‭BIO microb I

‭BIO CM
‭BIO gen
‭BIO microb

رکوردهای موجود با شماره رده : ‭BIO microb I

افزایش بهره¬وری تولید پلی هیدروکسی بوتیرات با استفاده از آرکئا (1401) / چاهیان چی ، شیوان، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه چاهیان چی ، شیوان، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭3 عنوان : افزایش بهره¬وری تولید پلی هیدروکسی بوتیرات با استفاده از آرکئا عنوان موازی : Increasing the production efficiency of PHB using archaea ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 99ص شابک/شاپا 24658 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : عباسی ، سهیلا، استاد راهنما جلیلی ، مریم السادات، استاد راهنما امتیازی ، گیتی، استاد مشاور توصیفگرها پلی¬هیدروکسی بوتیرات، هالوفیل، اسید کورتونیک، پلاستیک تخریب پذیر  polyhydroxybutyrate, halophiles; cortonic acid, biodegradable plastics چکیده : استفاده زیاد از پلاستیک¬های معمولی منجر به مشکلات زیست محیطی جدی شده است. پلی¬هیدروکسی آلکانوات¬ها (PHAs) به دلیل وجود طبیعت زیست تخریب پذیر آن¬ها، جایگزینی قوی برای پلاستیک¬های مصنوعی هستند. در قلمرو آرکئا برخی جنس¬های متعلق به گروه هالوآرکئا به عنوان تولید‌کنندگان پلی-هیدروکسی بوتیرات(PHB) شناسایی شده¬اند. در این مطالعه جهت جداسازی هالوفیل¬ها نمونه¬های نمکی از نقاط متفاوت ایران جمع¬آوری و به آزمایشگاه منتقل و سپس کلنی¬های متفاوت خالص‌سازی گردیده و جدایه¬ها جهت بررسی کیفی تولید PHB با استفاده از رنگ¬آمیزی سودان سیاه غربال¬گری شدند. سپس جدایه برتر با استفاده از سنجش کمی وزن خشک و غلظت (بر اساس جذب UV کروتونیک اسید تولید شده) انتخاب شد. اثر منابع متفاوت کربن، نیتروژن و غلظت نمک در تولید PHB بررسی و اثر پارامترهای متفاوت دما، هوادهی و pH بر تولید PHB نشان داده شد. پودر PHB به دست آمده مورد آنالیز فیزیکو- شیمیایی طیف‌سنجی تبدیل فوریه مادون قرمز(FTIR) و طیف سنجی رزونانس مغناطیسی هسته¬ای (1HNMR)و کروماتوگرافی نفوذ ژل (GPC) قرار گرفت. نتایج نشان داد که سویه هالوآرکئوم اسیدیفیلوم (Halarchaeum acidiphilum ASDL78) جدا شده از کویر لوت ایران در محیط کشت آرکئا، حاوی 5/12% کلرید سدیم و pH برابر 6/7 در دمای 37 درجه سانتیگراد در فاز سکون رشد، مقدار 4/6 گرم بر لیتر PHB تولید کرد. همچنین بیشترین راندمان برای این سویه 58/71 درصد تعیین شد. آنالیز فیزیکو- شیمیایی PHB با تست FTIR و GPC تولید PHB را تأیید و تجزیه و تحلیل توسط 1HNMR نشان داد در این مطالعه علاوه بر PHB مقداری پلی-هیدروکسی بوتیرات- والرات (PHBV) هم تولید شده است که دارای خواص مفیدتری نسبت به PHB است. سویه‌های هالوفیل پتانسیل بالایی برای تولید پلی¬هیدروکسی بوتیرات دارند. از آنجایی¬که هالوآرکئا نیازی به شرایط استریل ندارند و می‌توان از آب شور برای تهیه محیط کشت استفاده کرد همچنین بازیابی گرانول¬های PHB سریع و کم هزینه است، این میکروارگانیسم¬ها می‌توانند در تولید بیوپلاستیک‌ها از نظر اقتصادی بیشتر از باکتری ها مفید باشند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13733 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24658	‭BIO microb I ‭3	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی اثر ضدباکتریایی عصاره‌های گزنه و پونه، اثر ترکیبی آن‌ها باهم و اثر ترکیبی آن‌ها با نانوذرات نقره و مس (1402) / ثابت ، یوسف، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه ثابت ، یوسف، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭14 1402 عنوان : بررسی اثر ضدباکتریایی عصاره‌های گزنه و پونه، اثر ترکیبی آن‌ها باهم و اثر ترکیبی آن‌ها با نانوذرات نقره و مس عنوان موازی : Investigating the antibacterial effect of nettle and oregano extracts, their combined effect together, and their combined effect with silver and copper nanoparticles ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 129ص شابک/شاپا 25074 یادداشت پایان¬نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : شیخ بیگلو ، نیما، استاد راهنما چرخیان ، حامد، استاد مشاور توصیفگرها پونه کوهی، گزنه، نانوذرات مس، نانوذرات نقره، فعالیت ضدباکتری، هم‌افزایی.  oregano, nettle, copper nanoparticles, silver nanoparticles, antibacterial activity, synergism چکیده : عفونت‌های میکروبی و گسترش مقاومت های دارویی در این میکروارگانیسم ها سالانه جان افراد بسیاری را در سراسر جهان به خطر می اندازد. فعالیت ضدباکتریایی ترکیبات گیاهی، دارای پتانسیل قابل توجهی برای مهار میکروارگانیسم‌های بیماری‌زا است. عصاره گزنه، عصاره پونه و نانوذرات دارای خواص ضدمیکروبی هستند اما فعالیت ضدمیکروبی آنها در ترکیب با یکدیگر تاکنون ارزیابی نشده است. لذا هدف از این مطالعه، بررسی اثر ضدباکتریایی عصاره های گزنه و پونه، اثر ترکیبی آنها با نانوذرات نقره و مس می‌باشد. گیاهان پونه و گزنه از مناطق بیوران شهرستان سردشت (آذربایجان غربی) جمع‌آوری، شناسایی و عصاره‌گیری از آنها به روش سوکسله انجام شد. به منظور ارزیابی اثرات ضدباکتریایی و هم‌افزایی ترکیبات علیه باکتریهای جداشده از عفونت واژن از ول‌دیفیوژن استفاده شد. حداقل غلظت مهارکنندگی و حداقل غلظت بازدارندگی ترکیبات نیز مشخص گردید. جهت شناسایی ترکیبات شیمیایی موجود در عصاره‌ها از کروماتوگرافی گازی-طیف سنج جرمی (GC-MS) استفاده شد. بر اساس مشاهدات عصاره‌های 10 درصد وزنی -حجمی گیاه گزنه و پونه کوهی توان مهار رشد هیچ یک از ایزوله‌های باکتریایی را در آزمون MIC و ول‌دیفیوژن نداشتند. نانوذره مس به‌طور میانگین با ایجاد 5/33 درصد قطر هاله بزرگ‌تر نسبت به نانوذره نقره، قدرت ضدباکتریایی بیش‌تری را نشان داد و باکتری‌های B2064 و B3283 جداشده از عفونت واژن، به‌ترتیب مقاوم‌ترین و حساس‌ترین عامل عفونی در مقابل این نانوذرات بودند. نانوذره مس به‌طور میانگین با ایجاد 5/33 درصد قطر هاله بزرگ‌تر نسبت به نانوذره نقره، قدرت ضدباکتریایی بیش‌تری را نشان داد. هم‌چنین MIC و MBC نانوذره مس علیه باکتری‌های مورد آزمون بین 625 تا 5000 میکروگرم بر میلی‌لیتر و نقره بین 1250 تا 5000 میکروگرم بر میلی‌لیتر متغیر بود. سوسپانسیون حاصل از ترکیب نانوذره مس و نقره و عصاره تام 10 درصد گزنه توانست به طور میانگین به ترتیب باعث افزایش 87/9 و 74/13 درصد قطر منطقه عاری از باکتری در مقایسه با حالت انفرادی این نانوذرات شود. بیش‌ترین ترکیبات یافت شده در عصاره گزنه به‌ترتیب متعلق به hexadecanoic acid، octadeca-9,12,15-trien-1-ol، Phytol، Piperitenone و Vitamin e و در عصاره پونه به‌ترتیب متعلق به Piperitenone وPiperitenone Oxide بودند. نانوذرات مس و نقره دارای اثرات بازدارندگی علیه عوامل عفونی جداشده از عفونت واژن می‌باشند