بررسی سویههای ووهان و انگلیسی سارس-کوو-2 از طریق تعیین توالی ژنی در بیماران مبتلا به کووید-19 با مشکلات گوارشی (1401) / پورجلالی ، حسام، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه پورجلالی ، حسام، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 39 عنوان : بررسی سویههای ووهان و انگلیسی سارس-کوو-2 از طریق تعیین توالی ژنی در بیماران مبتلا به کووید-19 با مشکلات گوارشی عنوان موازی : Evaluation of Wuhan and UK strains of SARS-CoV-2 by sequencing in COVID-19 patients with gastrointestinal problems ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 60ص شابک/شاپا 24673 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب بیماری زا شناسه افزوده : محمدی اصل ، جواد، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها COVID-19، توالی اگزوم، بیماری عفونی COVID-19, exome sequencing, Digestion چکیده : همهگیریهای ویرانگر، مانند بیماری کووید-19، میتواند گواهی قوی بر دانش ما درباره عوامل ژنتیکی و تکاملی حساسیت و شدت بیماریهای عفونی ارائه دهد. یکی از قابل توجه ترین جنبه های چنین شیوعی، تنوع خیره کننده بین فردی است که در دوره عفونت مشاهده می شود. در دهههای اخیر، پیشرفتهای عظیمی در زمینه ژنتیک انسانی بیماریهای عفونی صورت گرفته است و تعداد فزایندهای از عوامل ژنتیکی انسانی گزارش شدهاند که تا حد زیادی تنوع مشاهده شده برای تعداد زیادی از عوامل عفونی را توضیح میدهند. با این حال، درک ما از مکانیسمهای سلولی، مولکولی و ایمنیشناختی زیربنای چنین تفاوتهایی بین افراد و گروههای قومی، بسیار محدود است. در این مطالعه جنبه های مختلف ژنتیکی و همچنین پروتوکل های ارائه شده جهت افتراق و تشخیص کووید 19 اجرا گردید. گروه مورد مطالعه شامل 2 فرد مبتلا کووید 19، مجموعه 30 نفر با نسبت خانوادگی و غیرخانوادگی بود. گروه کنترل شامل تعدادی از افراد کاملا سالم خانواده میباشد که تست های ژنتیکی فقدان ناهنجاری های ژنتیکی در آن ها را اثبات کرده است.
طیف گسترده ای از ژنوم گروه هدف (661 ژن) جهت ردیابی ناهنجاری های ژنتیکی مرتبط با کرونا بررسی گردید. نتیجه بررسی توالی یابی ژنهای SARS COV 2 نشان داد که بعد از استخراج از روی محصول cDNA ساخته شد و به منظور انجام تست توالییابی سنگر که با دستگاه HITACHI در آزمایشگاه نورژن انجام شد به بخش سکانس ارجاع داده و با استفاده از برنامه کروماس (Chromas) آنالیز و پس از خوانش توالی سکانس توسط پرایمر (F،R) و بررسی نتایج توالییابی، وجود تغییر جهش c.A1503T:p.N501Y در خانواده تایید گردید و بعد از انجام آنالیزهای primary، secondary و tertiary بر روی دادههای حاصل از توالییابی کل اگزوم و بر اساس مقایسه واریانتهای حاصله c.A1503T:p.N501Y در SARS COV2 ژن کاندید برای بیماری کرونا، یک تغییر بدمعنی شناسایی شد. براساس مطالعه ما، بررسی جامع ژنتیکی نظر به ژن با واریانتSARS COV 2 , c.A1503T:p.N501Y دخیل در جهش کرونا UK، و بررسی مشکل گوارشی در ایران انجام نشده نبود و مطالعات تنها درباره بررسی انواع الگوی کرونا صورت گرفته است. لذا در این تحقیق سعی بر آن بوده است، تا با به کارگیری تکنیکهای جدید و پیشرفته موثر، جهشهای جدید مسئول در بیماری های ناشناخته و عوارض آن را مشخص گردد. بدیهی است که شناسایی ژنها و به تبع آن جهشهای عامل بیماری ، به آشکار شدن ساختار ژنتیکی بیماری و متعاقباً ارتقای روشهای پیشگیری و مشاوره کمک بسزایی خواهد نمودلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13748 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24673 BIO microb 39 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی شیوع مقاومت به کلیستین و ژن های درگیر در سویه های کلبسیلا جداسازی شده از بیمارستان های شهر اصفهان (1401) / اذری فرد جهرمی ، علیرضا، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه اذری فرد جهرمی ، علیرضا، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 36 عنوان : بررسی شیوع مقاومت به کلیستین و ژن های درگیر در سویه های کلبسیلا جداسازی شده از بیمارستان های شهر اصفهان عنوان موازی : Investigation of Prevalence of Colistin Resistance and the Genes Involved in Klebsiella Strains Isolated from Isfahan Hospitals ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 70ص شابک/شاپا 24649 یادداشت پایان¬نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی و مولکولی¬گرایش میکروبیولوژی شناسه افزوده : شکری ، داریوش، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد مشاور توصیفگرها کلبسیلا، مقاومت به آنتی بیوتیک، کلیستین، ژنهای مقاومت آنتی بیوتیکی Klebsiella, antibiotic resistance, colistin, antibiotic resistance genes چکیده : عفونتهای ناشی از باکتریکلبسیلا پنومونیهیک مشکل فزاینده در جهان هست و ظهور مقاومتهای آنتیبیوتیکی به ویژه مقاومت چند داروهای باقی مانده نگرانیهای زیادی را ایجاد کرده است. کلیستین یکی از آخرین داروهای باقیمانده برای درمان سویه های مقاوم به دارو ازاین باکتری است که با مکانیسم های مختلف از جمله تولید ژنهای مقاومت به آن نیز مقاوم شود. در این تحقیق میزان شیوع مقاومت به کلیستین و سازوکارهای مولکولی آن در سویه های گوناگون کلبسیلا پنومونیهجداشده از چند بیمارستان اصفهان بررسی شد. هفتاد ونه سویهکلبسیلا پنومونیهمقاوم به چند دارو(MDR) جمع آوری وهویتشان مشخص شد. تست حساسیت به چهارده آنتی بیوتیک گوناگون بر اساس استانداردهای موجود با شیوه منتشر شدن از دیسک و در مورد کلیستین با شیوه تعیین کمترین غلظت مهاری (MIC) انجام گردید و نتایج توسط نرم افزار سازمان بهداشت جهانی (WHOnet) تجزیه و تحلیل گردید. ژن های مقاومت به کلیستین شاملmcr-3,mcr-4, phop,phoq به شیوه PCR شناسایی شد و در صورت مثبت بودن تعیین توالی انجام گرفت. نتایج نشان داد بیشترین میزان مقاومت مربوط به سفتازیدیم به میزان 9/94 درصد و کمترین میزان مقاومت مربوط به تیگسیکلین به میزان5/2 درصد بود. همچنین با روش PCR ژنهایmcr-4 و mcr-3 در سویه های مورد بررسی شناسایی نشد ولی ژنهایphop و phoq در 16 سویه شناسایی گردید. تحقیقات نشان دهنده افزایش میزان قابل توجه ای مقاومت به آنتی بیوتیک ها است وهمچنین میزان مقاومت به کلیستین با مکانیسم های ژنی مختلف افزایش یافته که در مورد نحوه و میزان تجویز و مصرف آنتی بیوتیک هشدار می دهد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13724 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24649 BIO microb 36 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی فراوانی انتروکوکوسهای مقاوم به ونکومایسین و ژنهای مرتبط در بدو ورود بیماران به بخش مراقبتهای ویژه بیمارستان الزهرا در سال 1400 (1401) / جهان گرد ، فرناز، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه جهان گرد ، فرناز، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 32 عنوان : بررسی فراوانی انتروکوکوسهای مقاوم به ونکومایسین و ژنهای مرتبط در بدو ورود بیماران به بخش مراقبتهای ویژه بیمارستان الزهرا در سال 1400 عنوان موازی : Prevalence of vancomycin-resistant enterococci and related genes at the beginning of patients' admission to the intensive care unit of Al-Zahra Hospital in 1400 ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 64ص شابک/شاپا 24590 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروبهای بیماریزا شناسه افزوده : رستمی ، سودابه، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما توصیفگرها انتروکوکوس مقاوم به ونکومایسین (VRE)، رکتوم، بخش مراقبت ویژه Vancomycin-resistant enterococcus (VRE), rectal, intensive care unit. چکیده : مقدمه: انتروکوکوسها از جمله شایعترین عوامل عفونتهای بیمارستانی، به ویژه در بخشهای مراقبتهای ویژه هستند. انتروکوکوس فاسیوم و انتروکوکوس فکالیس مقاوم به ونکومایسین از علل شایع عفونتهای مرتبط با مراقبتهای بهداشتی هستند. این مطالعه به هدف بررسی فراوانی انتروکوکوسهای مقاوم به ونکومایسین و ژنهای مرتبط در بدو ورود بیماران به بخش مراقبتهای ویژه بیمارستان الزهرا در سال 1400 انجام شد.
