، توالی اگزوم، بیماری عفونی COVID-19, exome sequencing, Digestion چکیده : همهگیریهای ویرانگر، مانند بیماری کووید-19، میتواند گواهی قوی بر دانش ما درباره عوامل ژنتیکی و تکاملی حساسیت و شدت بیماریهای عفونی ارائه دهد. یکی از قابل توجه ترین جنبه های چنین شیوعی، تنوع خیره کننده بین فردی است که در دوره عفونت مشاهده می شود. در دهههای اخیر، پیشرفتهای عظیمی در زمینه ژنتیک انسانی بیماریهای عفونی صورت گرفته است و تعداد فزایندهای از عوامل ژنتیکی انسانی گزارش شدهاند که تا حد زیادی تنوع مشاهده شده برای تعداد زیادی از عوامل عفونی را توضیح میدهند. با این حال، درک ما از مکانیسمهای سلولی، مولکولی و ایمنیشناختی زیربنای چنین تفاوتهایی بین افراد و گروههای قومی، بسیار محدود است. در این مطالعه جنبه های مختلف ژنتیکی و همچنین پروتوکل های ارائه شده جهت افتراق و تشخیص کووید 19 اجرا گردید. گروه مورد مطالعه شامل 2 فرد مبتلا کووید 19، مجموعه 30 نفر با نسبت خانوادگی و غیرخانوادگی بود. گروه کنترل شامل تعدادی از افراد کاملا سالم خانواده میباشد که تست های ژنتیکی فقدان ناهنجاری های ژنتیکی در آن ها را اثبات کرده است.
طیف گسترده ای از ژنوم گروه هدف (661 ژن) جهت ردیابی ناهنجاری های ژنتیکی مرتبط با کرونا بررسی گردید. نتیجه بررسی توالی یابی ژنهای SARS COV 2 نشان داد که بعد از استخراج از روی محصول cDNA ساخته شد و به منظور انجام تست توالییابی سنگر که با دستگاه HITACHI در آزمایشگاه نورژن انجام شد به بخش سکانس ارجاع داده و با استفاده از برنامه کروماس (Chromas) آنالیز و پس از خوانش توالی سکانس توسط پرایمر (F،R) و بررسی نتایج توالییابی، وجود تغییر جهش c.A1503T:p.N501Y در خانواده تایید گردید و بعد از انجام آنالیزهای primary، secondary و tertiary بر روی دادههای حاصل از توالییابی کل اگزوم و بر اساس مقایسه واریانتهای حاصله c.A1503T:p.N501Y در SARS COV2 ژن کاندید برای بیماری کرونا، یک تغییر بدمعنی شناسایی شد. براساس مطالعه ما، بررسی جامع ژنتیکی نظر به ژن با واریانتSARS COV 2 , c.A1503T:p.N501Y دخیل در جهش کرونا UK، و بررسی مشکل گوارشی در ایران انجام نشده نبود و مطالعات تنها درباره بررسی انواع الگوی کرونا صورت گرفته است. لذا در این تحقیق سعی بر آن بوده است، تا با به کارگیری تکنیکهای جدید و پیشرفته موثر، جهشهای جدید مسئول در بیماری های ناشناخته و عوارض آن را مشخص گردد. بدیهی است که شناسایی ژنها و به تبع آن جهشهای عامل بیماری ، به آشکار شدن ساختار ژنتیکی بیماری و متعاقباً ارتقای روشهای پیشگیری و مشاوره کمک بسزایی خواهد نمودلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13748 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24673 BIO microb 39 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی و مقایسه تاثیر چهار نانوادجوانت آلومینیوم هیدروکساید، سلنیوم، کلسیم فسفات و اکسیدآهن در ایمنی زایی پروتئین کایمریک بروسلا (1401) / گودرزی ، طاهره، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه گودرزی ، طاهره، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 26 عنوان : بررسی و مقایسه تاثیر چهار نانوادجوانت آلومینیوم هیدروکساید، سلنیوم، کلسیم فسفات و اکسیدآهن در ایمنی زایی پروتئین کایمریک بروسلا عنوان موازی : Evaluation and comparison of the effect of four nanoadjuvants of Aluminum Hydroxide, Selenium, Calcium phosphate and Iron Oxide on the immunogenicity of Brucella