که اثر بازدارندگی نانوذره مس بیش‌تر از نانوذره نقره بود. اما عصاره‌های تام گزنه و پونه به‌تنهایی نتوانستند مانع رشد عوامل پاتوژن شوند ولی در ترکیب با نانوذرات موجب هم‌افزایی خاصیت ضدباکتریایی شدند که این تاثیر در عصاره گزنه قوی تر بود. می‌توان از این ترکیبات در مبارزه با عوامل عفونی و پیشگیری از گسترش عفونت استفاده کرد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14084 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25074	‭BIO microb I ‭14 1402	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی اثر نانوذرات Fe3O4 بر تولید بیوسورفکتانت توسط باکتری¬های جدا شده از خاک و لجن¬های نفتی (1401) / شاهقلیان قهفرخی ، فائزه، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه شاهقلیان قهفرخی ، فائزه، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭11 عنوان : بررسی اثر نانوذرات Fe3O4 بر تولید بیوسورفکتانت توسط باکتری¬های جدا شده از خاک و لجن¬های نفتی عنوان موازی : Investigating the effect of Fe3O4 nanoparticles on biosurfactant production by bacteria isolated from soil and oil sludge ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 70ص شابک/شاپا 24921 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی گرایش میکروبیولوژی صنعتی شناسه افزوده : شهیدی ، معصومه سادات، استاد راهنما جلیلی طبایی ، مریم السادات، استاد راهنما مرادی ، مریم، استاد مشاور توصیفگرها لجن نفتی، بیوسورفکتانت، نانوذرات آهن، اسینتوباکتر رادیورزیستنس، استنوتروفوموناس اسیدامینیفیلا  oil sludge, biosurfactant, iron nanoparticles, Acinetobacter radioresistens, Stenotrophomonas acidaminiphila چکیده : هدف تحقیق: امروزه مطالعه بر روی برهمکنش نانوذرات با باکتری ها مورد توجه فزاینده ای قرار گرفته است. گزارش¬های مختلف همچنین نشان داده¬اند که نانوذرات می¬توانند رشد باکتری ها و تولید بیوسورفکتانت را بهبود بخشند. بر همین اساس هدف تحقیق حاضر بررسی اثر نانوذرات آهن Fe3O4 بر تولید بیوسورفکتانت توسط باکتری¬های جدا شده از خاک و لجن¬های نفتی بود. روش تحقیق: نمونه برداری از خاک و لجن¬های نفتی انجام شد و سپس جهت غنی¬سازی و جداسازی باکتری¬ها از محیط کشت Mineral Salt Medium (MSM) استفاده شد. توانایی تولید بیوسورفکتانت توسط ایزوله¬ها با استفاده از تست¬های همولیز، تعیین کشش سطحی، فروپاشی قطره، گسترش نفت در پلیت، امولسیفیکاسیون و E24% مورد ارزیابی قرار گرفت. سپس با افزودن نانوذرات اکسید آهن به محیط کشت، توانایی تولید بیوسورفکتانت با نمونه های رشد یافته در محیط کشت فاقد نانوذرات مقایسه گردید. در نهایت ایزوله ای که بهترین عملکرد را دارا بود، با استفاده از تست¬های بیوشیمیایی و مولکولی شناسایی گردید. یافته ها: به طور کلی 16 ایزوله از نمونه¬های خاک و لجن¬های نفتی جداسازی شدند که شامل 5 باسیل، 8 کوکسی و 3 کوکوباسیل بودند. از این بین 9 ایزوله دارای توانایی همولیز آلفا بودند. نتایج نهایی تست¬ها نشان داد که دو ایزوله¬ی 5B و 6B بهترین عملکرد را در تولید بیوسورفکتانت در حضور نانوذرات آهن دارند و به همین دلیل مورد شناسایی قرار گرفتند. نتایج بلاست توالی¬ها نشان داد که ایزوله¬ها¬ی 5B و 6B به ترتیب اسینتوباکتر رادیورزیستنس و استنوتروفوموناس اسیدامینیفیلا می¬باشند. نتیجه گیری: نتایج تحقیق حاصل نشان داد که نانوذرات اکسید آهن می¬توانند در افزایش توانایی تولید بیوسورفکتانت توسط گونه¬های باکتریایی مؤثر باشند و لذا می¬توان از آن¬ها در صنعت استفاده نمود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13951 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24921	‭BIO microb I ‭11	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی برهم کنش ژن کد کننده ی پروتئین SFRP2با RNA طویل غیر کدکننده ی CHKB-AS1 و تغییرات بیان این دو ژن در نمونه های سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR (1401) / حبیبی دهقی ، فاطمه، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه حبیبی دهقی ، فاطمه، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭8 عنوان : بررسی برهم کنش ژن کد کننده ی پروتئین SFRP2با RNA طویل غیر کدکننده ی CHKB-AS1 و تغییرات بیان این دو ژن در نمونه های سرطان معده با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک و آزمایش qRT-PCR عنوان موازی : Evaluation of the interaction and expression level of SFRP2 mRNA and lncRNA CHKB-AS1 in the gastric cancer samples, based on the integrated bioinformatics and qRT-PCR analysis ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 63ص شابک/شاپا 24712 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد:رشته ژنتیک گرایش میکروبیولوژی صنعتی توصیفگرها سرطان معده، نشانگر زیستی، SFRP2، lncRNA، real-time PCR  Bioinformatics, SFRP2, RNA interaction, gastric cancer, CHKB-AS1. چکیده : سرطان معده دومین عامل مرگ و میر بر اثر سرطان در دنیاست. این سرطان در کشورهای شمال شرق آسیا بیشترین میزان شیوع را داراست. در ایران نیز این سرطان به عنوان سومین عامل مرگ و میر در جهان معرفی شده و از بین سرطان های مرتبط با دستگاه گوارش، نیمی از بیماری ها را سرطان دستگاه گوارش معرفی کرده اند. این بیماری عوامل متعدد عفونی (مانند باکتری هلیکوباکتر پیلوری) و غیرعفونی (مانند مصرف دخانیات) را داراست که مجموعه ی این عوامل بر سطح بیان ژن های کد کننده و غیر کد کننده ی پروتئین اثر گذاشته و با تغییرات در حالت های عادی بیان ژن ها، می توانند منجر به ایجاد بدخیمی شوند. در این مطالعه، با بررسی وضعیت بیان ژن کد کننده ی پروتئین SFRP2 و RNA طویل غیرکدکننده ی CHKB-AS1، تغییرات بیانی این ژن ها، ارتباط احتمالی آنها در نمونه های سرطان معده و پتانسیل بیومارکری این دو ژن مورد ارزیابی قرار می گیرد. در ابتدا با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیک، تغییرات بیان و برهم کنش احتمالی این دو RNA پیش بینی شد. با استفاده از آنالیز داده های microarray، تغییرات بیان ژن SFRP2 مشخص شد. با استفاده از پایگاه داده های مرتبط با برهم کنش lncRNA – mRNA، برهم کنش احتمالی RNA های مورد بررسی نیز بررسی شد. با استفاده از پایگاه داده ی ENCORI، تغییرات بیان SFRP2 و CHKB-AS1 مورد تایید قرار گرفته و در نهایت پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، با استفاده از آزمایش real-time PCR، بیان این دو RNA در 20 نمونه ی بیمار در مقایسه با 20 نمونه ی سالم مورد ارزیابی قرار گرفت. بر اساس آنالیز داده های microarray، پایگاه داده ی ENCORI و آزمایش qRT-PCR، بیان هر دو ژن SFRP2 و CHKB-AS1 در نمونه های سرطان معده افزایش معنادار نشان داد و این دو RNA در