روشها: این مطالعه در طی سه ماه (از شهریور تا آبان ماه 1400) با مراجعه به بخشهای مراقبت ویژه بیمارستان الزهرا (س) شهر اصفهان انجام شد. 150 نمونه سواپ رکتال از بیماران بستری در سه بخش مراقبت ویژه جمعآوری گردید. نمونهها از نظر وجود انتروکوکوس با انجام تستهای بیوشیمیایی، رنگآمیزی و ایجاد کلونیهای سیاه رنگ روی بایل اسکولین آزید تایید شدند. تست حساسیت آنتیبیوتیک برای تشخیص مقاومت انجام گرفت. در نهایت، حضور ژنهای vanA وvanB با تکنیک PCR Multiplex مورد ارزیابی قرار گرفت.
نتایج: شیوع انتروکوکوس مقاوم به ونکومایسین 1/36 درصد بود. طبق نتایج به دست آمده بیشترین گونه جدا شده انتروکوکوس فکالیس8/11 درصد بود. انتروکوکوس فاسیوم 7/9 درصد˛ فنوتیپ vanA 6/7 درصد، vanA&B 9/4 درصد و vanB 0 درصد بود. بین ناقلینVRE و مصرف آنتیبیوتیک، قبل از ورود به بخشهای مراقبت ویژه ارتباط معناداری با کلونیزاسیون آنها با انتروکوکوسهای مقاوم به ونکومایسین داشت (p-value=0.016). بین کلونیزاسیونVRE و بیماریهای زمینهای مثل دیابت، فشار خون، بیماریهای قلبی ارتباط معناداری با کلونیزاسیون انتروکوکوس در بیماران بستری در ICUمشاهده شد.
نتیجهگیری کلی:
از آنجایی که انتروکوکوسها به صورت ذاتی و اکتسابی به طیف وسیعی از آنتیبیوتیکها مقاوم هستند، با توجه به شیوع بالای انتروکوکوس مقاوم به ونکومایسین در بیماران بستری شده انجام تست آنتیبیوگرام قبل از تجویز ضروری میباشدلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13665 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24590 BIO microb 32 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی فراوانی نسبی باسیل های گرم منفی حامل بتالاکتامازهای وسیع الطیف ESBLsکلونیزه کننده بیماران در بدو ورود به بخش های مراقبت ویژه بیمارستان الزهرا درسال 1400به وسیله روش های فنوتیپی ومولکولی (1401) / قاسمی ورنامخواستی ، زهرا، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه قاسمی ورنامخواستی ، زهرا، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 30 عنوان : بررسی فراوانی نسبی باسیل های گرم منفی حامل بتالاکتامازهای وسیع الطیف ESBLsکلونیزه کننده بیماران در بدو ورود به بخش های مراقبت ویژه بیمارستان الزهرا درسال 1400به وسیله روش های فنوتیپی ومولکولی عنوان موازی : Evaluation of the relative frequency of extended - spectrum beta - lactamase(ESBL)- producing gram - negative bacilli colonization at the intensive care unit admission in Alzahra Hospital in 1400 by phenotypic and molecular methods ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 63ص شابک/شاپا 24587 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب های بیماریزا شناسه افزوده : رستمی ، سودابه، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما توصیفگرها باسیل گرم¬منفی ،بتالاکتامازهای وسیع¬الطیف ،کلونیزاسیون، مراقبت¬های ویژه ،شیوع Extended spectrum beta lactamase, Colonization , Intensive care , Prevalence , Gram -negative bacilli چکیده : زمینه و هدف : سال¬هاست که افزایش مقاومت میکروبی در بیمارستان ها در ایران وجهان به یک مشکل اساسی تبدیل شده است.شایع ترین عوامل باکتریال افزایش مقاومت میکروبی باسیل¬های گرم منفی از جمله خانواده انتروباکتریاسه نظیر اشیریشیاکلی و کلبسیلا پنومونیه هستند. افزایش تدریجی باکتری های تولیدکننده بتالاکتامازهای وسیع¬الطیف،سال¬هاست منجر به ارزیابی مجدد آنتی بیوتیک های درمانی برای عفونت¬های ناشی از این خانواده در بیماران بستری در بخش¬های مختلف بیمارستان واز همه مهمتر بخش مراقبت های ویژه بیمارستان¬¬ها شده¬است.
روش بررسی : در این مطالعه ما به بررسی فراوانی باسیل های گرم منفی حامل بتالاکتامازهای وسیع¬الطیف در بین 150بیمار بستری در بدو ورود به بخش مراقبت های ویژه بیمارستان الزهرا اصفهان می¬پردازیم. که از بین 150 نمونه ،146 نمونه معیار ورود به این مطالعه را داشتند که 82نمونه به سفوکسیتیم مقاومت داشتند، شناسایی شد. باکتری ها با استفاده از تست¬های بیوشیمیایی مختلف شناسایی شد وتست حساسیت میکروبی با آنتی¬بیوتیک های مختلف بر اساس استانداردهای موجود با روش انتشار از دیسک دیفیوژن انجام گرفت ونتایج به دست آمده به وسیله نرم افزار (SPSS)تجزیه وتحلیل ژن¬های shv،tem ،ctx ،ges، per، veb به وسیله روش PCR در ایزوله¬های مقاوم بررسی شد.
یافته¬ها : فراوانی ژن¬های shv،tem ،ctx ،ges، per،veb به ترتیب 33.1 %، 5.9% ،66.1% ،0% ، 0% ،2.5 % به دست آمد.که از این بین تعداد بیشتری از سویه¬های مورد مطالعه به ctx مقاومت داشته¬اند.