chimeric protein ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 92ص شابک/شاپا 24572 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشتهزیست شناسی سلولی مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : فصیحی-رامندی ، مهدی، استاد راهنما زمانزاده ، زهرا، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها بروسلا، پروتئین کایمریک، کلسیم فسفات، هیدروکسیدآلومینیوم، سلنیوم، اکسیدآهن Brucella, Chimeric protein, Calcium phosphate, Aluminum hydroxide, Selenium, Iron oxide چکیده : بیماری بروسلوز یا تب مالت، یکی از رایجترین بیماریهای مشترک بین انسان و دام میباشد که عامل اصلی آن، گروهی از باکتری¬های درون سلولی به نام بروسلا می¬باشد و سالانه بیش از نیم میلیون نفر را مبتلا میکند. همچنین این باکتری به علت بیماریزایی در حیوانات اهلی و دامها، موجب خسارات اقتصادی زیادی میشود. درحال حاضر بهمنظور کنترل این بیماری، از واکسنهای تجاری تخفیف حدت یافته و یا غیرفعال استفاده میشود؛ با این حال، بهعلت برخی معایب این سویه از واکسنها مانند بیماریزایی در انسان و سقط جنین در حیوانات باردار، ناباروری و کاهش تولید شیر استفاده از آنها محدود شده است. واکسنهای زیرواحدی بهعنوان یک استراتژی جایگزین در نظر گرفته میشوند اما بهعلت ایمنیزایی ضعیف، نیازمند همراهی با ادجوونتها میباشند. نانوذرات یکی از پرکاربردترین ادجوونتهای مورد استفاده در واکسیناسیون میباشند. هدف از این مطالعه بررسی ایمنیزائی پروتئین کایمریک حاوی آنتیژنهای trigger factor، Omp31 و Bp26 از بروسلا (TOB) به همراه نانوذرات کلسیمفسفات (CaPNPs)، هیدروکسیدآلومینیوم (AHNPs)، سلنیوم (SeNPs) و اکسیدآهن (IONPs) به عنوان نانوواکسن در مدل موشی بود. بدین منظور، پروتئین کایمریک در باکتریE. Coli BL21 (DE3) بیان شد و پس از تخلیص با نانوذرات مخلوط گردید. تیتر آنتیبادی در خون اندازهگیری شد و در پایان، موشهای واکسینه شده با سویه ویرولانس بروسلا ملیتنسیس 16M به چالش کشیده شدند. نتایج مؤید افزایش تیتر آنتی¬بادی (IgG) علیه پروتئین کایمریک در تمامی گروه¬های موشی واکسینه شده با نانوواکسن بود. تعیین نسبت ایزوتایپ IgG2a/IgG1 در گروههای AHNP-TOB ,IONP-TOB و SeNP-TOB بیانگر القای پاسخ ایمنی همورال (Th2) بود؛ در حالی که گروهCaPNP-TOB توانست پاسخ¬های قوی ایمنی سلولی (Th1) را برانگیزد. نتایج چالش نیز نشان داد گروه نانوذرات CaP بیشترین سطح ایمنی محافظتی را در برابر عفونت بروسلا ایجاد کردند. درمجموع این مطالعه نشان داد که فرمولاسیون پروتئین کایمریک با نانوذره کلسیم فسفات میتواند کاندید واکسن امیدوارکنندهای علیه بیماری بروسلوز باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13647 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24572 BIO gen 26 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی همراهی میزان بیان 5571 miR- با فاکتورهای بالینی و پیشگویی ژن های هدف کلیدی آن در سرطان پستان (1400) / سمیع قهفرخی ، مهشید، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه سمیع قهفرخی ، مهشید، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 17 1400 عنوان : بررسی همراهی میزان بیان 5571 miR- با فاکتورهای بالینی و پیشگویی ژن های هدف کلیدی آن در سرطان پستان عنوان موازی : Association of miR‐5571 expression with clinicopathological factors and prediction of its hub target genes in breast cancer ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: ز، 79ص شابک/شاپا 23934 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: ژنتیک شناسه افزوده : رئیسی ، سمیه، استاد راهنما زمان زاده ، زهرا، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها breast cancer miRNA miR-5571 Realtime PCRسرطان پستان miRNA miR-5571 Realtime PCR چکیده : سرطان پستان یک مشکل عمده سلامتی است که از هر هشت زن در سراسر جهان یکی به این بیماری مبتلا است. تشخیص سرطان پستان در مراحل اولیه منجر¬به نتایج بهتر درمان و بقای طولانی مدت بیمار می¬شود. تحقیقات گسترده نشان داده¬است که miRNAها در کلیه مراحل سرطان پستان دچار اختلال بیان هستند. miRNA ها دسته ای از مولکول های RNA کوچک غیر کد کننده هستند که می¬توانند بیان ژن¬های هدف را در سطح پس از رونویسی تنظیم کنند و به¬راحتی قابل دسترسی و اندازه¬گیری هستند. این امکان وجود دارد که نقش های متنوعی که miRNA ها بازی می¬کنند، توانایی ارائه اطلاعات ارزشمند در یک محیط بالینی را داشته باشد و ضمن اینکه فرآیند تصمیم گیری درمان را مشخص می¬کند، می¬توانند به عنوان ابزار غربالگری برای طبقه بندی بیماران پر خطر عمل کنند. شواهد نشان می¬دهد که برخی از miRNA ها حتی ممکن است در تشخیص بیماران مبتلا به سرطان پستان کمک کنند. علاوه بر این، miRNA ها ممکن است با مهار یا ورود مجدد یک miRNA خاص که قادر به ایجاد پاسخ در داخل بدن است، بعنوان اهداف درمانی در نظر گرفته شوند. در این مطالعه با استفاده از miR-5571 و ژن U6 50 نمونه بافت توموری پستان و 50 نمونه بافت غیرتوموری مجاور مورد بررسی قرارگرفته¬است. سپس RNA آن¬ها استخراج و برای بررسی بیان miR-5571 در این نمونه¬ها، ابتدا پرایمر اختصاصی طراحی شده و سپس سنتز cDNA مخصوص miR-5571 انجام شده-است. cDNA های اختصاصی توسط پرایمرهای miRNA با روش qPCR مورد بررسی قرار گرفته¬است. همچنین از تکنیک¬های مختلف مانند Real time PCR و الکتروفورز ژل آگارز نیز استفاده شده¬است. در این مطالعه نسبت بیان دو ژن با استفاده از روش محاسباتی ΔΔCt محاسبه شده¬است و جهت تجزیه و تحلیل داده¬ها از نرم¬افزار SPSS و آزمون T-test و ANOVA استفاده شده¬است. به منظور بررسی هدف های کلیدی miR-5571 از سایت¬های 7.2 targetScan، miRmap و miRWalk استفاده شده¬است. بر اساس نتایج بدست آمده در این مطالعه، افزایش میزان بیان miR-5571 در بافت سرطانی پستان نسبت به بافت سالم مشاهده شد و با افزایش درجه توموری، بیان miR-5571 افزایش یافت. همچنین با بررسی منحنی¬های کاپلان مایر مشخص شد که افزایش بیان miR-5571 با کاهش بقا ارتباط دارد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13132 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 23934 BIO gen 17 1400 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت شناسایی عوامل عفونت های مقاربتی با روش مولتی پلکس پی سی ار در مراکز بیمارستانی شهر های مختلف ایران (1400) / شله رنگ کن نژاد اصفهانی ، مهسا، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه شله رنگ کن نژاد اصفهانی ، مهسا، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 21 عنوان : شناسایی عوامل عفونت های مقاربتی با روش مولتی پلکس پی سی ار در مراکز بیمارستانی شهر های مختلف ایران عنوان موازی : Detection of Sexually Transmitted Infections by Multiplex PCR: Multi center in Iran ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: 70ص شابک/شاپا 