نمونه های سرطان معده دارای همبستگی مثبت می باشند. نتیجه گیری: افزایش بیان SFRP2 که می تواند ناشی از افزایش بیان lncRNA CHKB-AS1 باشد، می تواند یکی از عوامل مهم در افزایش ریسک ابتلا به سرطان معده و پیشرفت این بیماری محسوب شود. بنابراین افزایش بیان CHKB-AS1 می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی قابل قبول برای تشخیص نمونه های سرطان معده مورد استفاده قرار گیرد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13778 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24712	‭BIO microb I ‭8	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی تجزیه ترکیبات BTEX توسط میکروارگانیسم¬های جداشده از فاضلاب پتروشیمی و خاک آلوده به نفت و لجن نفتی (1402) / محمودی پناه ، سیده زهرا، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه محمودی پناه ، سیده زهرا، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭15 عنوان : بررسی تجزیه ترکیبات BTEX توسط میکروارگانیسم¬های جداشده از فاضلاب پتروشیمی و خاک آلوده به نفت و لجن نفتی عنوان موازی : M.Sc Thesis Microbiology Investigating the decomposition of BTEX compounds by microorganisms isolated from petrochemical wastewater and soil contaminated with oil and oil sludge ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 91ص شابک/شاپا 25275 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته زیست شناسی گرایش میکروبیولوژی صنعتی شناسه افزوده : جلیلی طبایی ، مریم السادات، استاد راهنما توصیفگرها ترکیبات BTEX، تجزیه زیستی، کروماتوگرافی GC، باسیل، کوکوباسیل، کوکسی  BTEX compounds, biodegradation, GC chromatography, bacillus, coccobacillus, cocci چکیده : هدف تحقیق: ترکیبات نفتی از جمله رایج¬ترین نوع آلودگی در زیست بوم¬های خشکی و آبی به خصوص در مناطق نفت خیز می¬باشند که تهدید جدی برای اکوسیستم به شمار می¬آیند. در این میان می¬توان به فراوان¬ترین ترکیبات هیدروکربنی که در آب¬های آلوده به مواد نفتی هست، اشاره نمود که این آلاینده¬ها شامل بنزن، تولوئن، اتیل بنزن و گزیلن با سمیت بالا و دارای پتانسیل جهش¬زایی و سرطان¬زایی هستند. تاکنون تحقیقات گسترده¬ای در زمینه جوامع میکروارگانیسم¬های قادر به تجزیه آلاینده¬های آلی صورت گرفته است و نقش اساسی میکروارگانیسم¬ها، قارچ¬ها و میکروجلبک¬ها در حذف مونوآروماتیک¬ها به اثبات رسیده است. باکتری¬ها و قارچ¬ها دارای توانایی متابولیکی برای استفاده از کربن نفت در سنتز سلولی خود هستند. بر همین اساس ، هدف تحقیق حاضر بررسی تجزیه زیستی ترکیبات BTEX توسط میکروارگانیسم¬های بومی جداشده از فاضلاب پتروشیمی، خاک آلوده به نفت و لجن نفتی بود. روش تحقیق: نمونه¬برداری از فاضلاب پتروشیمی و خاک آلوده به نفت و لجن نفتی انجام شد. سپس به منظور غنی¬سازی و جداسازی میکروارگانیسم¬ها از محیط کشت Mineral Salt Medium (MSM) استفاده شد. میکروارگانیسم¬های جداشده براساس توانایی آن¬ ها در رشد و تحمل BTEX غربال شدند. سپس میکروارگانیسم¬های منتخب از نظر تجزیه زیستی مورد مطالعه قرار گرفتند. برای این منظور از طریق خوانش OD600 باقیمانده BTEX محلول در حلال دی¬کلرومتان و سپس کروماتوگرافی GC برای اندازه-گیری دقیق انجام شد. درنهایت سویه¬هایی که بهترین عملکرد را داشتند با استفاده از تست بیوشیمیایی و مولکولی شناسایی شدند. یافته¬ها: بطور کلی 13 میکروارگانیسم از نمونه¬های جامد و مایع فاضلاب پتروشیمی و خاک آلوده به نفت و لجن نفتی جداسازی شدند که شامل چهار سویه باسیل، دو سویه کوکوباسیل، چهار سویه کوکسی، یک سویه مخمر و یک سویه کپک بودند. نتایج نهایی نشان داد که دو سویه باکتریایی M2 ، G2، مخمرK و کپک Kc بهترین عملکرد را در تجزیه زیستی BTEX داشتند. نتیجه گیری: نتایج تحقیق حاضر نشان داد که میکروارگانیسم¬های بومی جداشده از نمونه¬های نفتی، قادر به تجزیه زیستی ترکیبات BTEX به میزان قابل توجهی هستند و می¬توان از آن¬ها در صنعت استفاده کرد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14219 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25275	‭BIO microb I ‭15	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی تجزیه زیستی هیدروکربن های پلی آروماتیک نفتی توسط بهترین باکتری های جدا شده از خاک و آب آلوده به نفت (1403) / فیروزه السادات ، میرشمشیری، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه فیروزه السادات ، میرشمشیری، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭18 1403 عنوان : بررسی تجزیه زیستی هیدروکربن های پلی آروماتیک نفتی توسط بهترین باکتری های جدا شده از خاک و آب آلوده به نفت عنوان موازی : Investigating the biodegradation of petroleum polyaromatic hydrocarbons by the best bacteria isolated from oil-contaminated soil and water ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 68ص شابک/شاپا 25691 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد : رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : شهیدی ، معصومه سادات، استاد راهنما جلیلی طبایی ، مریم السادات، استاد مشاور توصیفگرها هیدرو کربن های آروماتیک، نفت، اصلاح زیستی  Aromatic hydrocarbons, petroleum, bioremediation. چکیده : نفت خام یکی از منابع اصلی انرژی در جهان مدرن است. این ماده شامل ترکیبات متنوعی از جمله هیدروکربن‌های آروماتیک چند حلقه‌ای (PAHs) است که به دلیل مقاومت بالا و اثرات زیست محیطی مضر، به عنوان آلاینده‌های خطرناک شناخته می‌شوند. این مطالعه با هدف بررسی پتانسیل تجزیه زیستی PAHs توسط باکتری‌های جدا شده از خاک و آب آلوده به نفت انجام شد. باکتری‌ها از منابع آلوده به نفت جدا شده و با استفاده از محیط‌های کشت مبتنی بر مواد معدنی و آزمایش شیمیوتاکسی غربالگری شدند. سپس پتانسیل تجزیه هیدروکربن‌ها توسط باکتری‌های انتخاب شده با استفاده از تکنیک‌های PCR و آنالیز GC-MASS ارزیابی شد. باکتری انتخاب‌شده شباهتی معادل 6/87% به ژن تجزیه‌کننده نفتالن نشان داد و در آنالیز GC-MASS توانست 6/91% از نفتالن را تجزیه کند که وجود و عملکرد ژن مربوطه را تأیید کرد. تحلیل رشد نشان داد که حداکثر رشد باکتری در محیط حاوی 1% نفت خام بین روزهای 9 تا 14 رخ داده است . علاوه بر این، باکتری فعالیت امولسیون کنندگی قابل توجهی نشان داد و نفت خام را به قطرات ریز تبدیل کرد که نشان‌دهنده توانایی تولید بیوسورفکتانت است و می‌تواند به طور قابل توجهی تجزیه نفت خام و PAHs را بهبود بخشد. نتایج نشان داد سویه جداشده دارای شباهت 6/97 درصد با ژن 16 Sr RNA ریبوزومی سودوموناس بوده است. که برخی از سویه‌های باکتریایی ظرفیت بالایی برای تجزیه ترکیبات نفتی دارند و می‌توانند به عنوان کاندیداهای مناسبی برای زیست‌پالایی در