نتیجه¬ گیری : این بررسی شیوع بالای مقاومت چند دارویی را در ایزوله¬های کلینیکی خانواده انتروباکتریاسه را نشان داد و از آنجایی که در این بررسی ما به بررسی ESBLها نیز پرداختیم و نتیجه قابل توجهی به دست آمد. بهتر است که بیماران قبل از ورود به ICU از این نظر با روش نوین Screening بررسی شده و بعدا وارد بخش مراقبت¬های ویژه بیمارستان شوندلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13662 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24587 BIO microb 30 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی فراوانی نسبی باسیل¬های گرم منفی مقاوم به کارباپنم کلونیزه کننده بیماران در بدو ورود به بخش¬های مراقبت ویژه بیمارستان الزهراء در سال 1400 بوسیله روش¬های فنوتیپی و مولکولی (1401) / القاصی ، زینب، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه القاصی ، زینب، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 34 عنوان : بررسی فراوانی نسبی باسیل¬های گرم منفی مقاوم به کارباپنم کلونیزه کننده بیماران در بدو ورود به بخش¬های مراقبت ویژه بیمارستان الزهراء در سال 1400 بوسیله روش¬های فنوتیپی و مولکولی عنوان موازی : Evaluation Of Relative Frequency Of Carbapenem-Resistant Gram Negative Bacilli Colonization At The Intensive Care Unit Admission In Alzahra Hospital 2021 (By phenotypic And Molecular Methods) ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 114ص شابک/شاپا 24592 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب¬های بیماری¬زا شناسه افزوده : رستمی ، سودابه، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما عباسی ، سعید، استاد مشاور توصیفگرها باسیل¬های گرم منفی مقاوم به کارباپنم، کلونیزاسیون، بخش مراقبت ویژه، ژن¬های کارباپنماز Carbapenem-resistant gram-negative bacilli, colonization, Intensive Care Unit, Carbapenemase genes چکیده : هدف تحقیق: کلونیزاسیون باسیل¬های گرم منفی مقاوم به کارباپنم (CR-GNBs) می¬تواند به عنوان یک عامل خطر مهم برای انتقال این عفونت¬های بیمارستانی در بخش¬های مراقبت ویژه (ICUs) باشد. از اهداف این مطالعه ارزیابی فراوانی و تعیین خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی CR-GNBs کلونیزه کننده بیماران ICUs بیمارستان الزهرا اصفهان بود.
روش تحقیق: در مجموع 146 سواب رکتوم برای جداسازی CR-GNBs جمع¬آوری و با استفاده از محیط¬های انتخابی، افتراقی و تست¬های بیوشیمیایی شناسایی شد. تست حساسیت ضد میکروبی به روش انتشار دیسک برای تمامی ایزوله¬های CR-GNBs بر اساس دستورالعمل CLSI انجام شد. برای مقاومت به مروپنم CR-GNBs در محیط آگار (مک¬کانکی آگار حاوی مروپنم با غلظت 1 میکروگرم در میلی-لیتر) غربالگری شدند. ایزوله¬های مقاوم به مروپنم با روش میکرودایلوشن براث تایید شدند. PCR برای تشخیص کارباپنماز (blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaNDM, blaSPM, blaOXA-48) انجام شد.
یافته¬ها: فراوانی CR-GNBs کلونیزه کننده در بیماران مورد مطالعه 6/24% بود. بطور کلی، 118 ایزوله باسیل گرم منفی شناسایی شد که 36 ایزوله به کارباپنم مقاومت نشان دادند. مروپنم با حساسیت 7/29 % مؤثرترین عامل ضد میکروبی بود. همچنین 1/88 % از ایزوله¬ها به تری¬متوپریم- سولفومتاکسازول مقاوم بودند. اشریشیاکلی و کلبسیلا پنومونیه شایع¬ترین باکتری کلونیزه کننده بودند. متداولترین کارباپنماز شناساییشده ژنهای blaOXA-48، blaNDM و blaSPM بودند. نه ایزولهCR-GNBs ، ژن blaNDM و blaOXA-48 را هم¬زمان داشتند. همچنین، دو ایزوله CR-GNBs، ژن blaSPM، blaNDM و blaOXA-48 را هم¬زمان داشتند. ما blaKPC، blaIMP یا blaVIM را شناسایی نکردیم. بین درمان با لووفلوکساسین، سفکسیم، لینوزولید و ابتلا به کووید-19 در بیماران کلونیزه با CR-GNBs که در بخش ICUs بستری شده بودند، ارتباط معنی داری وجود داشت (02/0= P).
نتیجه¬گیری: در مطالعه ما، فراوانی کلونیزاسیون CR-GNBs بالا بود و ظهور ژنهای کارباپنماز در بین بیماران هشداردهنده است. اجرای اقدامات پیشگیرانه کافی مانند نظارت فعال برای کنترل گسترش CR-GNBs در مراکز درمانی در همه¬گیری کووید-19 ضروری استلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13667 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24592 BIO microb 34 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی فراوانی ژن های کارباپنماز، متالو بتا لاکتاماز و اگزاسیلیناز در سویه های مختلف سودوموناس آئروژینوزا جدا شده در چند بیمارستان شهر اصفهان (1401) / کرونی فولادی ، عاطفه، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه کرونی فولادی ، عاطفه، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 42 عنوان : بررسی فراوانی ژن های کارباپنماز، متالو بتا لاکتاماز و اگزاسیلیناز در سویه های مختلف سودوموناس آئروژینوزا جدا شده در چند بیمارستان شهر اصفهان عنوان موازی : Examining the frequency of carbapenemase, metallo-beta-lactamase and oxacillinase genes in different strains of Pseudomonas aeruginosa isolated in several hospitals in Isfahan ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 74ص شابک/شاپا 24939 یادداشت کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب های بیماری زا شناسه افزوده : شکری ، داریوش، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد مشاور توصیفگرها سودوموناس آئروژینوزا، مقاومت آنتی بیوتیکی، ژن های کارباپنماز، متالوبتالاکتاماز، اگزاسیلیناز Pseudomonas aeruginosa, antibiotic resistance, carbapenemase genes, metallobetalactamase, oxacillinase چکیده : زمینه و هدف : با توجه به میزان مقاومت روز افزون پاتوژن های گرم منفی فرصت طلب، به خصوص باکتری سودوموناس آئروژینوزا در برابر آنتی بیوتیک های رایج که امروزه مورد استفاده قرار میگیرند، پس از ایجاد مقاومت های دارویی مداوم این باکتری در برابر بسیاری از آنتی بیوتیک ها، پزشکان به استفاده از آنتی بیوتیک های کارباپنم پرداختند. هدف از این بررسی، جداسازی و شناسایی سویه های مقاوم به کارباپنم این باکتری و مقایسه آنها نسبت به دیگر پژوهش های مشابه میباشد.
مواد و روش ها: در ابتدا 100 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا از بیماران چند بیمارستان جمع آوری، و تمامی ایزوله ها با کمک تست های آزمایشگاهی استاندارد، تعیین هویت شدند. سپس ایزوله های مقاوم را که به کمک آنتی بیوگرام و جدول CLSI 2021 مشخص شد، با استفاده از پرایمر های اختصاصی برای تشخیص حضور ژنهای متالوبتالاکتاماز و اگزاسیلیناز از طریق روش PCR و تعیین توالی مورد بررسی قرار گرفتند.
نتیجه گیری: در مجموع 100 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا، 48 ایزوله مقاوم به کارباپنم بودند. در میان آنها به ترتیب 5% دارای ژن های VIM و3% ژن OXA-51 و NDM و 5% دارای ژن IMP بودند. امروزه اهمیت وجود سودوموناس های حاوی ژن هایی هم چون متالوبتالاکتام ها و اگزاسیلیناز ها قابل توجه است و استفاده از روش های استاندارد کنترل عفونت به خصوص در محیط های بیمارستانی بسیار حائز اهمیت استلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13970 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24939 BIO microb 42 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی مقاومت آنتی¬بیوتیکی و جداسازی باکتریوفاژ علیه سویه های Escherichia coli و Proteus mirabilis ایجاد کننده عفونت های مجاری ادراری (1401) / طحانی ، صدرالدین، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه طحانی ، صدرالدین، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 40 عنوان : بررسی مقاومت آنتی¬بیوتیکی و جداسازی باکتریوفاژ علیه سویه های Escherichia coli و Proteus mirabilis ایجاد کننده عفونت های مجاری ادراری عنوان موازی : Investigation of Antibiotic Resistance and Isolation Bacteriophage against Urinary Tract Infection Causing Escherichia coli and Proteus mirabilis Strains ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 98ص شابک/شاپا 24740 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب¬های بیماری¬زا شناسه افزوده : قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما مرادی ، مریم، استاد مشاور توصیفگرها اشرشیا کلای، پروتئوس میرابیلیس، مقاومت آنتی¬بیوتیکی، عفونت مجاری ادراری، باکتریوفاژ Escherichia coli, Proteus mirabilis, antibiotic resistance, urinary tract infection, bacteriophage چکیده : عفونت های مجاری ادراری یکی از شایع ترین عفونت های باکتریایی است که سالانه 150 میلیون نفر را در سراسر جهان مبتلا می کند. شایع ترین میکروارگانیسم ایجاد کننده ی آن باکتری اشرشیا کلای اروپاتوژنیک (عامل بیش از 80 درصد موارد ابتلا) می باشد. عامل دیگر ایجاد کننده ی آن باکتری پروتئوس میرابیلیس (عامل بیش از 10 درصد موارد ابتلا) می¬باشد. درچند دهه ی اخیر افزایش مقاومت باکتری اشرشیا کلای و پروتئوس میرابیلیس نسبت به آنتی¬بیوتیک های مختلف باعث بروز مشکلات زیادی شده است.