24370 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته ژنتیک گرایش ژنتیک شناسه افزوده : فخیم ، حامد، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد راهنما نصری ، الهه، استاد مشاور توصیفگرها بیماری های مقاربتی، شناسایی ملکولی، گاردنرلا واژینالیس، کلامیدیا تراکوماتیس، تریکوموناس واژینالیس : sexually transmitted diseases, molecular detection, Gardnerella vaginalis, Chlamydia trachomatis, Trichomonas vaginalis چکیده : عفونت ها که در حین رابطه جنسی و مقاربت از شخصی به شخص دیگر انتقال پیدا کند عفونت مقاربتی یا Sexually Transmitted Infection (STI) نامیده می شود که بر اساس گزارشات سازمان بهداشت جهانی (WHO) بیش از 340 میلیون مورد جدید از بیماری های منتقل شده جنسی، سالانه در سراسر جهان با بالاترین میزان بروز در کشورهای در حال توسعه اتفاق می افتد. در صورت عدم تشخیص و درمان، این عفونت ها مزمن شده و می توانند عوارض برگشت ناپذیری مانند ناتوانی جنسی، ناباروری و سرطان دستگاه تناسلی و حتی مشکلات روانی را در پی داشته باشد هم چنین قابل انتقال به همسر و شرکای جنسی بوده که در نهایت باعث افزایش شیوع بیماری ها در جامعه خواهد شد، ضمن اینکه در زنان حامله امکان انتقال عفونت به نوزاد هنگام تولد وجود دارد. طبق مطالعات انجام شده بیماری لگن، ناباروری، حاملگی خارج رحمی، درد لگن مزمن، مرگ و میر نوزادان و سرطان دستگاه تناسلی همه تا حدودی با عفونت های مقاربتی همراه بوده اند؛ کلامیدیا تراکوماتیس، مایکوپلاسما ژنیتالیوم، نایسریا گونوره آ، تریکوموناس واژینالیس، ترپونما پالیدوم و هرپس سیمپلکس ویروس از شایع ترین عوامل ایجادکننده عفونت های مقاربتی هستند که این عوامل موجب تغییر PH واژن و میزان فلور طبیعی آن و در نتیجه عفونت واژن و دهانه رحم می شوند. هدف از این مطالعه شناسایی عوامل عفونت های مقاربتی با استفاده از روش Multiplex-PCR بود. در این پژوهش از 571 زن دارای علائم عفونتی مراجعه کننده به مراکز درمانی ، از 15 استان مختلف ایران، با استفاده از سواب واژینال نمونه گیری انجام شده و بررسی 8 عامل بیماری زای عفونت مقاربتی (گاردنرلا واژینالیس، کلامیدیا تراکوماتیس، تریکوموناس واژینالیس، ماکوپلاسما ژنیتالیوم، نایسریا گنوره آ، ترپونما پالیدیوم و هرپس سیمپلکس تیپ 1و 2) در این مراجعه کنندگان به مراکز درمانی، با استفاده ار روش Multiplex-PCR انجام گرفت. در مجموع 113 فرد (19/78%) مبتلا به بیماری های مقاربتی بودند که شیوع عوامل بیماری زا به ترتیب شامل: 86 گاردنرلا واژینالیس (76/10%) ، 17 کلامیدیا تراکوماتیس (15/4%) ، 5 تریکوموناس واژینالیس (4/40%)، 4 هرپس سیمپلکس تیپ 2 (3/53%)، هرپس سیمپلکس تیپ 1 (0/88%) و 1 مایکوپلاسما ژنیتالیوم (0/88%) شناسایی شدند. درصد قابل توجهی از جامعه مورد بررسی دچار بیماری های مقاربتی بودند. بیشترین شیوع مربوط به گاردنرلا واژینالیس درگروه سنی که از لحاظ جنسی فعال بودند، شناسایی شد. با توجه به شیوع بیماری های مقاربتی و عوارض آن ها امید بر این است این پژوهش راهکاری جهت بررسی های بیشتر این بیماری ها در سطح کشور بوده باشد. در مجموع نتایج نشان داد که روش Multiplex PCR یک روش دقیق و حساس جهت تشخیص انواع عفونت های مقاربتی می باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13445 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24370 BIO gen 21 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت شناسایی مولکولی کلونیزاسیون عوامل قارچی از