محیط‌های آلوده مورد استفاده قرار گیرند. این یافته‌ها نشان می‌دهد که زیست پالایی می‌تواند روشی کارآمد و پایدار برای کاهش آلودگی نفتی و حفاظت از محیط زیست باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14527 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25691	‭BIO microb I ‭18 1403	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی تولید بیوسورفکتانت توسط باکتری های جداسازی شده از نمونه های آلوده به نفت خام (1404) / باقری ، دانیال، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه باقری ، دانیال، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭27 1404 عنوان : بررسی تولید بیوسورفکتانت توسط باکتری های جداسازی شده از نمونه های آلوده به نفت خام عنوان موازی : Title of the Thesis ; Investigation of biosurfactant production by bacteria isolated from samples contaminated with crude oil ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1404 صفحه شمار: 86ص شابک/شاپا 26092 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد/: رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : شهیدی ، معصومه سادات، استاد راهنما جلیلی ، مریم السادات، استاد راهنما توصیفگرها بیوسورفکتانت، زیست‌پالایی، باکتری‌های بومی، لجن نفتی  Biosurfactant, Bioremediation, Indigenous bacteria, Oil sludge چکیده : آلودگی‌های نفتی از مهم‌ترین تهدیدات زیست‌محیطی به شمار می‌آیند که به دلیل پایداری ترکیبات هیدروکربنی، منجر به تخریب اکوسیستم‌ها و تهدید سلامت موجودات زنده می‌شوند. در این میان، استفاده از بیوسورفکتانت‌های تولیدشده توسط باکتری‌ها به‌عنوان جایگزینی سازگار با محیط زیست برای سورفکتانت‌های شیمیایی، به دلیل ویژگی‌هایی مانند زیست‌تجزیه‌پذیری، سمیت پایین و توانایی بالا در کاهش کشش سطحی و امولسیون‌سازی، مورد توجه گسترده قرار گرفته است. در این پژوهش توان تولید بیوسورفکتانت توسط 6 ایزوله جدا شده در مطالعات قبلی با آزمون‌های فروپاشی قطره، همولیز، گسترش روغن، امولسیفیکاسیون و شاخصE24 ارزیابی شد. الگوهای همولیز شامل آلفا برای ایزوله‌های 2C ، 1C ، 1B و 2A، بتا برای 1C و 1H و گاما برای 2H ، 1A و 5B مشاهده شد. نتایج نشان داد که ایزوله 1C و 5B بیشترین میزان تولید بیوسورفکتانت، ایزوله‌های 1A و 2A کمترین میزان تولید را نشان دادند. آزمون فروپاشی قطره برای ایزوله‌های 1B، 5B، و 2C مثبت بود. در آزمون گسترش روغن، ایزوله 2C بیشترین قطر هاله (25 میلی‌متر) را ایجاد کرد. در آزمون امولسیفیکاسیون، ایزوله 5B بالاترین ظرفیت (2/18) را داشت و شاخص E24 برای ایزوله 1C معادل 45/2% درصد بود. سپس استخراج بیوسورفکتانت و میزان تولید بیوسورفکتانت به‌صورت وزنی اندازه‌گیری و بر این اساس 2 بیوسورفکتانت 5B و 1C با بیشترین مقدار وزنی انتخاب گردید. بیوسورفکتانت های منتخب به منظور تعیین ویژگی‌های شیمیایی با تست های سنجش قند و پروتئین، HPLC، FTIR و بررسی شد. تست سنجش قند و پروتئین حضور ترکیب قندی و عدم حضور پروتئین را نشان داد. نتایج FTIR وجود گروه‌های عاملی مرتبط با لیپیدها و پلی‌ساکاریدها را تأیید نمود. آنالیز HPLC ترکیب غالب گلیکولیپید (80/8%) را در نمونه نشان داد. فعالیت ضدباکتریایی بیوسورفکتانت‌های استخراج‌شده نیز علیه Staphylococcus aureus به روش انتشار در آگار مطالعه و تایید گردید. و نتایج شناسایی مولکولی ایزوله 1C شباهت 96/5%درصدی آن را با جنس Pseudomonas آشکار ساخت. این پژوهش نشان داد که باکتری‌های بومی جداسازی‌شده از خاک و لجن نفتی، به‌ویژه ایزوله‌های 1C، 5B توانایی بالایی در تولید بیوسورفکتانت دارند و تأیید می‌کند که این جنس ها میتوانند نقش کلیدی در زیست‌پالایی و کاربردهای صنعتی ایفا می‌کند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14928 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
26092	‭BIO microb I ‭27 1404	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی تولید رنگدانه توسط قارچ موناسکوس پورپورئوس و بهینه سازی تولید (1401) / چکشی ، شیما، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه چکشی ، شیما، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭7 عنوان : بررسی تولید رنگدانه توسط قارچ موناسکوس پورپورئوس و بهینه سازی تولید عنوان موازی : Investigation of pigment production by Monascus purpureus and optimization of production ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 76ص شابک/شاپا 24662 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش میکروبیولوژی صنعتی شناسه افزوده : میرباقری فیروزآبادی ، مریم السادات، استاد راهنما جلیلی طبایی ، مریم السادات، استاد راهنما مرادی ، مریم، استاد مشاور توصیفگرها رنگدانه، Monascus purpureus، کشت بستر جامد، استافیلو کوکوس اورئوس، بهینه سازی  Pigment, Monascus purpureus, solid state culture, Staphylococcus aureus, optimization چکیده : رنگدانه¬های طبیعی از دو منبع مهم گیاهان و میکروارگانیسم¬ها تهیه می¬شوند. رنگ¬های تولید شده از قارچ¬ها کاربرد¬های زیادی در تغذیه و اقتصاد جامعه انسانی دارند و در صنعت قادرند تجارتی حدود 30 میلیارد دلار سودآوری در سال را داشته باشند. قارچ Monascus purpureus به دلیل توانایی بالای تولید رنگدانه¬های مختلف از نظر رنگ و ثبات شیمیایی از توجه خاصی برخوردار است. این قارچ از رده¬ی آسکومایست¬ها است دارای خواص و کاربردهای زیادی از جمله رنگ دهنده، طعم دهنده، نگهدارنده مواد غذایی و کاهنده کلسترول است. در این پروژه ابتدا سویه Monascus purpureus از سازمان پژوهش¬های علمی و صنعتی ایران خریداری شد و تولید رنگدانه به روش کشت غوطه¬ور در محیط کشت سنتزی مطالعه شد. برای تعیین شرایط بهینه و تولید رنگدانه عواملی مانند دما، هوادهی، pH، منبع کربن (گلیسرول، پسماند روغن خوراکی، گلوکز)، منبع نیتروژن (خیسانده ذرت، مونوسدیم گلوتامات، پپتون، عصاره مخمر، آمونیوم نیترات و سدیم نیترات) مورد بررسی قرار گرفت. استخراج رنگدانه ها با اتانول 70% حجمی استخراج شد و چگالی نوری در طول موج 510 نانومتر اندازه¬گیری شد. از طرف دیگر بررسی بر روی منابع کربنی در کشت بستر جامد نیز با استفاده از سبوس برنج، سبوس گندم و برنج انجام شد. بیشترین جذب در طول موج nm510 در 5/5 pHو سرعت هوادهی rpm 150 در ثبت شد و بازده تولید رنگدانه در منبع نیتروژنی به ترتیب خیسانده ذرت، مونوسدیم گلوتامات و در منبع کربنی به ترتیب گلیسرول و گلوکز بیش¬ترین مقدار بوده است. منبع نیتروژنی عصاره مخمر و پپتون اثر منفی در تولید رنگدانه داشتند و در محیط‌های حاوی این دو منبع رنگدانه‌ای تولید نشد. حداکثر تولید رنگدانه قرمز در محیط حاوی عصاره خیسانده ذرت بعد از 4 روز انجام شد که تولید رنگدانه در آن بسیار سریع¬تر سایر