اخیرا نگرانی از ورود مجدد بشر به عصر پیش آنتی¬بیوتیک ها بسیار شدت گرفته است و توسعه روش های درمان جایگزین به یکی از بالاترین اولویت های پزشکی مدرن و بیوتکنولوژی تبدیل شده است. با ظهور و افزایش روزافزون تهدید عفونت¬های ناشی از باکتری های مقاوم به چند دارو، باکتریوفاژها به عنوان جایگزینی برای درمان عفونت های ناشی از پاتوژن های مقاوم بیش تر مورد بررسی قرار گرفته اند.
در این مطالعه پس از جمع آوری 40 نمونه باکتری های اشرشیا کلای و 30 نمونه باکتری پروتئوس میرابیلیس از آزمایشگاه-های تشخیص طبی اصفهان و بررسی ماکروسکوپی و میکروسکوپی و انجام آزمایشهای بیوشیمیایی، وجود باکتری های اشرشیا کلای و پروتئوس میرابیلیس تایید شد. سپس حساسیت آنتی¬بیوتیکی باکتری ها با انجام آزمایش انتشار دیسک مورد ارزیابی قرار گرفت.
در بررسی غنی سازی باکتریوفاژ نمونه هایی از آب فاضلاب شهرستان اصفهان، آب رودخانه های زاینده رود و کارون جمع-آوری شد. پس از فرایند غنی سازی، حضور باکتریوفاژ با انجام آزمایش لکه گذاری تایید شد و اثرات کشندگی آن در سویه های جداسازی شده مورد بررسی قرار گرفته و توسط آزمایش overlay تک پلاک جداسازی شد. سپس تیتر فاژ افزایش یافته و پس از رنگ آمیزی نمونه ی فاژی با اورانیل استات 2 درصد، عکس برداری توسط میکروسکوپ الکترونی گزاره (TEM) انجام گردید.
سویه های باکتری اشرشیا کلای جداسازی شده، بیشترین مقاومت را به ترتیب نسبت به آنتی¬بیوتیک¬های سیپروفلوکساسین (65 درصد)، سفتازیدیم (60 درصد)، تریمتوپریم-سولفومتوکسازول (5/57 درصد) و بیشترین حساسیت را به ترتیب نسبت به آمیکاسین (90 درصد)، نیتروفورانتوئین (5/87 درصد) داشته و سویه های باکتری پروتئوس میرابیلیس جداسازی شده، بیشترین مقاومت را به ترتیب نسبت به آنتی¬بیوتیک¬های سیپروفلوکساسین (3/73 درصد)، تریمتوپریم-سولفومتوکسازول (3/63 درصد)، سفتازیدیم (50 درصد)، و بیشترین حساسیت را به ترتیب نسبت به آمیکاسین (4/83 درصد)، سفپیم (7/76 درصد) داشتند. سپس با تعیین الگوی مقاومتی هر دو باکتری، این نتیجه حاصل شد که 55 درصد سویه های باکتری اشرشیا کلای جداسازی شده و 2/63 درصد سویه های باکتری پروتئوس میرابیلیس جداسازی شده مقاوم به 3 تا 7 آنتی¬بیوتیک بودند.
باکتریوفاژ اختصاصی ϕEST1، علیه سویه های اشرشیا کلای جداسازی شد که روی 17 سویه (5/42 درصد) اشرشیا کلای جمع آوری شده، فعالیت لیتیک از خود نشان داد که سویه های حساس به این باکتریوفاژ از سویه های مقاوم به 1 تا 7 آنتی¬بیوتیک بودند. همچنین مورفولوژی فاژ ϕEST1 دارای شباهت زیادی با رده کودوویریستس بود.
باکتریوفاژ بدست آمده بایستی در مطالعات بعدی بررسی شده و در صورتی که فاقد ژن های لیزوژنیک و ژن های مقاومت آنتی¬بیوتیکی باشد، از آن در کوکتل های فاژی به منظور فاژ درمانی علیه عفونت های مجاری ادراری استفاده شودلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13806 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24740 BIO microb 40 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی ژن های مقاوم به آمینوگلیکوزیدها در سویه های مختلف اشرشیاکلی جدا شده از چندین بیمارستان استان اصفهان (1401) / یزدانی ، سپیده، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه یزدانی ، سپیده، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 33 عنوان : بررسی ژن های مقاوم به آمینوگلیکوزیدها در سویه های مختلف اشرشیاکلی جدا شده از چندین بیمارستان استان اصفهان عنوان موازی : Investigation of Aminoglycoside resistant genes in different strains of Escherichia coli isolated from several Isfahan’s hospitals ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 73ص شابک/شاپا 24591 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروب شناسی گرایش میکروب های بیماری زا شناسه افزوده : شکری ، داریوش، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد مشاور توصیفگرها اشرشیاکلی، آمینوگلیکوزید ها، مقاومت آنتی بیوتیکی، ژن های مقاومتی Escherichia coli, Aminoglycoside, Antibiotic resistance, Resistance genes چکیده : زمینه و هدف: اشرشیاکلی پاتوژنی فرصت طلب و از عوامل مهم ایجاد کننده عفونت های بیمارستانی است. در سال های اخیر مقاومت آنتی بیوتیکی در جمعیت انسانی رو به افزایش بوده که مسبب محدود شدن راه های کنترل عفونت و درمان صحیح شده است.
غیرفعال سازی آنزیماتیک آمینوگلیکوزید ها توسط آنزیم های تغییردهنده ی آن ها، اصلی ترین مکانیسم مقاومت به آمینوگلیکوزیدها در اشرشیاکلی است. هدف اصلی این مطالعه بررسی ژن های مقاومتی aac(6')-Ib و aph(3")-Ib و ant(2")-Ia نسبت به آنتی بیوتیک های جنتامایسین و آمیکاسین از گروه آمینوگلیگوزید ها در سویه های مقاوم اشرشیاکلی جدا شده از ادرار به روش PCR می باشد.
روش کار: 120 ایزوله با تست های بیوشیمیایی مورد بررسی قرار گرفته و بعد از تعیین هویت، از نظر مقاومت آنتی بیوتیکی با روش انتشار دیسک بررسی شدند. درنهایت 60 ایزوله، مقاومت کامل به جنتامایسین و آمیکاسین نشان دادند و از نظر وجود ژن های aac(6')-Ib و aph(3")-Ib و ant(2")-Ia با روش PCR بررسی شدند. سپس حضور ژن ها با تعیین توالی تایید گردید.
یافته ها: پس از انتشار دیسک، اکثر سویه ها مقاومت آنتی بیوتیکی نسبت به سفکسیم(91 %) و تعداد کمتری مقاومت نسبت به مروپنم(5 %) نشان دادند. 71% از سویه ها نسبت به جنتامایسین و 29% درصد به آمیکاسین مقاومت نشان دادند. پس از بررسی ژن های مقاومتی با روش PCR، میزان تقریبی3/13% از سویه ها ژن مقاومتی aph(3")-Ib ، 33/3 % ژن مقاومتی aac(6')-Ib و 7/1% ژن مقاومتی ant(2”)-Ia را دارا بودند.