نمونههای آسپیره تراشه بیماران مبتلا به سرطان و کووید 19 بستری در بخش مراقبتهای ویژه بیمارستانهای سید الشهدا و الزهرا اصفهان (1400) / خدابخش ، مهنوش، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه خدابخش ، مهنوش، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 23 عنوان : شناسایی مولکولی کلونیزاسیون عوامل قارچی از نمونههای آسپیره تراشه بیماران مبتلا به سرطان و کووید 19 بستری در بخش مراقبتهای ویژه بیمارستانهای سید الشهدا و الزهرا اصفهان عنوان موازی : Molecular characterization of airway yeast colonization in tracheal aspirates of cancer patients with or without SARS-CoV2 infection admitted to the intensive care unit in Isfahan, Iran ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: 100ص شابک/شاپا 24569 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی -مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : فخیم ، حامد، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد راهنما توصیفگرها شناسایی مولکولی، کلونیزاسیون مخمر، کووید-۱۹، گونه های کاندیدا، بیماران دچار نقص ایمنی، بخش مراقبتهای ویژه Molecular characterization, yeast colonization, COVID-19, Candida species, Cancer patients, intensive care unit چکیده : بیماری همهگیر کروناویروس 2019 (COVID-19) در اواخر سال 2019 در شهر ووهان چین ظاهر شد و به سرعت در سراسر جهان گسترش یافت. عفونت حتی در صورت تشخیص و درمان مناسب با عوارض و مرگ و میر قابل توجهی مرتبط هست. مطالعات اخیر نشان داده است که SARS CoV-2 ممکن است خطر ابتلا به عفونتهای باکتریایی و قارچی را افزایش دهد. در حال حاضر نگرانی فزایندهای در مورد ارتباط بین عفونتهای قارچی و بیماران مبتلا به نقص ایمنی وجود دارد. در میان عوامل مختلفی که منجر به عوارض و مرگ و میر در بیماران کووید-19 میشود، شیوع و نقش عفونتهای همزمان قارچی هنوز مورد بحث قرار نگرفته است. این مطالعه بر روی نمونههای آسپیراسیون تراشه بیماران مبتلا به سرطان با یا بدون عفونت کووید در بخش مراقبتهای ویژه (ICU) مراجعه کننده به بیمارستان امید و الزهرا اصفهان، با هدف شناسایی مولکولی کلونیزاسیون مخمری در نمونههای آسپیره تراشه بیماران نقص ایمنی با یا بدون عفونت کووید با روشهای تشخیصی روتین و مولکولی انجام شد. مشخصات دموگرافیک، عوامل مستعد کننده، یافتههای بالینی بیماران با تشخیص بالینی مورد ارزیابی و تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نمونههای آسپیره تراشه جمعآوری، انتقال و مورد بررسی قرار گرفت و سپس بر روی محیط کشت سابورو دکستروز آگار و کروم آگار کاندیدا کشت داده شد. DNA ژنومی به روش جوشاندن استخراج و بر اساس روشهای مختلف مولکولی با تکنیک ITS-RFLP -PCR ، تکثیر ژن HWP1 و ITS، دو نوع Multiplex PCR جهت شناسایی کمپلکس های کاندیدا گلابراتا و کاندیدا پاراپسیلوزیس و درنهایت تعیین توالی ناحیه ITS مورد بررسی قرار گرفت. در مجموع 161 نمونه از بیماران مبتلا با (50٪/61) یا بدون عفونت کووید (5٪/38) به دست آمد. شناسایی مولکولی نشان داد که کاندیدا آلبیکنس (65٪/51)، کاندیدا گلابراتا (36٪/22)، کاندیدا تروپیکالیس (40٪/17)، کاندیدا کروزهای (48٪/2)، 2 گونهی کاندیدا فاماتا (24٪/1)، کاندیدا پاراپسیلوزیس (62٪/0)، کاندیدا لوزیتانیا (62٪/0)، کاندیدا کفیر (10٪/3) و گونههای غیر معمول مخمر مانند، ویکرهامومایسس انومالوس (62٪/0) بودند. شیوع گونههای کاندیدا هیچ ارتباط