منابع نیتروژن (14روز) و با مقدار 856/1꓿510 OD نسبت به گلوکز با 54/1꓿510 OD بود. نتابج کشت بستر جامد نیز بیش¬¬ترین تولید بر روی برنج با OD برابر 428/1 را نشان داد. از سویی دیگر خواص ضد میکروبی رنگدانه تولیدی بر روی باکتری¬های بیماری¬زای استافیلوکوکوس اورئوس، اشرشیا کلی و سودوموناس آئروژینوزا و سالمونلا از روش¬های انتشار از دیسک، انتشار از چاهک و تعیین MIC و MBC انجام شد و نتایج نشان داد، رنگدانه-های این قارچ تنها بر روی باکتری استافیلوکوکوس اورئوس که از باکتری¬های گرم مثبت است اثر داشته و قطر هاله 22 میلی¬متر و MIC 64/0 میلی¬گرم بر میلی¬لیتر و MBC 64/0 میلی¬گرم بر میلی¬لیتر به دست آمد و رنگدانه بر باکتری¬های گرم منفی¬ اثر ضد میکروبی قابل توجهی نداشت. در نتیجه می¬توان با استفاده از منابع کربنی ارزان قیمت محصولی از این کپک تولید کرد که در صنایع غذایی و دارویی اثرات مفیدی داشته و هم تا حدی دارای اثر ضد میکروبی بر باکتری¬های عامل مسمویت غذایی باشد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13737 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24662	‭BIO microb I ‭7	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی تولید پپتید های ضدباکتری از باسیلوس کوآگولانس (1402) / موسوی ، الهام سادات، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه موسوی ، الهام سادات، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭17 1402 عنوان : بررسی تولید پپتید های ضدباکتری از باسیلوس کوآگولانس عنوان موازی : Study of Antibacterial Peptides Production from Bacillus coagulans ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1402 صفحه شمار: 97ص شابک/شاپا 25589 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : جلیلی ، مریم السادات، استاد راهنما آبکار ، مرتضی، استاد مشاور توصیفگرها باسیلوس کوآگولانس، کوآگولین، سابتیلوزین، پروتئین ضدمیکروبی، آنتی میکروبیال پپتید، مقاومت آنتی¬بیوتیکی، باکتریوسین  Bacillus Coagulans, Antibiotic resistance, Antimicrobial Peptids, Bacteriosin, Coagulin, Subtilosin چکیده : در سال‌های اخیر افزایش روزافزون مقاومت‌های آنتی‌بیوتیکی میکروارگانیسم‌ها و نیز عوارض جانبی ناشی از تجویز و مصرف نابجا و بی‌رویه آنتی‌بیوتیک‌ها، پژوهشگران را به مطالعه و بررسی اثرات ضدمیکروبی پروبیوتیک¬ها راغب ساخته است. بیماری‌های عفونی همراه با مقاومت چند دارویی، مشکل اصلی بهداشت عمومی در کشورهای در حال توسعه با افزایش مرگ و میر و عوارض هستند. جدای از تهدید مقاومت به چند دارو، چندین مطالعه تایید کرده‌اند که استفاده مداوم از آنتی بیوتیک‌ها می تواند به میکروفلور مشترک انسان آسیب برساند. تمرکز تحقیقاتی برای یافتن جایگزین مؤثر برای مبارزه با این پاتوژن¬ها بدون تأثیر بر فلور طبیعی ضروری است. در این راستا استفاده از پروبیوتیک¬ها و ترکیبات متابولیکی طبیعی آن¬ها می‌تواند جایگزینی در صنایع مختلف غذایی و دارویی باشد. درمیان پروبیوتیک¬ها، باکتری باسیلوس کوآگولانس در تولید، ذخیره سازی، حمل و نقل و مدیریت بسیار پایدار است و آن را به کاندیدای مناسب¬تری برای فرمولاسیون های غذایی و دارویی تبدیل می¬کند. باسیلوس کواگولانس یکی از چندین گونه‌ای است که اندوسپور تولید می‌کند که با کمک آن محیط‌های با شرایط سخت را تحمل کند. پروتئین‌های ضد میکروبی کوآگولین و لاکتوسپورین توسط این باکتری تولید می-شود. پپتیدهای ضدمیکروبی به طور سنتی به عنوان نگهدارنده‌های زیستی برای افزایش ماندگاری محصولات غذایی بدون به خطر انداختن خواص تغذیه‌ای و ارگانولپتیک آن‌ها استفاده می‌شوند. در این پژوهش سویه باسیلوس کوآگولانس ATCC 7050 تهیه گردید و بر روی محیط نوترینت آگار کشت داده¬شد. بعد از انجام رنگ¬آمیزی و تست و تایید سویه، سویه از لحاظ فیزیولوژیکی بررسی و منحنی رشد آن رسم شد. همچنین محیط کشت جدیدی طراحی و تولید شد و میزان تولید پپتید در سه محیط¬ (دست ساز، NB، و MRS) با بررسی میزان خاصیت ضد میکروبی سوپرناتانت حاوی ماده ضد میکروبی بر علیه باکتری گرم مثبت استافیلوکوکوس اورئوس با استفاده از روش چاهک آگار مورد ارزیابی قرار گرفت و مقایسه شد. ماده ضد میکروبی تولیدی توسط دستگاه فریزدرایر تغلیظ شده و پایداری نمونه ها در دماهای مختلف و زمان¬های نگهداری مختلف بر اساس میزان خاصیت ضد میکروبی آن‌ها مورد بررسی قرار گرفت. برای تعیین غلظت پروتئین نمونه‌ها تست برادفورد گذاشته شد. علاوه بر آن بهترین زمان و دمای انکوباسیون تولید ماده ضد میکروبی و اثر آن روی سایر باکتری¬های بیماری¬زا ازجمله اشرشیاکلی، لیستریا منوسیتوژنز، آسینتوباکتر بومانی و کلبسیلا پنومونیه مورد بررسی قرارگرفت. پروفایل آمینواسیدی آن نیز با HPLC و حضور ژن¬های پروتئین¬های ضد¬میکروبی کواگولین، سوبتیلین و سوبتیلوزین با انجام PCR و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج نشان دادند که پست بیوتیک تولیدی توسط باسیلوس کوآگولانس روی باکتری¬های بیماری¬زای گرم مثبت بیشتر از باکتری‌های گرم منفی اثر ضدمیکروبی نشان داد. محیط دست¬ساز استفاده شده در این پژوهش با استفاده از 5 درصد عصاره استخوان، 1 درصد پودر مخمر و 2 درصد آگار برای کشت باکتری¬های استافیلوکوکوس اورئوس، اشرشیاکلی و باسیلوس کواگولانس طراحی شد. بهترین روش تغلیظ نمونه ها روش فریزدرایر بود و از میان سه محیط کشت مورد بررسی‌، بر اساس نتایج به‌دست آمده قطر هاله عدم رشد برای باکتری استافیلوکوکوس اورئوس در محیط دست¬ساز (14 میلی متر بعد از تغلیظ نمونه) بهترین نتیجه را در مقایسه با قطر هاله عدم رشد پپتید ضدمیکروبی تولیدی در محیط های NB (12 میلی متر) و MRS (11 میلی متر) داشت که با نتایج حاصل از اندازه‌گیری میزان پروتئین همخوانی داشت. این پروتئین با میزان دوبرابر (30 میکرولیتر) روی باکتری¬های بیماری¬زایی مثل اشرشیاکلی(قطر هاله عدم رشد 12 میلی متر)، لیستریامنوسیتوژنز (قطر هاله عدم رشد 15 میلی متر)، آسینتو باکتر (قطر هاله عدم رشد 7 میلی متر) و کلبسیلاپنومونیه (قطر هاله عدم رشد 6.5 میلی متر) اثر ضدمیکروبی نشان داد. نتایج بررسی پایداری نشان داد که بهترین شرایط نگهداری برای سوپرناتانت حاوی پپتید ضدمیکروبی در دمای 20- درجه سانتی‌گراد و به مدت 4 هفته بود و نیز تا دمای 50 درجه سانتیگراد برای مدت 30 دقیقه فعالیت ضد میکروبی را حفظ نموده و مقاومت دمایی دارد. تولید پپتید ضدمیکروبی در فاز سکون باکتری بود و بهترین شرایط برای تولید پپتید ضدمیکروبی و در محیط دست¬ساز در دمای 37 درجه سانتی‌گراد و بعد از 48 ساعت بدست آمد. طیق نتایج HPLC نیز بیشترین میزان آمینواسید نمونه مربوط به آمینواسید لیزین بود و نتایج PCR نیز حضور باند بین 3000 - 3500 جفت بازی که مربوط به کواگولین است و باند 250-300 جفت بازی که مربوط به سابتیلوزین است را در باسیلوس کوآگولانس ATCC7050 ثابت