نتیجه گیری: نتایج نشان می دهد در ایزوله های اشرشیاکلی، بیشترین میزان حساسیت را نسبت به آنتی بیوتیک آمیکاسین دارند. بیشترین سویه های مقاوم دارای ژن مقاومتی aph(3")-Ib و تعداد کمتری ژن مقاومتی ant(2”)-Ia را دارا بودندلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13666 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24591 BIO microb 33 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی ژن های مقاومت به آنتی بیوتیک کولیستین در باکتری های اشرشیا کلی و کلبسیلا پنومونیه (1400) / اعتضادی ، مرضیه سادات، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه اعتضادی ، مرضیه سادات، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 28 عنوان : بررسی ژن های مقاومت به آنتی بیوتیک کولیستین در باکتری های اشرشیا کلی و کلبسیلا پنومونیه عنوان موازی : Evaluation of colistine antibiotic resistance genes in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: 103ص شابک/شاپا 28586 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی و مولکولی گرایش میکروبیولوژی شناسه افزوده : شکری ، داریوش، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما توصیفگرها کلبسیلا پنومونیه، اشرشیا کلی، کولیستین، مقاومت آنتی بیوتیک Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Colistin, Antibiotic resistante چکیده : افزایش شیوع مقاومت آنتی¬بیوتیکی در باکتری¬های خانواده انتروباکتریاسه از جمله کلبسیلا و اشرشیا کلی منجر به استفاده از داروهای خط آخر درمان با عوارض بالا مثل کولیستین شده است. با این وجود مقاومت به این آنتی¬بیوتیک نیز در سطح نسبتا وسیعی گزارش شده است که این امر به دلیل کمبود آنتی¬بیوتیک¬های جایگزین، یک مشکل جدی در درمان تلقی می¬شود. در این مطالعه میزان شیوع مقاومت به کولیستین و مکانیسم¬های مولکولی آن در سویه¬های مختلف کلبسیلا پنومونیه و اشرشیا کلی جدا شده از بیمارستان¬های سطح شهر اصفهان مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 162 سویه کلبسیلا پنومونیه و 30 سویه اشرشیا کلی مقاوم به چند دارو (MDR) جمع¬آوری و تعیین هویت شدند. تست حساسیت میکروبی به پانزده آنتی¬بیوتیک مختلف بر اساس استاندارد¬های تعیین شده با روش دیسک دیفیوژن و برای کولیستین با روش تعیین کمترین غلظت مهاری (MIC) به انجام رسید و در نهایت نتایج حاصل توسط نرم افزار سازمان بهداشت جهانی (WHOnet) مورد بررسی و تجزیه و تحلیل قرار گرفت. ژن¬های کاندید برای بروز مقاومت به کولیستین در سویه¬های جداشده کلبسیلا پنومونیه و اشرشیا کلی شامل mcr-1، mcr-2، mcr-3، mcr-4، mgrB و pmrA به روش PCR مورد شناسایی قرار گرفتند و سویه¬های مثبت تعیین توالی شدند. نتایج نشان داد بیشترین میزان مقاومت در کلبسیلا پنومونیه مربوط به سفازولین به میزان 35/91% و کمترین میزان مقاومت مربوط به کولیستین به میزان 4/15% است . همچنین نتایج نشان داد که بیشترین میزان مقاومت در اشرشیا کلی مربوط به نالیدیکسیک اسید به میزان 70% و کمترین میزان مقاومت مربوط به کولیستین و سفپیم با میزان 0% است. در هیچکدام از سویه¬های کلبسیلا با کمک روش PCR هیچکدام از ژن های mcr شناسایی نشدند. ولی ژن mgrB در 20 سویه از 25 سویه مقاوم به کولیستین و ژن pmrA در 8 سویه از 25 سویه مقاوم به کولیستین شناسایی شدند. این نتایج نشانگر آن است که میزان مقاومت قابل توجهی از مقاومت به آنتی-بیوتیک¬ها و میزان افزایش یافته مقاومت به کولیستین از طریق مکانیسم¬های مولکولی مختلف ایجاد می¬شود که هشدار جدی برای نحوه و میزان تجویز و مصرف آنتی¬بیوتیک¬ها است لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13661 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24586 BIO microb 28 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت بررسی ژنهای مقاومت به آنتیبیوتیک کولیستین در باکتری آسینتوباکتر بومانی (1401) / عباسی ، علی، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه عباسی ، علی، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 31 عنوان : بررسی ژنهای مقاومت به آنتیبیوتیک کولیستین در باکتری آسینتوباکتر بومانی عنوان موازی : Investigating Colistin Antibiotic Resistance Genes in Acinetobacter Baumannii ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 93ص شابک/شاپا 24589 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروبهای بیماریزا شناسه افزوده : شکری ، داریوش، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما امامی ، حمید، استاد مشاور توصیفگرها آسینتوباکتر بومانی ، کولیستین ، مقاومت آنتیبیوتیکی ، ژنهای PmrA، PmrB و PmrC Acinetobacter baumannii, Colistin, Antibiotic Resistance, PmrCAB genes چکیده : هدف تحقیق: در عصر حاضر با توجه به افزایش روزافزون مقاومتهای آنتیبیوتیکی و ظهور سویههایی که میتوان گفت به تقریبا تمام آنتیبیوتیکهای موجود، مقاوم هستند؛ شناسایی مکانیسمهای مقاومت به آنتیبیوتیکها و یافتن راهی به منظور جلوگیری از ایجاد چنین مکانیسمهایی از اهمیت ویژهای برخوردار است.در همین راستا، یافتن مکانیسم عمل مقاومت به آنتیبیوتیک کولیستین که آخرین خط درمان در باکتریهای مقاوم مثل باکتری آسینتوباکتر بومانی میباشد، در این پروژه مورد بررسی قرار گرفت. روش تحقیق: در این مطالعه میزان شیوع مقاومت به کولیستین و مکانیسمهای مولکولی آن در 108 باکتری آسینتوباکتر بومانی جدا شده از بیمارستانهای مختلف شهر اصفهان مورد بررسی قرار گرفت. تست حساسیت میکروبی برای 10 آنتیبیوتیک مختلف بر اساس استانداردهای تعیین شده با روش دیسک دیفیوژن و برای بررسی حساسیت کولیستین با روش کمترین غلظت مهارکننده(MIC) به انجام رسید.ژنهای انتخاب شده برای بررسی، شامل PmrA، PmrB و PmrC بودند که همگی با روش PCR(واکنش زنجیرهای پلیمراز) بررسی شده و نشان از این دارد که همه این ژنها در چنین مقاومتی تاثیرگذار هستند. یافته ها: نتایج حاصله حاکی از آن بود که بیشترین مقاومت در این باکتری مربوط به آنتیبیوتیکهای پیپراسیلین تازوباکتام(100%)، مروپنم(100%) و سیپروفلوکساسین(100%) بوده و کمترین میزان مقاومت هم به کولیستین(6.48%) اختصاص مییابد. از بین 108 نمونه باکتری، تعداد 7 باکتری به آنتیبیوتیک کولیستین مقاومت نشان دادند که به منظور تعیین جهشهای احتمالی، محصول واکنش زنجیرهای پلیمراز تعیین توالی شد. نتیجه گیری: با توجه به نتایج حاضر به نظر میرسد که مقاومت آسینتوباکتر بومانی به کولیستین به صورت دائمی در حال تغییر بوده و چنین ژنهایی در اکتساب این مقاومت موثر هستند و به کارگیری رژیم درمانی مناسب و استفاده از استراتژی دقیق به منظور پیشگیری از عفونتهای بیمارستانی ناشی از این باکتری بیش از پیش ضرورت مییابد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13664 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24589 BIO microb 31 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت جداسازی باکتریوفاژ علیه سویه¬های سودوموناس آئروژینوزا و بررسی شباهت¬ها و تفاوت¬های بیوشیمیایی و مولکولی سویه¬های سودوموناس آئروژینوزا حساس و مقاوم به باکتریوفاژ (1401) / رستمی ، انیس، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه رستمی ، انیس، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 41 عنوان : جداسازی باکتریوفاژ علیه سویه¬های سودوموناس آئروژینوزا و بررسی شباهت¬ها و تفاوت¬های بیوشیمیایی و مولکولی سویه¬های سودوموناس آئروژینوزا حساس و مقاوم به باکتریوفاژ عنوان موازی : Isolation of bacteriophage against Pseudomonas aeruginosa strains and investigation of biochemical and molecular differences and similarities of phage susceptible and resistant strains ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 66ص شابک/شاپا 24938 یادداشت کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب های بیماری زا شناسه افزوده : قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما مرادی ، مریم، استاد مشاور توصیفگرها سودوموناس آئروژینوزا، باکتریوفاژ، حساسیت آنتی¬بیوتیکی : Pseudomonas aeruginosa, Bacteriophage, antibiotic sensitivity چکیده : زمینه و هدف : با توجه به میزان مقاومت روز افزون پاتوژن های گرم منفی فرصت طلب، به خصوص باکتری سودوموناس آئروژینوزا در برابر آنتی بیوتیک های رایج که امروزه مورد استفاده قرار میگیرند، پس از ایجاد مقاومت های دارویی مداوم این باکتری در برابر بسیاری از آنتی بیوتیک ها، پزشکان به استفاده از آنتی بیوتیک های کارباپنم پرداختند. هدف از این بررسی، جداسازی و شناسایی سویه های مقاوم به کارباپنم این باکتری و مقایسه آنها نسبت به دیگر پژوهش های مشابه میباشد.