آماری معنیداری با سن، جنس و بیماران دچار نقص ایمنی با یا بدون عفونت SARS-CoV2 در بخش مراقبتهای ویژه(ICU) نشان نداد (05/0 P>). با توجه به نتایج حاصل از این مطالعه میتوان نتیجه گرفت که شیوع عفونت همزمان قارچی کاندیدا آلبیکنس در بیماران مبتلا به سرطان و کووید-19 نسبت به غیر البیکنس بیشتر میباشد و اینکه استفاده از تکنیکهای PCR ناحیه ژنی HWP1، PCR ناحیه ژنی ITS، ITS-RFLP، PCR چندگانه جهت شناسایی کمپلکسهای کاندیدا گلابراتا و کاندیدا پاراپسیلوزیس و همچنین تعیین توالی ناحیه ژنی ITS جهت تشخیص انواع گونههای قارچی توصیه میشود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13644 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24569 BIO gen 23 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت شناسایی پلی مورفیسم ژن های فاکتور V Leiden (G1691A)و متیلن تتراهیدروفولات ردوکتاز((MTHFR مستعد کننده ترومبوفیلی با استفاده از روش های مولکولی (1401) / زمانی فروشانی ، زهرا، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه زمانی فروشانی ، زهرا، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 31 عنوان : شناسایی پلی مورفیسم ژن های فاکتور V Leiden (G1691A)و متیلن تتراهیدروفولات ردوکتاز((MTHFR مستعد کننده ترومبوفیلی با استفاده از روش های مولکولی عنوان موازی : Identification of polymorphisms of factor V Leiden (G1691A) and methylene tetrahydrofolate reductase (MTHFR) thrombophilia predisposing genes using molecular methods ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 78ص شابک/شاپا 24577 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی -مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : فخیم حاجی آقائی ، حامد، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد راهنما توصیفگرها ترومبوفیلی، فاکتور V Leiden (G1691A)، متیلن تتراهیدروفولات ردوکتاز، واکنش زنجیره ای پلیمراز اختصاصی- آلل، واکنش زنجیره ای ARMS چهار پرایمری Thrombophilia, factor V Leiden (G1691A), Methylene tetrahydrofolate reductase, Allele-specific PCR , tetra-primer ARMS PCR چکیده : ترومبوفیلی یک مشکل بزرگ در سلامت عمومی می باشد که شایع و قابل پیشگیری بوده و میزان عود بالایی دارد. این بیماری در اثر نقص در سیستم انعقادی به وجود می آید و با تمایل به ایجاد ترومبوز در وریدها وشریانها مشخص میشود. ترومبوآمبولی وریدی سومین بیماری عروقی شایع پس از بیماری عروق کرونر و سکته است که می تواند به صورت ارثی یا اکتسابی باشد. اختلالات ترومبوفیل ارثی شامل جهش فاکتور V Leiden (G1691A)، مقاومت و جهش در متیلن تتراهیدروفولات ردوکتاز(MTHFR)، جهش ژن پروترومبین وغیره می باشد. هدف از این مطالعه شناسایی پلی مورفیسم ژن های فاکتور V Leiden (G1691A) و متیلن تتراهیدروفولات ردوکتاز((MTHFR مستعد کننده ترومبوفیلی با استفاده از روش های مولکولی می باشد که در این راستا 109 فرد مشکوک به ترومبوفیلی مراجعه کننده به مراکز درمانی شهرهای مختلف ایران با روش های Allele-specific PCR و tetra-primer ARMS PCR بررسی شدند. نمونه ها تا زمان استخراج در دمای 4درجه سانتی گراد نگهداری شد. استخراج DNAبا استفاده از کیت ستونی Add bio ، طبق دستورالعمل کیت انجام شد. داده ها به کمک نرم افزار اکسل ثبت شد. تحلیل نتایج نشان داد از 109 بیمار با رده سنی 1-63 سال برای فاکتور V Leiden (G1691A) (G1691A)، 105 نفر