کرد. توالی باند سابتیلوزین به میزان 100 درصد با ژن سابتیلوزین در گونه Bacillus sp.MD-5 و Bacillus sp.JS مشابهت داشت. در مجموع محیط دست ساز در این مطالعه با وجود قیمت پایین‌تر نسبت به دو محیط دیگر، دارای کارایی خوبی در تولید پپتید ضد میکروبی بود. خصوصیات ضد میکروبی با طیف وسیع برعلیه تعداد زیادی از باکتری‌های گرم مثبت و گرم منفی و نیز مقاومت بالای آن در برابر دما و قابلیت نگهداری طولانی پپتید تولید شده در باکتری باسیلوس کواگولانس ATCC 7050 ، آن را کاندید مناسبی برای استفاده در محصولات پروبیوتیک می‌نماید لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14425 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25588	‭BIO microb I ‭17 1402	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی حضور ژن توکسین cry در سویه های بومی باسیلوس تورنجینسیس جدا شده از مناطق کشاورزی اصفهان و بهینه سازی تولید اسپور (1400) / قربانی زواره ، ریحانه، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه قربانی زواره ، ریحانه، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭5 عنوان : بررسی حضور ژن توکسین cry در سویه های بومی باسیلوس تورنجینسیس جدا شده از مناطق کشاورزی اصفهان و بهینه سازی تولید اسپور عنوان موازی : Investigation of the presence of cry toxin gene in native strains of Bacillus thuringiensis isolation from agricultural areas of Isfahan and optimization of spore production ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1400 صفحه شمار: 85ص شابک/شاپا 24660 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته زیست شناسی سلولی و مولکولی گرایش میکروبیولوژی صنعتی شناسه افزوده : میرباقری فیروزآبادی ، مریم السادات، استاد راهنما جلیلی طبایی زواره ، مریم السادات، استاد راهنما امامی ، حمید، استاد مشاور توصیفگرها باسیلوس تورنجینسیس، آفات کشاورزی، توکسین، پروتئین ترشحی  Bacillus thuringiensis, agricultural pests, toxin, secretory protion چکیده : باسیلوس تورنجینسیس باکتری گرم مثبت اسپورزایی است که اصلی¬ترین زیستگاه آن، خاک است و توکسین¬های کریستالی تولید شده آن در مرحله¬ی اسپورزایی برای حشرات سمی، ولی برای انسان غیرسمی است و میکروارگانیسم اصلی مورد استفاده در کنترل بیولوژیکی آفات کشاورزی است. با افزایش تقاضا برای موادغذایی عاری از سموم شیمیایی و با اجرای روش¬های کشاورزی که آسیب کمتری به محیط زیست می¬زند استفاده از سموم گسترش بیشتری یافت. باکتری در مرحله¬ی اسپورزایی،کریستال¬های پروتئینی متشکل از گروه¬های مختلف cry و cyt را ترشح می¬کند. پروتئین¬های cry برای راسته¬ی حشرات شامل Lepidoptera ,Coleoptera ,Hymenoptera ,Diptera و هم¬چنین نماتودها سمی است. از آن¬جا که هر نوع سم cry سازوکار مشخص به عنوان حشره¬کش دارد، معمولا برگونه¬های کمی از یک راسته ویژه تأثیر دارد. باکتری باسیلوس تورنجنسیس عامل بیماری¬زا برای حشرات شامل سموم پروتئینی ترشحی حشره کش (اگزوتوکسین) نیز تولید می¬کند. در این پژوهش از میان 70 نمونه طی غربال¬گری های اولیه با رنگ-آمیزی گرم، رنگ¬آمیزی اسپور و تست¬های بیوشیمیایی 17 نمونه باسیل گرم مثبت اسپوردار بودند. با رنگ-آمیزی کوماسی برلیانت بلو 10 نمونه دارای پروتئین¬های کریستالی بودند. در میان این 10 نمونه، نمونه 1494 و p2 باسیلوس تورنجنسیس حاوی ژن توکسین Gral-cry1 بود. این دو نمونه قدرت اسپورزایی در ملاس به عنوان منبع کربن را دارا بودند. فعالیت بیوتکنولوژیکی بالایی(فعالیت¬های آنزیمی، تولید نانوذره نقره) دارند. دو سویه¬ی 1494 و p2 باسیلوس تورنجینسیس حاوی ژن توکسین Gral-cry1 با قدرت اسپورزایی و رشد بالا در ملاس به عنوان منبع کربن و فعالیت¬های بیوتکنولوژیکی بالایی بودند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13735 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24660	‭BIO microb I ‭5	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی حضور ژن‌های تجزیه کننده ترکیبات نفتی (آلیفاتیک و پلی آروماتیک) در باکتری‌های بومی جدا شده از مناطق نفتی (1404) / احمدیان ، فاطمه، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه احمدیان ، فاطمه، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭29 1404 عنوان : بررسی حضور ژن‌های تجزیه کننده ترکیبات نفتی (آلیفاتیک و پلی آروماتیک) در باکتری‌های بومی جدا شده از مناطق نفتی عنوان موازی : Investigation of the presence of petroleum compounds degrading genes (aliphatic and polyaromatic) in native bacteria isolated from oil regions ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1404 صفحه شمار: 105ص شابک/شاپا 26115 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد: رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : جلیلی ، مریم السادات، استاد راهنما شهیدی ، معصومه سادات، استاد مشاور توصیفگرها ترکیبات نفتی (آلیفاتیک و آروماتیک)، زیست پالایی ، ژن های تجزیه ترکیبات نفتی  Petroleum compounds (aliphatic and aromatic), bioremediation, hydrocarbon-degrading genes چکیده : آلودگی‌های نفتی، به‌ویژه هیدروکربن‌های آلیفاتیک و آروماتیک چندحلقه‌ای (PAHs)، به دلیل پایداری شیمیایی و اثرات زیست‌محیطی، چالشی جدی برای اکوسیستم‌های خاکی و آبی به شمار می‌روند. زیست‌پالایی با استفاده از باکتری‌های بومی به دلیل پایداری و کاهش هزینه‌ها، روشی مؤثر برای پاکسازی این آلودگی‌ها محسوب می‌شود. این مطالعه با هدف بررسی حضور ژن‌های تجزیه‌کننده هیدروکربن‌ها (PAH، ALK2، و ALK3) در باکتری‌های بومی جدا شده از مناطق نفت‌خیز ایران و ارزیابی کارایی آن‌ها در تجزیه نفت خام انجام شد. بدین منظور از خاک‌های آلوده مناطق نفت‌خیز جنوب ایران، 10 نمونه جمع‌آوری و با استفاده از محیط کشت MSM، و با استفاده از روش شیمیوتاکسی، جداسازی و غربالگری باکتری‌های فعال در تجزیه بنزن، تولوئن، زایلن، و نفت خام انجام شد. پس از خالص سازی جدایه ها، ویژگی‌های مورفولوژیکی (شکل کلنی، رنگ‌آمیزی گرم، و آرایش میکروسکوپی باکتری‌ها) ، و نیز قابلیت رشد سویه‌ها در محیط MSM حاوی 1٪ نفت خام بررسی شد. سپس حضور ژن‌های PAH، ALK2، و ALK3، با استفاده از پرایمرهای PAH-RHD-396F ، PAH-RHD-696R ، R13981-21 (ALK-2F) ، (ALK-2R)R13981-22 ،(ALK-3F) R13981-19،R13981-20(ALK-3R) ارزیابی شد. رشد سویه‌ها در محیط MSM حاوی 1٪ نفت خام با اسپکتروفتومتری (OD600) و کاهش هیدروکربن‌ها با GC-MS ارزیابی شد. از 50 سویه جداسازی‌شده، 25 سویه توانایی شیمیوتاکسی به هیدروکربن‌ها و رشد در محیط حاوی 1% نفت خام را نشان دادند. اکثریت سویه های جداسازی شده باکتری‌های گرم مثبت بودند.