مواد و روش ها: در ابتدا 100 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا از بیماران چند بیمارستان جمع آوری، و تمامی ایزوله ها با کمک تست های آزمایشگاهی استاندارد، تعیین هویت شدند. سپس ایزوله های مقاوم را که به کمک آنتی بیوگرام و جدول CLSI 2021 مشخص شد، با استفاده از پرایمر های اختصاصی برای تشخیص حضور ژنهای متالوبتالاکتاماز و اگزاسیلیناز از طریق روش PCR و تعیین توالی مورد بررسی قرار گرفتند.
نتیجه گیری: در مجموع 100 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا، 48 ایزوله مقاوم به کارباپنم بودند. در میان آنها به ترتیب 5% دارای ژن های VIM و3% ژن OXA-51 و NDM و 5% دارای ژن IMP بودند. امروزه اهمیت وجود سودوموناس های حاوی ژن هایی هم چون متالوبتالاکتام ها و اگزاسیلیناز ها قابل توجه است و استفاده از روش های استاندارد کنترل عفونت به خصوص در محیط های بیمارستانی بسیار حائز اهمیت استلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13969 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24938 BIO microb 41 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت جداسازی باکتریوفاژ علیه سویههای اشریشیاکلای ایجاد¬کننده عفونت ادراری (1400) / سلطانی حبیب آبادی ، مهسا، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه سلطانی حبیب آبادی ، مهسا، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 35 عنوان : جداسازی باکتریوفاژ علیه سویههای اشریشیاکلای ایجاد¬کننده عفونت ادراری عنوان موازی : Isolation of bacteriophage against Escherichia coli strains causing urinary tract infection ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: 122ص شابک/شاپا 24593 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب¬های بیماری¬زا شناسه افزوده : قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما شکری ، داریوش، استاد مشاور توصیفگرها باکتریوفاژ، اشریشیاکلای، عفونت ادراری، مقاومت دارویی Bacteriophage, Escherichia coli, Urinary tract infection, Drug resistance چکیده : استفاده از باکتریوفاژها جهت درمان عفونت¬ باکتری¬¬های پاتوژن، به¬¬عنوان یکی از روشهای جایگزین آنتی -بیوتیکها در باکتریهای مقاوم به آنتی بیوتیک مطرح می¬باشد. هدف این تحقیق جداسازی و تشخیص باکتریوفاژهای موثر بر روی سویههای مقاوم به آنتی¬ بیوتیک اشریشیا¬کلی و تعیین هویت آنها می¬باشد. سویه-های مختلف باکتری اشریشیا¬کلی از نمونه¬های ادراری بیماران دچار عفونت ادراری در چندین آزمایشگاه تشخیص طبی و بیمارستان شهر اصفهان در طی 5 ماه جداسازی و شناسایی شدند و میزان مقاومت به آنتی بیوتیک در سویههای جداسازی شده نسبت به آنتی بیوتیکهای رایج به روش انتشار از دیسک(کربی-بائر) تعیین شد. در مرحله بعد به منظور جداسازی باکتریوفاژها، نمونه¬ برداری از فاضلاب به عمل آمد. به کمک ایجاد پلاک حضور باکتریوفاژها بررسی شده و پس از غنی¬سازی و تغلیظ باکتریوفاژهای جداسازی شده و رنگ¬-آمیزی نمونه¬ها، جهت رویت ساختار باکتریوفاژها و نیز بررسی طول آنها از میکروسکوپ الکترونی گذاره (TEM) استفاده شد. عصاره¬ اتانولی خارخاسک و آبی آویشن به¬روش سوکسله تهیه گردید و فعالیت ضد¬میکروبی عصاره¬ها به¬روش انتشار در چاهک و دیسک دیفیوژن مورد ارزیابی قرار گرفت. داده ها توسط نرم افزار SPSS V.18 مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. در این مطالعه تعداد 80 جدایه بالینی اشریشیا¬کلی استفاده شد. باکتری جدا شده از نمونههای ادراری بیشترین درصد مقاومت را به سیپروفلوکساسین (25/51)% و کمترین مقاومت را به آنتی¬بیوتیک جنتامایسین (25/16)% نشان داد. در تصاویر گرفته شده توسط میکروسکوپ TEM باکتریوفاژ مورد شناسایی قرار گرفته به خانواده¬ سیفوویریده متعلق بودند. بررسی تاثیر همزمان (سینرژیسم) آنتی¬بیوتیک و فاژ بر¬روی 30 سویه از سویه¬های اشریشیاکلی جمع¬آوری شده که بر روی 23 سویه اثر مثبت داشت EC31 ,EC48 ,EC04 ,EC13 ,EC41 ,EC10 و EC06 نمونه¬هایی از آنها بودند و 7 سویه بی¬تاثیر بود که EC15,EC7,EC01,EC20,EC22 نمونه¬هایی از انها بودند. همچنین ترکیب عصاره آویشن کوهی و نیز ترکیب عصاره حاوی مخلوط سه گیاه نعناع و گشنیز و بادرنجبویه و عصاره گیاهی خارخاسک و فاژ اثر هم¬افزایی ضد باکتریایی بر¬روی باکتریها دارد. درصد جذب فاژ با گذشت زمان روند صعودی به خود میگیرد. بررسی طیف فعالیت لیتیک باکتریوفاژهای جدا شده در مطالعه حاضر نشان داد، فاژهای جداسازی شده دارای تاثیر ¬روی 53 سویه (25/66 %) و عدم تاثیر روی 27 سویه (75/33 %) از سویه-های اشریشیاکلی می¬باشد. باکتریوفاژهای جداسازی شده با اثر باکتری¬¬کشی علیه اکثر سویه¬های اشریشیا¬کلی میتوانند کاندیداهای خوبی جهت استفاده در فاژدرمانی بر¬علیه این عفونتها باشند. در صورت استفاده همزمان فاژ و سه نوع عصاره گیاهی، فعالیت ضد¬میکروبی فاژ افزایش مییابد و در این میان تاثیر عصاره گیاهی آویشن کوهی بیشتر بود که میتواند منجر به تولید عوامل ضد میکروبی جدید جهت درمان عفونتهای ناشی از باکتریها با مقاومت دارویی شود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13668 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24593 BIO microb 35 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت جداسازی و شناسایی پروبیوتیک های مؤثر بر استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین (1400) / افلاکی ، افسانه، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه افلاکی ، افسانه، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 30 عنوان : جداسازی و شناسایی پروبیوتیک های مؤثر بر استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین عنوان موازی : Isolation and Characterization of Effective Probiotics against Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: 78ص شابک/شاپا 24588 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی سلولی و مولکولی گرایش میکروبیولوژی شناسه افزوده : شکری ، داریوش، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما توصیفگرها مقاومت آنتیبیوتیکی، استافیلوکوکوس اورئوس، MRSA، متی¬سیلین، پروبیوتیک Antibiotic Resistance, Staphylococcus aureus, MRSA, Methicillin, Probiotics چکیده : یکی از مشکلات عمده¬ بهداشت جهانی، عفونت¬های بیمارستانی و مقاومت¬های آنتی¬بیوتیکی متعاقب آن¬ها می¬باشد و همین امر کارشناسان را به ایجاد راهکارهای جدید برای مقابله با این معضل واداشته است. از طرفی مقاومت¬های آنتی¬بیوتیکی در جهان به دلیل مصرف بالای آنتی¬بیوتیک¬ها روز به روز در حال افزایش بوده است و از این میان باکتری استافیلوکوکوس اورئوس و سویه های مقاوم به متیسیلین (MRSA) در طی چند دهه¬ی گذشته مبدل به یکی از شایع¬ترین عوامل عفونت بیمارستانی گشته است و در نتیجه نیاز به درمانهای جایگزین آنتیبیوتیکی، کاملاً محسوس می¬باشد. هدف از این تحقیق جداسازی و شناسایی پروبیوتیکهای موثر بر سویه های MRSA و بررسی خواص آنها و همچنین تعیین اثر ضد بیوفیلمی آنها بود. تعداد 54 نمونه ی استافیلوکوکوس اورئوس از چند بیمارستان شهر اصفهان جداسازی شد و پس از تعیین تست حساسیت آنتیبیوتیکی که موثرترین آنتی بیوتیک¬ها کلرامفنیکل با 8/77%، تریمتوپریم سولفامتاکسازول با 6/75% و کلیندامایسین با 4/55% بودند، 37 سویه واجد مقاومت به متی¬سیلین انتخاب شد و اثر 22 باکتری پروبیوتیک مختلف جداسازی شده از محصولات لبنی علیه آنها و تشکیل بیوفیلم¬شان مورد بررسی قرار گرفت. دو باکتری پروبیوتیک موثرعلیه تمامی سویه¬های استافیلوکوکوس اورئوس و MRSA و بیوفیلم آنها با روش انتشار از چاهک در آگار (مهار نقطه ای) جداسازی شد. تعیین کمترین غلظت مهاری (MIC) و کشندگی (MBC) به کمک روش میکروتیتر پلیت نشان داد دو پروبیوتیک منتخب دارای عدد MIC با رقتهای 4/1و 8/1و عدد MBC با رقتهای 1 و 4/1 بودند. همچنین نتایج نشان داد این پروبیوتیکها فقط بعد از 12 ساعت باعث کشتار باکتریهای فوق گردیدند. تستهای بیماریزایی مختلف از جمله کاتالاز، همولیز، DNase و حساسیت آنتیبیوتیکی در دو سویه پروبیوتیک نشان دهنده عدم بیماریزایی و عدم وجود مقاومت آنتیبیوتیکی در آنها بود. در واقع دو سویه پروبیوتیک جداسازی شده در این مطالعه که لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس و لاکتوباسیلوس دلبروکی تشخیص داده شدند، دارای خواص ضد باکتریال و ضد -بیوفیلمی بسیار مناسب علیه تمامی سویه¬های مقاوم به داروی متی¬سیلین بودند که با توجه به خواص مطلوب این باکتریهای پروبیوتیک، می¬توانند جایگزین مناسبی برای آنتیبیوتیکها شوند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13663 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24588 BIO microb 30 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه سلمانی ، محدثه، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 47 1402 عنوان : جداسازی و شناسایی پروبیوتیک های موثر بر سویه های شیگلا و سالمونلا عنوان موازی : Isolation and Characterization of Effective Probiotics against Shigella and Salmonella Strains ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 116ص شابک/شاپا 25073 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب¬های بیماری¬زا شناسه افزوده : شکری ، داریوش، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد مشاور توصیفگرها حساسیت آنتی بیوتیکی، باکتری شیگلا، باکتری سالمونلا، باکتری گرم منفی ،پروبیوتیک . antibiotic sensitivity, Shigella bacteria, Salmonella bacteria, Gram-negative bacteria, Probiotics. چکیده : زمینه و هدف: امروزه با توجه به شیوع بیماری های گوارشی در جامعه و افزایش تعداد بیماران به خصوص بیماران بستری در بیمارستان ها و افزایش روز افزون مقاومت های آنتی بیوتیکی و اثر ضعیف برخی از آنتی بیوتیک ها نسبت به انتروپاتوژن های گوارشی و همچنین عدم وجود آنتی بیوتیک های جدید برای درمان میکروارگانیسم های مقاوم شده افزایش یافته و تلاش ها به دنبال روش و راهکار های جدید از جمله روش های جایگزین مانند استفاده از پروبیوتیک ها افزایش یافته است. هدف از این مطالعه جداسازی و شناسایی پروبیوتیک های موثر بر سویه های شیگلا و سالمونلا بود.
مواد و روش¬ها: در این مطالعه ابتدا در طی مدت زمان نه ماه ، سویه های شیگلا وسالمونلا از نمونه¬ی بالینی شامل مدفوع از بیماران بستری در چهار بیمارستان استان اصفهان(الزهرا، عسگریه ، میلاد و امین) جداسازی شد. شناسایی و تعیین هویت سویه ها با استفاده از آزمون¬های افتراقی و بیوشیمیایی انجام¬گردید. که 17سویه شیگلا و سالمونلا شناسایی¬شد. تست حساسیت آنتی-بیوتیکی طبق استانداردCLSI2022 انجام شد. و اثر ضدمیکروبی و مهاری28 سویه پروبیوتیک جداشده از محصولات لبنی محلی مختلف علیه این سویه¬ها با روش¬های انتشار از چاهک در آگار، تست کشندگی و مدت زمان¬کشندگی انجام گرفت. و سویه های پروبیوتیک مورد نظر که نتایج مهاری وسیع¬الطیف¬تری داشتند انتخاب شده و سپس تست¬های¬ تعیین مکانیسم مهاری احتمالی و مقاومت به اسید و تعیین نوع و غلظت اسیدهای آلی توسط روش HPLC انجام شد. مقادیرMIC وMBC مورد بررسی قرار گرفت واثر ضدبیوفیلمی سویه های پروبیوتیک مورد نظر بر روی تشکیل بیوفیلم سویه های شیگلا و سالمونلا به کمک روش میکروتیترپلیت انجام گرفت. و بررسی اثر سمیت سلولی پروبیوتیک با تستMTT بر روی لاین سلولی فیبروبلاست L929 انجام گرفت. و در نهایت پروبیوتیک توسط تست¬های بیوشیمیایی و روش توالی یابی، ژن 16SrRNA تعیین هویت گردیدند، و بعد از آن درخت فیلوژنی مربوط به هر باکتری رسم گردید.
یافته¬ها: نتایج تست حساسیت آنتی¬¬بیوتیکی نشان داد که بیشترین حساسیت هر دوسویه شیگلا و سالمونلا نسبت به آنتی¬بیوتیک سیپروفلوکساسین بود. و بیش ترین مقاومت سویه شیگلا به تری¬متوپریم سولفامتوکسازول 98/99% و سویه سالمونلا بیش ترین مقاومت به سفپیم داشت. انجام تستهای مهاری و کشندگی اثرات بالقوه این سویه های پروبیوتیک در کشتن سویه¬های شیگلا و سالمونلا مورد تایید قرار¬گرفت که نتایج نشان¬داد مهار باکتری های پاتوژن شیگلا توسط پروبیوتیک شماره 3A* بعد از 12ساعت ،پروبیوتیک شماره4B*بعد از 2 ساعت و پروبیوتیک شماره 1B بعد از 12ساعت می باشد، و حداقل زمان مورد نیاز برای مهار باکتری پاتوژن سالمونلا توسط پروبیوتیک شماره 3A* بعد از4ساعت، پروبیوتیک شماره 4B* بعد از1ساعت و پروبیوتیک شماره 1B بعد از 8ساعت می باشد. و مکانیسم مهاری آن به دلیل وجود اسیدلاکتیک و اسیداستیک و فرمیک اسید بوده است. نتایج روش¬میکروتیترپلیت نشان¬داد نتیجه MIC برای پروبیوتیک کد 4B*در غلظت □("1" /"4") و پروبیوتیک کد 3A*در غلظت □("1" /"2") مهارونتیجه MBC برای پروبیوتیک کد 4B* در غلظت □("1" /"2") و پروبیوتیک کد 3A* در غلظت 1توانسته به طورکامل سویه¬ی پاتوژن را از بین ببرد، و اثر ضدبیوفیلمی آن در غلظت¬های□("1" /"2") و □("1" /"4") و1می¬باشد. نتایج تستMTT نشان داد باکتری های پرو بیوتیک سمیتی ندارند و درصنعت از جمله صنایع دارویی و غذایی قابل استفاده و ایمن هستند. و نتایج تعیین توالی نشان¬داد که دوسویه پروبیوتیک باکتری کد4B*(Leuconostoc pseudomesenteroides)وباکتری کد3A* (Streptococcus lutetiensis)می باشدلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14083 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 25073 BIO microb 47 1402 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت جداسازی و شناسایی پروبیوتیک¬های مهاری علیه باکتری استرپتوکوکوس آگالاکتیه (1401) / تذهیبی ، آیه، نویسنده
نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه تذهیبی ، آیه، نویسنده ردهبندی کنگره : BIO microb 25 عنوان : جداسازی و شناسایی پروبیوتیک¬های مهاری علیه باکتری استرپتوکوکوس آگالاکتیه عنوان موازی : Isolation and identification of inhibitory probiotics against Streptococcus agalactiae ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 82ص شابک/شاپا 24583 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب های بیماری زا شناسه افزوده : شکری ، داریوش، استاد راهنما قاسمی ، سید مهدی، استاد راهنما جلیلی ، مریم السادات، استاد مشاور توصیفگرها استرپتوکوکوس آگالاکتیه، پروبیوتیک، لاکتوباسیلوس، بارداری Streptococcus agalactiae, probiotic, lactobacillus, pregnancy چکیده : زمینه و هدف:
امروزه با افزایش روزافزون عفونت¬های ناشی از پاتوژن¬های گرم مثبت به ویژه استرپتوکوکوس¬ها و استفاده بیرویه از آنتی¬بیوتیک¬ها، درمانی کم خطر برای مهار سویه¬های باکتریایی بسیار کاربردی خواهد بود. بهکارگیری پروبیوتیک¬ها برای مهار و کاهش کلونیزاسیون سویه¬های باکتریای، یک روش غیرشیمیایی درمانی است. هدف از این مطالعه، جداسازی و شناسایی پروبیوتیک¬های مؤثر بر سویه¬های استرپتوکوکوس آگالاکتیه بود.
مواد و روش¬ها: در این مطالعه ابتدا در طی مدت شش¬ماه، سویه¬های باکتری استرپتوکوکوس آگالاکتیه از بیماران در آزمایشگاه نوبل جمع¬آوری شد. شناسایی و جداسازی سویه¬ها با استفاده از آزمون¬های افتراقی و بیوشیمیایی انجام ¬شد که در نهایت 60 نمونه باکتری استرپتوکوکوس آگالاکتیه شناسایی¬گردید. در ابتدا تست حساسیت آنتی¬بیوتیکی بر طبق استاندارد CLSI2020 انجام گرفت. اثر مهاری 20 باکتری پروبیوتیک جدا شده از محصولات لبنی محلی علیه این سویه¬ها با روش¬های انتشار از چاهک در آگار، تست کشندگی و مدت زمانکشندگی بررسی گردید. دو پروبیوتیک که نتایج مهاری وسیعی داشتند انتخاب گردید و مقادیر MIC (کمترین غلظت مهاری) و MBC (کمترین غلظت کشندگی) و اثر ضدبیوفیلمی آن بر روی تشکیل بیوفیلم استرپتوکوکوس آگالاکتیه به کمک روش میکروتیترپلیت انجام گرفت. سپس تست¬های¬ تعیین مکانیسم مهاری احتمالی و مقاومت به اسید و تعیین نوع و غلظت اسیدهای آلی توسط روش HPLC (کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا) انجام شد. در نهایت پروبیوتیک¬ها توسط تست¬های بیوشیمیایی و روش توالییابی، ژن 16SrRNA تعیین هویت گردید.
یافته¬ها:. نتایج تست حساسیت آنتی¬بیوتیکی نشان داد که بیشترین حساسیت باکتری استرپتوکوکوس آگالاکتیه به دو آنتی¬بیوتیک لینزولید و ونکومایسین است درحالی که این باکتری بیشترین مقاومت را به تتراسایکلین نشان داد. با انجام تست¬های مهاری و کشندگی، اثرات بالقوه پروبیوتیک¬ها بر این باکتری مورد تأیید قرار گرفت. این نتایج نشان داد که پروبیوتیک¬ها فقط بعد از گذشت یک ساعت باعث کشتن سویه¬های استرپتوکوکوس آگالاکتیه می¬گردند. در میان پروبیوتیک¬های مورد مطالعه، مکانیزم مهاری پروبیوتیک¬ها به واسطه تولید اسید استیک و اسید لاکتیک است که اثر کشندگی ایجاد نمود. همچنین نتایج روش میکروتیتر پلیت نشان داد پروبیوتیک مورد مطالعه ما به ترتیب در غلظت (پروبیوتیک پنیر لاکتیکی)و (پروبیوتیک پنیر لیقوان) علاوه بر مهار به طور کامل سویه پاتوژن را از بین می¬برد. نتایج تعیین توالی نشان¬داد که باکتری¬های پروبیوتیک مورد مطالعه ما، لاکتیپلنتیباسیلوس پنتوسوس و لاکتیکازئیباسیلوس پاراکازائی می¬باشد.
نتیجه¬گیری نهایی: در این مطالعه لاکتوباسیلوس¬های جداشده از محصولات لبنی دارای خواص ضدمیکروبی و ضدبیوفیلمی بالقوه علیه تمامی سویه¬های استرپتوکوکوس آگالاکتیه بودند. بنابراین میتوان از آنها بهعنوان جایگزینی سالم بهصورت مکمل¬های خوراکی در برابر عفونت¬های ناشی از کلونیزاسیون GBS استفاده کردلینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13658 زبان مدرک : فارسی
شماره ثبت شماره بازیابی نام عام مواد محل نگهداری بخش وضعیت ثبت وضعیت امانت 24583 BIO microb 25 پایاننامه دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی مرکزی اسناد مرجع غیر قابل امانت