هموزیگوت وحشی(GG) ، چهارنفرهتروزیگوت(GA) و فرد هموزیگوت جهش یافته(AA) یافت نشد. از نظر MTHFR C677T، 70 نفر هموزیگوت وحشی (CC) ، 29 نفر هتروزیگوت (CT) و 10 نفر هموزیگوت جهش یافته (TT) بودند. همچنین برای MTHFR A1298C، 43 نفر هموزیگوت وحشی (AA)، 50 نفر هتروزیگوت (AC) و 16 نفر هموزیگوت جهش یافته (CC) مشاهده شد. بروز همزمان آلل جهش یافته برای این سه ژن تنها در 2 بیمار مشاهده شد. از اهمیت تشخیص به موقع ترومبوفیلی می توان به درمان زودهنگام و جلوگیری از مرگ بسیاری ازبیماران اشاره کرد. همچنین شناخت علت زمینه ای با تکنیک هایی سریع و دقیق نظیر Allele-specific PCR و tetra-primer ARMS PCR، تشخیص، پیشگیری و درمان این بیماری را میسر و ممکن می سازد. با توجه به نتایج بدست آمده می توان ژن های فاکتورV Leiden (G1691A)، MTHFR C677T و MTHFR A1298C به عنوان مارکر در تشخیص ترومبوفیلی استفاده کرد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13652 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24577 BIO gen 31 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت طراحی واکسن مشترک علیه ویروسهای آنفولانزا (پروتئین های M1،HA) و SARS-COV-2 (پروتئین های M، E،S) با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک (1401) / جمالی ، شراره، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه جمالی ، شراره، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 27 عنوان : طراحی واکسن مشترک علیه ویروسهای آنفولانزا (پروتئین های M1،HA) و SARS-COV-2 (پروتئین های M، E،S) با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک عنوان موازی : Design of a common vaccine against influenza viruses (HA, M1 proteins) and SARS-COV-2 (M, E, S proteins) using bioinformatics tools ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 107ص شابک/شاپا 24573 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی سلولی مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما اسدزاده ، عزیزه، استاد مشاور توصیفگرها آنفولانزا، کووید-19، ویروس، اپی¬توپ، بیوانفورماتیک، واکسن Influenza, COVID-19,Virus, Epitope, Bioinformatics, Vaccine چکیده : در بین عفونتهای مختلف، عفونتهای حاد دستگاه تنفسی (ARTIs) بیشترین میزان بروز و مرگ و میر را در جهان دارند. این عفونت ها توسط میکروارگانیسم های مختلفی مانند ویروس آنفولانزا و SARS-COV-2 ایجاد می شوند. تأثیر بالقوه آنفولانزا در کنار COVID-19 بر مرگ و میر، عوارض و ظرفیت خدمات بهداشتی یک نگرانی اصلی است، اگرچه اخیراً اطلاعات کمی در مورد تعامل بین این دو ویروس تنفسی بیماری زا شناخته شده است. بنابراین، نیاز فوری به طراحی و توسعه واکسن های کارآمد برای جلوگیری از موارد بیشتر این بیماری ها وجود دارد. در این مطالعه، یک واکسن جدید چند اپی توپی علیه آنفولانزا و عفونتهای SARS-COV-2 طراحی شد. پروتئین های HA، M1 از ویروس آنفولانزا و پروتئین های S، E، M از ویروس SARS-COV-2 برای استفاده در ساختار واکسن آنالیز شدند. شناسایی اپی توپ سلول های B و T، به حداقل رساندن انرژی، پیش بینی پاسخ اینترفرون-گاما، حساسیت زایی، سمیت با استفاده از ابزارهای مختلف بیوانفورماتیک انجام شد. بهترین پپتیدها پس از داکینگ مولکولی انتخاب شدند. اپی توپ های انتخاب شده توسط پیوند دهنده های مناسب و ادجوانت برای ساخت واکسن چند اپی توپی ترکیب شدند. مدل سه بعدی کاندید واکسن توسط سرور