بررس حضور ژن های اختصاصی تجزیه هیدروکربن ها در سویه های جدا شده و سویه های موجود در کلکسیون دانشگاه اشرفی نشان داد که ژن PAH در 20٪ ایزوله‌های بومی و 64٪ سویه‌های کلکسیونی، و ژن ALK3 در 40٪ ایزوله‌ها وجود دارد، اما ژن ALK2 در ایزوله‌های بومی مشاهده نشد و تنها در 3 سویه‌ی موجود در کلکسیون (جدایه های G2، M2 و K) وجود داشت. سویه 9 بیشترین رشد در محیط حاوی نفت خام بعنوان تنها منبع کربن (افزایش OD600 از 0.011 به 1.913) را نشان داد. آنالیز GC-MS، کاهش قابل توجه پیک‌های PAH(نفتالین، فننترن) را در نمونه‌های تیمارشده در مقایسه با شاهد تأیید کرد. بیشترین میزان تجزیه در نمونه شماره 9 مربوط به پارامتر فلورن (Fluorene) با مقدار 9/96 درصد بوده است، در حالی‌که کمترین میزان تجزیه در این نمونه مربوط به بنزو(a)آنتراسن (Benzo[a]anthracene) با مقدار 4/75 درصد می‌باشد. بیشترین مواد حذف شده بعد از فلورن توسط این باکتری، فنانترن (5/96%)، Benz(a)anthracene (3/96%)، پیرن (95%)، و اسنفتالن (5/94%) بودند. در نمونه 1A* نیز بیشترین تجزیه مربوط به فنانتـرن (Phenanthrene) با مقدار 5/95 درصد و کمترین آن مربوط به بنزو(b)فلورانتن (Benzo[b]fluoranthene) با مقدار 6/79 درصد بوده است. رتبه های بعدی مربوط به آنتراسن(27/95%)، فلورن (95%)، Benz(a)anthracene (9/94%)،پیرن (94%)، فلورانتن (94%)، و نفتالن(6/93%) بودند. سایر ترکیبات هم با راندمان خوبی در مورد هر دو باکتری (بالای 75 درصد) حذف شدند. نتیجه‌گیری: باکتری‌های بومی مناطق نفت‌خیز ایران، به‌ویژه سویه 9 بررسی شده در این پژوهش، پتانسیل بالایی برای زیست‌پالایی آلودگی‌های نفتی دارند، که با حضور ژن‌های PAH و ALK3 و تجزیه بالای 90 درصد بسیاری از ترکیبات پلی هیدروکسی آروماتیک موجود در نفت خام تأیید شد. این یافته‌ها پایه‌ای برای کاربردهای میدانی زیست‌پالایی در مناطق آلوده به نفت ایران پس از بررسی‌های بیشتر در خاک‌های آلوده فراهم می‌کنند لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14951 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
26115	‭BIO microb I ‭29 1404	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بررسی کنترل رشد قارچ ساپروفیت توسط باسیلوس ها و سینرژیسم اثر آنها با ایزوفلانویید (1403) / ریش سفید ، مریم، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه ریش سفید ، مریم، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭20 1403 عنوان : بررسی کنترل رشد قارچ ساپروفیت توسط باسیلوس ها و سینرژیسم اثر آنها با ایزوفلانویید عنوان موازی : Investigation of the control of saprophytic fungi growth by Bacilli and the synergistic effect of their interaction with isoflavonoids ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 80ص شابک/شاپا 25851 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : جلیلی ، مریم السادات، استاد راهنما امتیازی ، گیتی، استاد راهنما توصیفگرها پپتید ضد قارچی، باسیلوس، مایکوتوکسین، آلودگی قارچی  Antifungal peptide, Bacillus, mycotoxin, fungal contamination لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14687 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25851	‭BIO microb I ‭20 1403	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بهینه سازی تولید لاکاز از آرکی جداسازی شده بومی و بررسی کاربرد آن در پیل سوختی میکروبی (1404) / محمدپور ، پریا، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه محمدپور ، پریا، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭26 1404 عنوان : بهینه سازی تولید لاکاز از آرکی جداسازی شده بومی و بررسی کاربرد آن در پیل سوختی میکروبی عنوان موازی : Optimization of Laccase Production from Native Isolated Archaea and Investigation of Its Application in Microbial Fuel Cell ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1404 صفحه شمار: 127ص شابک/شاپا 26063 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : عباسی ، سهیلا، استاد راهنما امتیازی ، گیتی، استاد مشاور توصیفگرها لاكاز، پيل سوختي ميكروبي، هالوموناس ليتوپنايي، نمک دی آمونیوم ۲،۲′-آزینو بیس، كوير لوت و اكستريموزيم  Laccase, Microbial Fuel Cell, Halomonas litopenaei, 2,2′-Azinobis diammonium salt, Lut Desert, and Extremozyme چکیده : لاکازها، اکسیدازهایی هستند که اکسیداسیون سوبستراهای فنلی و غیرفنلی را همزمان با کاهشO2 به H2o کاتالیز می‌کنند و می‌توانند به عنوان یک بیوکاتالیست در سیستم‌های بیوالکتروشیمیایی مانند پیل سوختی میکروبی استفاده شوند. در این مطالعه جداسازی و غربالگری سویه‌ی آرکیایی هالوفیل مولد لاکاز بر اساس بیشترین فعالیت آنزیم لاکاز به واسطه نمک دی آمونیوم 2،2′-آزینو بیس در طول موج 420 نانومتر و بررسی مقاومت به کلرامفنیکل و حساسیت به آنیزومایسین، صورت گرفت و در مراحل بعدی شرایط فیزیکی و عوامل شیمیایی موثر در رشد، بهینه سازی شدند و لاکاز میکروبی به عنوان گلیکوپروتئین با اتانول خالص سازی نسبی شد. در بخش دوم، سازه تانک و غشای تبادل کننده یون ساخته شد و فعالیت آنزیم جدایه‌ی برتر به عنوان بیوکاتد، در پیل سوختی میکروبی دو محفظه‌ای در دو حالت جدایه‌ی برتر به تنهایی و کنسرسیوم جدایه و قارچ مولد لاکاز، مورد بررسی قرار گرفت. در پایان شناسایی مولکولی و تعیین خصوصیات بیوشیمیایی جدایه منتخب انجام شد. جدایهT26 (کویر لوت) به عنوان یک سویه‌‌ی آرکیای هالوفیل مولد لاکاز، با بیشترین فعالیت آنزیمی(31/29 واحد بر میلی‌لیتر در ساعت) انتخاب شد. بررسی نتایج حاصل از بهینه سازی جدایه برتر نشان داد که بهترین شرایط فعالیت آنزیم در محیطی با غلظت 5/12% سدیم کلرید، ملاس چغندر(منبع کربن)، نیترات کلسیم (منبع نیتروژن مازاد)، هوادهی 90rpm، دمای 35℃ و 8/10pH برقرار بود. با توجه به اسمیر ایجاد شده در ژل، وزن تقریبی آنزیم تغلیظ شده حدود 75 کیلودالتون بود و با ارزیابی انجام شده فعالیت آنزیم در پیل سوختی هنگامی که کنسرسیوم باکتری و قارچ مولد لاکاز استفاده شد، در مدت زمان بیشتر، پایدارتر بود و میانگین ولتاژ بیشتری (129V/0) تولید شد. جدایه منتخب، هالوموناس لیتوپنایی، شناسایی شد. لاکاز میکروبی به عنوان بیوکاتد در پیل سوختی نقش داشته و با انتخاب آن به عنوان یک اکستریموزیم ‌هالوفیل، امکان استفاده از بیوکاتالیست پایدارتر در زمینه‌های صنعتی گوناگون فراهم خواهد شد لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14899 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
26063	‭BIO microb I ‭26 1404	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

بهینه¬سازی تولید پیگمان از آرکیای هالوفیل بومی و بررسی خصوصیات کاربردی آن (1403) / بهروزی ، میلاد، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه بهروزی ، میلاد، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭23 1403 عنوان : بهینه¬سازی تولید پیگمان از آرکیای هالوفیل بومی و بررسی خصوصیات کاربردی آن عنوان موازی : Optimizing Pigment Production from Native Halophilic Archaea and Investigating its Functional Properties ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1403 صفحه شمار: 97ص شابک/شاپا 25854 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش صنعتی شناسه افزوده : جلیلی ، مریم السادات، استاد راهنما امتیازی ، گیتی، استاد مشاور توصیفگرها رنگدانه، هالوآرکیا، کاروتنوئید، آنتی¬اکسیدان، ضد باکتری  : Pigments, haloarchaea, carotenoid, antioxidant, antibacterial چکیده : آرکیای هالوفیل پتانسیل بالایی برای کشف ترکیبات جدید با پتانسیل بیوتکنولوژی بالا داراهستند که یکی از این ترکیبات، کاروتنوئیدها می‌باشند. در این مطالعه مجموعه‌‌‌ای از 23 جدایه آرکیای بسیار هالوفیل بومی از زیستگاه‌های نمکی متمایز در مناطق مختلف ایران جدا شد. ازبین جدایه‌های مورد بررسی، جدایه‌هایی که در مدت یک هفته کلنی رنگی تولید کرده بودند، جهت استخراج و اندازه‌گیری میزان رنگدانه تولید شده با حلال‌های مختلف متانول، استون، هگزان، اترنفت و اتانول با روش جذب اسپکتروفتومتری مورد بررسی فراتر قرار گرفتند و سویه هالوفراکس مدیترانه‌ای به عنوان سویه برتر انتخاب شد. به منظور بررسی و تعیین ساختار رنگدانه کاروتنوئیدی سویه هالوفراکس مدیترانه‌ای از روش‌های اسپکتروسکوپی UV، TLC، FT-IR، LC-MS استفاده گردید. خاصیت آنتی‌اکسیدانی و خاصیت ضد میکروبی آن بررسی شد. همچنین اثر سمیت کاروتنوئید تولید شده بر روی سلول‌های سرطانی ملانوما و سلول‌های فیبروبلاست انسانی مورد مطالعه قرار گرفت. طبق نتایج به دست آمده از غربال‌گری سویه‌ها بهترین حلال متانول و بهترین جذب (239/0)در طول موج 498 نانومتر مربوط به سویه هالوفراکس مدیترانه‌ای ASFM403 بود. اطلاعات جذب نوری رنگدانه، نشان دهنده شباهت ساختمانی این کاروتنوئید با باکتریوروبرین است. اطلاعات به دست آمده از شناسایی کاروتنوئید با TLC، FT-IR و LC-MS نیز نشان می‌دهد که باکتریوروبرین کاروتنوئید غالب می‌باشد. فعالیت آنتی‌اکسیدانی کاروتنوئید به دست آمده در غلظت 5 میکروگرم در میلی لیتر به 83 درصد رسید که از اسید آسکوربیک به عنوان استاندارد بالاتر بود و اثر ضد باکتری قابل توجهی در برابر باکتری های بیماری‌زای Staphylococcus aureus PTCC 1112 با قطر هاله عدم رشد 10 mm ، Escherichia coli PTCC 1398 با قطر هالع عدم رشد 15mm ، Enterococcus faecalis PTCC 1394 با قطر هاله عدم رشد 18mm ، Pseudomonas aeruginosa PTCC 1565 با قطر هاله عدم رشد 10mm ، Listeria monocytogenes ATCC 7644.با قطر هاله عدم رشد 20mm نشان داد. همچنین در غلظت 10 و 50 میکروگرم در میلی لیتر اثر سمیت بر روی سلول‌های سرطانی رده ملانوما دارد. درحالی که، به رشد سلول‌های فیبروبلاست کمک می‌کند. در نتیجه بررسی تولید کاروتنوئید به دست آمده از سویه هالوفراکس مدیترانه‌ای ASFM403 نشان می‌دهد که این سویه می‌تواند به عنوان یک منبع بالقوه برای تولید کاروتنوئیدی که خاصیت ضد باکتری و فعالیت آنتی اکسیدانی بالایی دارد و در ضمن اثر مثبت روی رشد سلول‌های انسانی و اثر سمی بر روی سلول‌های سرطانی ملانوما در غلظتی خاص دارد، در نظر گرفته شود لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=14690 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
25854	‭BIO microb I ‭23 1403	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت

تجزیه هیدروکربن اکتادکان توسط بهترین باکتری های جداشده از خاک آلوده به نفت و لجن نفتی منطقه بهرگان و بررسی میزان تجزیه اکتادکان در حضور و عدم حضور نانوذرات Fe3O4 (1401) / موگویی ، غزاله، نویسنده

نوع مدرک: متون چاپی سرشناسه موگویی ، غزاله، نویسنده شماره بازیابی : ‭BIO microb I ‭13 عنوان : تجزیه هیدروکربن اکتادکان توسط بهترین باکتری های جداشده از خاک آلوده به نفت و لجن نفتی منطقه بهرگان و بررسی میزان تجزیه اکتادکان در حضور و عدم حضور نانوذرات Fe3O4 عنوان موازی : Decomposition of octadecane hydrocarbon by the best bacteria isolated from oil-contaminated soil and oil sludge in Behrgan region and investigation of octadecane decomposition in the presence and absence of Fe3O4 nanoparticles ناشر: دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی: اصفهان سال نشر : 1401 صفحه شمار: 49ص شابک/شاپا 24929 یادداشت پایان نامه کارشناسی ارشد :رشته میکروبیولوژی گرایش میکروب های صنعتی شناسه افزوده : شهیدی ، معصومه سادات، استاد راهنما جلیلی طبایی ، مریم السادات، استاد مشاور توصیفگرها لجن نفتی، اکتادکان، تجزیه زیستی  oil sludge, octadecane, biodegradation چکیده : هیدروکربن اکتادکان از هیدروکربنهای آلیفاتیک چند حلقهای متشکل از دو حقله بنزن. گروهی از آالینده های محیطی است. به علت پایداری باال در محیط زیست و سمیت باالی آن محققان بر صدد تجزیه به روشهای مختلف در مناطق آلوده نفتی برآمدهاند. هدف از این مطالعه تجزیه اکتادکان توسط بهترین باکتریهای جدا شده از خاک آلوده و لجن نفتی در منطقه بهرگان و بررسی میزان تجزیه اکتادکان در حضور و عدم حضور نانوذرات 4o3Fe میباشد. به این منظور از لجن نفتی مناطق آلوده منطقه بهرگان واقع در خلیج فارس ایران 5 نمونه خاک و لجن جمع آوری شد. سپس نمونهها در محیط کشت پایه معدنی حاوی نفت خام کشت داده شد و پس از مراحل غنی سازی، جداسازی و خالص سازی بهترین باکتری تجزیه کننده هیدروکربنهای نفتی جداسازی و انتخاب، گردید. سویه 2H بیشترین میزان رشد در حضور اکتادکان را نشان داد سپس تجزیه اکتادکان در حضور سویه جداسازی شده و تجزیه اکتادکان در حضور سویه جدا شده و نانوذرات 4O3Feدر کنار نمونه شاهد از طریق آنالیز HPLC مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که باکتری جدا شده قادر به تجزیه اکتادکان است و در حضور نانوذرات 4o3Fe به مقدار کمی میزان تجزیه افزایش داده شده است. میتوان نتیجه گرفت اگر چه نانوذره 4o3Fe میزان تجزیه اکتادکان را به میزان قابل توجهی افزایش نداده است اما حضور آن در کنار باکتری میتواند سرعت تجزیه را بهبود ببخشد. این سویه بر اساس نتایج رنگ آمیزی و تستهای بیوشیمیایی باکتری انتخاب شده سودوموناس بود. در نهایت سویه جدا شده در این مطالعه که با توالی یابی ژن rRNA s16 شناسایی شد و با احتمال 99 درصد به سویه باکتری سودوموناس آئروژینوزا شباهت داشت لینک ثابت رکورد: ../opac/index.php?lvl=record_display&id=13962 زبان مدرک : فارسی

 فهرست موجودی مدرک

شماره ثبت	شماره بازیابی	نام عام مواد	محل نگهداری	بخش	وضعیت ثبت	وضعیت امانت
24929	‭BIO microb I ‭13	پایان‌نامه	دانشگاه شهید اشرفی اصفهانی	مرکزی	اسناد مرجع	غیر قابل امانت