I-TASSER تولید شد. بهینه¬سازی و ارزیابی این مدل توسط نقشه¬های راماچاندران و نرمافزار Swiss-pdb viewer مورد بررسی قرار گرفت. نتایج به دست ¬آمده نشان داد که واکسن طراحی شده غیر حساسیت زا، غیر سمی با پایداری و ایمنی زایی بالا است. در مجموع، انتظار می¬رود که واکسن چند اپی توپی جدید، واکسن مناسبی برای مقابله با آنفولانزا و عفونت های SARS-COV-2 باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13648 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24573 BIO gen 27 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت طراحی کاندید واکسن پلی اپی توپی جدید متشکل از پروتئین های M، N، E، S، PLpro و nsp13 علیه ویروس SARS-COV-2 (1401) / اوجی ، فاطمه، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه اوجی ، فاطمه، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO gen 25 عنوان : طراحی کاندید واکسن پلی اپی توپی جدید متشکل از پروتئین های M، N، E، S، PLpro و nsp13 علیه ویروس SARS-COV-2 عنوان موازی : Designing a Candidate for a New Polyepitope Vaccine Consisting of M, E, N, S, PLpro and Nsp13 Proteins against SARS-COV-2 Virus ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 94ص شابک/شاپا 24571 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی -مولکولی گرایش ژنتیک شناسه افزوده : آبکار ، مرتضی، استاد راهنما اسدزاده ، عزیزه، استاد مشاور توصیفگرها ایمونوانفورماتیک، پیش بینی اپی توپ، کوید-19، ویروس SARS-COV-2، واکسن Immunoinformatic, Epitope Prediction, COVID-19, SARS-COV-2 virus, Vaccine چکیده : همه گیری کووید-19 ناشی از ویروس SARS-COV-2 به طور غیرمنتظره ای بر سلامت جهانی تأثیر گذاشته است و از زمان شیوع SARS-COV-2 در دسامبر 2019 در ووهان چین، نرخ مرگ و میر را تسریع کرده است. در این وضعیت همه گیر، یک رویکرد ایمونو انفورماتیک می تواند یک گزینه سریع و قابل اعتماد برای توسعه سریعتر واکسن باشد. بنابراین هدف از این مطالعه طراحی بیوانفورماتیکی واکسن پلی اپی توپی علیه این ویروس با استفاده از پروتئین های M، N، E، S، PLpro و nsp13 می باشد. اپی توپهای سلول B خطی، لنفوسیتهای T سیتوتوکسیک (CTL) و لنفوسیتهای T کمکی (HTL) از Membrane، Spike، Envelope، Nucleoprotein، nsp13 و PLpro ویروس SARS-COV-2 پیشبینی شدند. اپی توپها برای ایمنی زایی، نمرات آنتی ژنی، آلرژی زایی و مطابقت سمیت با توانایی آنها برای تحریک پاسخ ایمنی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند و انتخاب شدند. پس از اتصال مولکولی، نامزد واکسن با ترکیب بهترین اپی توپها توسط لینکرساخته شد. نتایج نشان داد که اندازه واکسن پلی اپی توپی طراحی شده 477 اسید آمینه است که شامل 6 اپی توپ CTL، 6 اپی توپ HTL و 15 اپی توپ سلول B همراه با پپتید هدف گیری به سمت سلول های دندریتیک است که از طریق لینکرهای مختلف به هم متصل شدند. توالی طراحی شده کاندیدای مناسبی برای واکسن از جهت پایداری و آنتی ژنیسیته، غیر آلرژی زایی و غیر سمی بودن برای بدن انسان است. در مجموع، نتایج نشان داد که کاندیدای واکسن طراحیشده می تواند پاسخهای ایمنی هومورال و سلولی را تحریک کند و میتواند یک کاندید بالقوه واکسن در برابر کووید-19 باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13646 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24571 BIO gen 25 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت